Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,454,889 | C→T | G241S (GGT→AGT) | fbp ← | fructose‑1,6‑bisphosphatase 1 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,454,889 | 0 | C | T | 99.2% | 421.1 / NA | 121 | G241S (GGT→AGT) | fbp | fructose‑1,6‑bisphosphatase 1 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (52/68); minor base G (0/1); total (52/69) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
TGGAGAGGCGCAGGAGATTACGCGTCCGGGAACTCACGGATAAAGCGTTCGACATCTTCAACCATATGGTCGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTGGCAGAATTTAATGTACTTCTTCACCCCGTTCGGAAACTTAATGTAGTTTCCTTCGTTGATGGAGTAGGTTTTGCCTTTCTCCGGGAAGCGCATCCGTTCCTGGCACAGGCAGAAAACGCCGAGCGAAGGATCGTAAGTAAAGGCGTGAACACCGCATCCGGTGGTGTAAACCAGCATGGT‑AGAGGAGCCGTATACCACGTAACCTGCCGCAACCTGTTTGTTACCAGGCTGGAGGA > NC_000913/4454594‑4455173 | tgGAGAGGCGCAGGAGATTACGCGTCCGGGAACTCACGGATAAAGCGTTCGACATCTTCAACCATATGGTCGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACTGata < 1:14872/300‑1 (MQ=255) agagGCGCAGTAGATTACACGTCCGGGAACTCACGGATAAAGCGTTCGACATCTTCAACCATATGGTCGTTGCCTACAAAGAATGAACTGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTNTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACTGATATaa < 2:206123/300‑1 (MQ=255) agagGCGCAGGAGATTACGCGTCCGGGAACTCACGGATAAGGCGTTCGACATCTTCAACCATATGGTCATTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCATGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACTGATATaa < 2:690602/300‑1 (MQ=255) agGCGCAGGAGGTGACGCGTCCGGGAGCTTACGGATAAAGTGTTCGACATCTTCAACCATATGGTCGTTGCCGACAAAGACTGCACGTCGCTGGTGCAGAGTTTCCTGGATAATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCATGAATGCCATCGGGGTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTTGCTGGCGGTGCTTGGTTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACTGATATAACg < 2:53099/300‑1 (MQ=255) 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ggTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACTGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTGGCAGAATTTAATGTACTTCTTCACCCCGTTCGGAAACTTAATGTAGTTTCCTTCGTTGATGGAGTAGGTTTTGCCTTTCTCCGGGAAGCGCATCCGTTCCTGGCACAGGCAGAAAACGCCGAGCGAAGGATCGTAAGTAAAGGCGTGAACACCGCATCCGGTGGTGTAAACCAGCATGGT‑AGAGGAGCCGTATACCACGTAACCTGCCGCAACCtgtttgt > 1:233064/1‑300 (MQ=255) gTGGAAATCCGCGACCAGTGAACTGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTGGCAGAATTTAATGTACTTCTTCACCCCGTTCGGAAACTTAATGTAGTTTCCTTCGTTGATGGAGTAGGTTTTGCCTTTCTCCGGGAAGCGCATCCGTTCCTGGCACAGGCAGAAAACGCCGAGCGAAGGATCGTAAGTAAAGGCGTGAACACCGCATCCGGTGGTGTAAACCAGCATGGT‑AGAGGAGCCGTATACCACGTAACCTGCCGCAACCTGTTTGTTACCAgg > 1:603414/1‑300 (MQ=255) tGGAAATCCGCGACCAGTGAACTGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTTGCAGAATTTAATGTACTTCTTCACCCCGTTCGGAAACTTAATGTAGTTTCCTTCGTTGATGGAGTAGGTTTTGCCTTTCTCCGGGAAGCGCATCCGTTCCTGGCACAGGCAGAAAACGCCGAGCGAAGGATCGTAAGTAAAGGCGTGAACACCGCATCCGGTGGTGTAAACCAGCATGGT‑AGAGGAGCCGTATACCACGTAACCTGCCGCAACCTGTTTGTTACCAGGc < 2:684954/300‑1 (MQ=255) 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TGGAGAGGCGCAGGAGATTACGCGTCCGGGAACTCACGGATAAAGCGTTCGACATCTTCAACCATATGGTCGTTGCCGACAAAGAATGAACGGCGCTGGTGCAGGGTTTCCGGGATGATATCCAGAATACGCTCTTTGCCATCGCTCGCTTTACCGCCCGCTTGTTCCGCCAGGAATGCCATCGGGTTGCACTCATACAGCAAACGCAGTTTGCCGTCCGGGTGGCTGGCGGTGCTTGGGTAGAGATAAATACCGCCTTTCAGCAGGTTACGGTGGAAATCCGCGACCAGTGAACCGATATAACGTGAGGTATAAGGGCGGTTGGTGGATTTATCTTCTTCCTGGCAGAATTTAATGTACTTCTTCACCCCGTTCGGAAACTTAATGTAGTTTCCTTCGTTGATGGAGTAGGTTTTGCCTTTCTCCGGGAAGCGCATCCGTTCCTGGCACAGGCAGAAAACGCCGAGCGAAGGATCGTAAGTAAAGGCGTGAACACCGCATCCGGTGGTGTAAACCAGCATGGT‑AGAGGAGCCGTATACCACGTAACCTGCCGCAACCTGTTTGTTACCAGGCTGGAGGA > NC_000913/4454594‑4455173 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |