| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 1,471,130 | G→A | pseudogene (612/3495 nt) | ydbA → | putative outer membrane protein, N‑terminal fragment |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,471,130 | 0 | G | A | 98.1% | 361.8 / NA | 106 | pseudogene (612/3495 nt) | ydbA | putative outer membrane protein, N‑terminal fragment |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); major base A (48/54); minor base C (2/0); total (52/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.29e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
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ttattaACCAGGGAACGATTAACCTCGAAAAAAA‑TGGTAATTATGACGATAGTCTGGCAGCAAATACTCTGGTAGGGATGGCTGTTTATGAGCATGGTACTGCTATCAACGACCAGACGGGTGTTATCAATATCAATGTTGGTACTGGTCAGGCGTTTTATAACGATGGCACAGGAACAATTGTTAACTATGGTACAATCTGCACTTTCGGCGTGTGCCAATCGGGGAATGAGTACAATAATACAGATGATTTCACCTCACTGATCTATACCGGTGGCGATACGATTACACGAAGCGgag > 1:424892/1‑300 (MQ=255) tattaACCAGGGAACGATTAACCTCGAAAAAAA‑TGGTAATTATGACGATAGTCTGGCAGCAAATACTCTGGTAGGGATGGCTGTTTATGAGCATGGTACTGCTATCAACGACCAGACGGGTGTTATCAATATCAATGTTGGTACTGGTCAGGCGTTTTATAACGATGGCACAGGAACAATTGTTAACTATGGTACAATCTGCACTTTCGGCGTGTGCCAATCGGGGAATGAGTACAATAATACAGATGATTTCACCTCACTGATCTATACCGGTGGCGATACGATTACACGAAGCGgaga > 2:457820/1‑300 (MQ=255) acccAGGGAACGATTAACCTCGAAAAAAA‑TGGTAATTATGACGATAGTCTGGCAGCAAATACTCTGGTAGGGATGGCTGTTTATGAGCATGGTACTGCTATCAACGACCAGACGGGTGTTATCAATATCAATGTTGGTACTGGTCAGGCGTTTTATAACGATGGCACAGGAACAATTGTTAACTATGGTACAATCTGCACTTTCGGCGTGTGCCAATCGGGGAATGAGTACCATAATACAGATGATTTCACCTCACTGATCTATACCGGTGGCGCTACGATTACACGAAGCGGAGAAACt > 1:509089/3‑300 (MQ=255) | GTATGGTCGTGGTAGTGTCGGCATGCTTGCTATAGCAGATTCAACAGCAGAAAATCAGGGTAAAATTACACTGGATTCTATGTGGGTAGATGCAAATGACACTACCGCAATGCGAGATATAGCTAGCAACAGCGCCATTGACTTCGGTACAGGTGTGGGAGTTGGTACTGATAGTTATAGTGGTGCAGGGAAAAATGCAACAGCAATTAACCAATTGGGCGGTGTTATAACTATTTATAACGCCGGCGCAGGTATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCGAAAAAAA‑TGGTAATTATGACGATAGTCTGGCAGCAAATACTCTGGTAGGGATGGCTGTTTATGAGCATGGTACTGCTATCAACGACCAGACGGGTGTTATCAATATCAATGTTGGTACTGGTCAGGCGTTTTATAACGATGGCACAGGAACAATTGTTAACTATGGTACAATCTGCACTTTCGGCGTGTGCCAATCGGGGAATGAGTACAATAATACAGATGATTTCACCTCACTGATCTATACCGGTGGCGATACGATTACACGAAGCGGAGAAACT > NC_000913/1470836‑1471421 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |