| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 1,591,711 | C→A | E156* (GAG→TAG) | hipA ← | serine/threonine‑protein kinase toxin HipA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,591,711 | 0 | C | A | 98.9% | 319.1 / ‑6.3 | 92 | E156* (GAG→TAG) | hipA | serine/threonine‑protein kinase toxin HipA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (54/37); total (55/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ATCCTCCTGTGGCAAGCGAAGTAAAACCGTTCGCTCAGCATTCCAACGCCTGTCAAAACGTTCGACCGCTAACGCGCGCACATTTCCCGCTTTAATGATTTCTGCGTCCGGAACATTCAACCCAAGTTCTTTCGCCAGCAGCAGACAGTAATACTCATTATCAACGCTTTGGCTGAGATCGAGCGTCGCATTGGGCTGCCTGATTTCGCCAATCGGTAATTTAATGATGTGCGTCGTCGGCGTTATTCCTTTCGGAATGCACCAGTCATTGCCTATTCTGAGCAGTGCTGTCTTCTCCTGTGCGCCAGCAACCGAGATGCGAAAGTCATTTTCTTCTCTAATCATGCCTAGCGGGATATCTGCTTTATAAGCCGTTAATACTTCTTCAAGTCTGGCTTCAGTAAGCTTTTCCCATGCCATTATCGGATGCGTTACGGTTTCGTCTTCGGGTATTAACGTCACGGCACCAACGCTGTCTCGCCCTATTTCTGACAATAAATCAAACGGTTGTCTGGATTTGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAGTTAAA > NC_000913/1591415‑1592005 | atCCTCCTGTGGCAAGCGAAGTAAAACCGTTCGCTCAGCATTCCAACGCCTGTCNAAACGTTCGACCGCTAACGCGCGCACATTTCCCGCTTGAATGATTTCTGCGTCCGGAACATTCAACCCAAGTTCTTTCGCCAGCAGCAGACAGTAATACTCATTATCAACGCTTTGGCTGAGATCGAGCGTCGCATTGGGCTGCCTGATTTCGCCAATCGGTAATTTAATGATGTGCGTCGTCGGCGTTATTCCTTTCGGAATGCACCAGTCATTGCCTATTCTGAGCAGTGCTGTCTTCTACtg < 2:599643/300‑1 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |