Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,437,529 | C→T | intergenic (+34/‑178) | cysQ → / → ytfI | 3'(2'),5'‑bisphosphate nucleotidase/protein YtfI |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,437,529 | 0 | C | T | 99.3% | 500.2 / NA | 137 | intergenic (+34/‑178) | cysQ/ytfI | 3'(2'),5'‑bisphosphate nucleotidase/protein YtfI |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (90/46); minor base G (0/1); total (90/47) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.43e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
GAGCTGAAAGAGTATCTGCAACAGCTTGGCGAACATCAGACCACGTCCATCGGCTCTTCGCTGAAATTCTGCCTGGTGGCGGAAGGACAGGCGCAGCTGTACCCGCGCTTCGGACCAACGAATATTTGGGACACCGCCGCTGGACATGCTGTAGCTGCAGCTGCCGGAGCGCACGTTCACGACTGGCAGGGTAAACCGCTGGATTACACTCCGCGTGAGTCGTTCCTGAATCCGGGGTTCAGAGTGTCTATTTACTAAATTCAGATGGCAGAAACAGTGTATTTCCTGATTCTGCCATCCTGATTTCTCCCAACCTAAAAAGTTATAAATAAAAAGAGATTGTATTTAAAGTGCAAAAATTCAATTGCTAATAAGTTACATTTTAATAATGAGCGTTTTTTGATAGTTTACTTCTATAGTGAGATATTTAATGGCGACATAAAGTAACCAAATAAAATAAGGTTGTCATATGTTACCCAGGATCAGACACAATAATTTTATTGGTGCGGTGGAGTTATTTGTAAAGTCTTCGTATACAAAAACACATTCAAACAATTTTTTTAACAACATCCATCATGCATTTAAG > NC_000913/4437238‑4437823 | gaGCTGAAAGAGTATCTGCAACAGCTTGGCGAACATCAGACCACGTCCATCGGCTCTTCGCTGAAATTCTGCCTGGTGGCGGAAGGACAGGCGCAGCTGTACCCGCGCTTCGGACCAACGAATATTTGGGACACCGCCGCTGGACATGCTGTAGCTGCAGCTGCCGGAGCGCACGTTCACGACTGGCAGGGTAAACCGCTGGATTACACTCCGCGTGAGTCGTTCCTGAATCCGGGGTTCAGAGTGTCTATTTACTAAATTCAGATGGCAGAAACAGTGTATTTCCTGATTTTGCCATcc > 1:389594/1‑300 (MQ=255) gCTGAAAGAGTATCTGCAACAGCTTGGCGAACATCAGACCACGTCCATCGGCTCTTCGCTGAAATTCTGCCTGGTGGCGGAAGGACAGGCGCAGCTGTACCCGCGCTTCGGACCAACGAATATTTGGGACACCGCCGCTGGACATGCTGTAGCTGCAGCTGCCGGAGCGCACGTTCACGACTGGCAGGGTAAACCGCTGGATTACACTCCGCGTGAGTCGTTCCTGAATCCGGGGTTCAGAGTGTCTATTTACTAAATTCAGATGGCAGAAACAGTGTATTTCCTGATTTTGCCATCCTg > 1:40923/1‑300 (MQ=255) gAAAGAGTATCTGCAACAGCTTGGCGAACATCAGACCACGTCCATCGGGTCTTCGCTGAAATTCTGCCTGGTGGCGGAAGGACAGGCGCAGCTGTACCCGCGCTTCGGACCAACGAATATTTGGGACACCGCCGCTGGACATGCTGTANCTGCAGCTGCCGGAGCGCACGTTCACNACTGGCAGGGTAAACCGCTGGATTACACTCCGCGTGAGTCGTTCCTGAATCCGGGGTTCAGAGTGTCTATTTACTAAATTCAGATGGCAGAAACAGTGTATTTCCTGATTTTGCCATCCTGAtt < 2:530487/300‑1 (MQ=255) gAAAGAGTATCTGCAACAGCTTGGCGAACATCAGACCACGTCCATCGGCTCTTCGCTGAAATTCTGCCTGGTGGCGGAAGGACAGGCGCAGCTGTACCCGCGCTTCGGACCAACGAATATTTGGGACACCGCCGCTGGACATGCTGTAGCTGCAGCTGCCGGAGCGCACGTTCACGACTGGCAGGGTAAACCGCTGGATTACACTCCGCGTGAGTCGTTCCTGAATCCGGGGTTCAGAGTGTCTATTTACTAAATTCAGATGGCAGAAACAGTGTATTTCCTGATTTTGCCATCCTGAtt < 1:534621/300‑1 (MQ=255) 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GAGCTGAAAGAGTATCTGCAACAGCTTGGCGAACATCAGACCACGTCCATCGGCTCTTCGCTGAAATTCTGCCTGGTGGCGGAAGGACAGGCGCAGCTGTACCCGCGCTTCGGACCAACGAATATTTGGGACACCGCCGCTGGACATGCTGTAGCTGCAGCTGCCGGAGCGCACGTTCACGACTGGCAGGGTAAACCGCTGGATTACACTCCGCGTGAGTCGTTCCTGAATCCGGGGTTCAGAGTGTCTATTTACTAAATTCAGATGGCAGAAACAGTGTATTTCCTGATTCTGCCATCCTGATTTCTCCCAACCTAAAAAGTTATAAATAAAAAGAGATTGTATTTAAAGTGCAAAAATTCAATTGCTAATAAGTTACATTTTAATAATGAGCGTTTTTTGATAGTTTACTTCTATAGTGAGATATTTAATGGCGACATAAAGTAACCAAATAAAATAAGGTTGTCATATGTTACCCAGGATCAGACACAATAATTTTATTGGTGCGGTGGAGTTATTTGTAAAGTCTTCGTATACAAAAACACATTCAAACAATTTTTTTAACAACATCCATCATGCATTTAAG > NC_000913/4437238‑4437823 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |