Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,439,373 | 0 | C | T | 99.4% | 614.5 / NA | 168 | intergenic (‑111/‑214) | ytfJ/ytfK | PF09695 family protein YtfJ/stringent response modulator YtfK |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
CGCACTTTTCCCACTAACTGCGCGCTGTTCCAGGTTTTGTAGCTAAACTGATCTTTATCAAGCACCAACTCGCCCCGATCGGTAATGCCAATCGGCGGCACTCGCTGACCGGTTTCGAACTGATGTGCGGAAGCCATCATCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGATATGCAGGTGATCCGACCACTTGGGTCTGAGTTTTAATCATATGTGCTATTTATCGAATTTCCCGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATTGTGGCACCGCACAGGCGTAATACTCAGCAGGAGATAACAATGAAAATTTTCCAACGGTACAACCCACTTCAGGTGGCGAAGTACGTAAAGATCCTGTTCCGTGGACGGTTATACATCAAG > NC_000913/4439078‑4439667 | aCTTTTCCCACTAACTGCGCGCTGTTCCAGGTTTTGTAGCTAAACTGATCTTTATCAAGCACCAACTCGCCCCGATCGGTAATGCCAATCGGCGGCACTCGCTGACCGTTTTCGAACTGATGTGCGGAAGCCATCATCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGATATGCAGGTGATCCGACCACTTGGGTCTGAGTTTTAATCATATGTGCTATTTATCGAATTTCCCGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGTGCACaaa < 2:175114/300‑1 (MQ=255) 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CGCACTTTTCCCACTAACTGCGCGCTGTTCCAGGTTTTGTAGCTAAACTGATCTTTATCAAGCACCAACTCGCCCCGATCGGTAATGCCAATCGGCGGCACTCGCTGACCGGTTTCGAACTGATGTGCGGAAGCCATCATCGGCAACAGCAGGCAGGTGAGTGCCAGAATCTTGCGTAGGGTCATGGTGTTTCCTTCTTATGATATGCAGGTGATCCGACCACTTGGGTCTGAGTTTTAATCATATGTGCTATTTATCGAATTTCCCGCAAGTGTGATGCCAGTTTGCGGTCAAGCGCACAAATCATATGAAAAATGAATGCTTATACTGAAGACCGCGCTTCGGTAAAAAGATAATTCTGAATAATTGTAACCTTTAGGTAAAAAAAGTTATACGCGGTGGAAACATTGCCCGGATAGTCTATAGTCACTAAGCATTAAAATTTGCGCCTCATAATAGTTGGGCCGATTGTGGCACCGCACAGGCGTAATACTCAGCAGGAGATAACAATGAAAATTTTCCAACGGTACAACCCACTTCAGGTGGCGAAGTACGTAAAGATCCTGTTCCGTGGACGGTTATACATCAAG > NC_000913/4439078‑4439667 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |