| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,696,355 | C→T | intergenic (‑170/‑103) | yhjR ← / → bcsE | PF10945 family protein YhjR/c‑di‑GMP‑binding protein BcsE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,696,355 | 0 | C | T | 99.5% | 686.4 / NA | 185 | intergenic (‑170/‑103) | yhjR/bcsE | PF10945 family protein YhjR/c‑di‑GMP‑binding protein BcsE |
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Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
CGTTGGGAAATATCGGCATAATCAATATCAGGCAGTGAAAATGCCTGCTTTAACGCCACAATATCATTCTGGAAGATATAGCCTATCGCGGGATCAGGCAGAGTATCTGGTTCATTGTTATTCATTTTGCTTGATCCCTATGAAATAACCGTACCGTTCATGAGACAATTCTAACCGTGAGCATTTCGCCGGTTTATTGTTTACGGCGAGACGGGAATTTGCTCACTTTTTGACTTTCCGTTACGCAACAGAAAAAGTTAAAAACGAAAAGACTAAAATCACACGTCTTGTGACCTTCTAAATTGATTCACATGCTAAATCTGATAAGTTTTAATTTCAATGGTAGGTTTATTTCTTAGCTTTCGCTAGTAAACTGATAATCAGACAAAATGGTGACATGAGGGACATTGTGGACCCTGTATTCTCTATCGGTATCTCATCATTATGGGATGAGCTGCGACATATGCCAGCAGGCGGCGTCTGGTGGTTTAACGTCGATCGCCATGAAGATGCTATCAGTCTGGCGAATCAAACAATTGCATCCCAGGCTGAAACCGCACACGTCGCGGTCATTAGCATGGACAGCGA > NC_000913/3696061‑3696648 | tggtaaaTATCGGCATAATCAATATCAGGCAGTGAAAATGCCTGCTTTAACGCCACAATATCATTCTGGAAGATATAGCCTATCGCGGGATCAGGCAGAGTATCTGGTTCATTGTTATTCATTTTGCTTGATCCCTATTAAATAACCGTACCGTTCATGAGACAATTCTAACCGTGAGCATTTCGCCGGTTTATTGTTTACGGCGAGACGGGAATTTGCTCACTTTTTGACTTTCCGTTACGCAACAGAAAAAGTTAAAAACGAAAAGACTAAAATCACACGTCTTGTGACTTTCTAAAt < 2:619524/296‑1 (MQ=255) 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cttCTTGTGACTTTCTAAATTGATTCACATGCTAAATCTGATAAGTTTTAATTTCAATGGTAGGTTTATTTCTTAGCTTTCGCTAGTAAACTGATAATCAGACAAAATGGTGACATGAGGGACATTGTGGACCCTGTATTCTCTATCGGTATCTCATCATTATGGGATGAGCTGCGACATATGCCAGCAGGCGGCGTCTGGTGGTTTAACGTCGATCGCCATGAAGATGCTATCAGTCTGGCGAATCAAACAATTGCATCCCAGGCTGAAACCGCACACGTCGCGGTCATTAGCATGGAc < 2:311279/298‑1 (MQ=255) cGTCTTGTGACTTTCTAAATTGATTCACATGCTAAATCTGATAAGTTTTAATTTCAATGGTAGGTTTATTTCTTAGCTTTCGCTAGTAAACTGATAATCAGACAAAATGGTGACATGATGGACATTGTGGACCCTGTATTCTCTATCGGTATCTCATCATTATGGGATGAGCTGCGACATATGCCAGCAGGCGGCGTCTGGTGGTTTAACGTCGATCGCCATGAAGATGCTATCAGTCTGGCGAATCAAACAATTGCATCCCAGGCTGAAACCGCACACGTCGCGGTCATTAGCATGGAc < 1:536771/300‑1 (MQ=255) tCTTGTGACTTTCTAAATTGATTCACATGCTAAATCTGATAAGTTTTAATTTCAATGGTAGGTTTATTTCTTAGCTTTCGCTAGTAAACTGATAATCAGACAAAATGGTGACATGAGGGACATTGTGGACCCTGTATTCTCTATCGGTATCTCATCATTATGGGATGAGCTGCGACATATGCCAGCAGGCGGCGTCTGGTGGTTTAACGTCGATCGCCATGAAGATGCTATCAGTCTGGCGAATCAAACAATTGCATCCCAGGCTGAAACCGCACACGTCGCGGTCATTAGCATGGACAg > 2:233448/1‑300 (MQ=255) tCTTGTGACTTTCTAAATTGATTCACATGCTAAATCTGATAAGTTTTAATTTCAATGGTAGGTTTATTTCTTAGCTTTCGCTAGTAAACTGATAATCAGACAAAATGGTGACATGAGGGACATTGTGGACCCTGTATTCTCTATCGGTATCTCATCATTATGGGATGAGCTGCGACATATGCCAGCAGGCGGCGNCTGGTGGTTTAACGTCGATCGCCATGAAGATGCTATCAGTCTGGCGAATCAAACAATTGCATCCCAGGCTGAAACCGCACACGTCGCGGTCATTAGCATGGACAg > 2:708522/1‑300 (MQ=255) tgtgACTTTCTAAATTGATTCACATGCTAAATCTGATAAGTTTTAATTTCAATGGTAGGTTTATTTCTTAGCTTTCGCTAGTAAACTGATAATCAGACAAAATGGTGACNTGAGGGACATTGTGGACCCTGTATTCTCTATCGGTATCTCATCATTATGGGATGAGCTGCGACATATGCCAGCAGGCGGCGTCTGGTGGTTTAACGTCGATCGCCATGAAGATGCTATCAGTCTGGCGAATCAAACAATTGCATCCCAGGCTGAAACCGCACACGTCGCGGTCATTAGCATGGACAGCGa < 1:547296/300‑1 (MQ=255) tgtgACTTTCTAAATTGATTCACATGCTAAATCTGATAAGTTTTAATTTCAATGGTAGGTTTATTTCTTAGCTTTCGCTAGTAAACTGATAATCAGACAAAATGGTGACATGAGGGACATTGTGGACCCTGTATTCTCTATCGGTATCTCATCATTATGGGATGAGCTGCGACATATGCCAGCAGGCGGCGTCTGGTGGTTTAACGTCGATCGCCATGAAGATGCTATCAGTCTGGCGAATCAAACAATTGCATCCCAGGCTGAAACCGCACACGTCGCGGTCATTAGCATGGACAGCGa < 1:604036/300‑1 (MQ=255) | CGTTGGGAAATATCGGCATAATCAATATCAGGCAGTGAAAATGCCTGCTTTAACGCCACAATATCATTCTGGAAGATATAGCCTATCGCGGGATCAGGCAGAGTATCTGGTTCATTGTTATTCATTTTGCTTGATCCCTATGAAATAACCGTACCGTTCATGAGACAATTCTAACCGTGAGCATTTCGCCGGTTTATTGTTTACGGCGAGACGGGAATTTGCTCACTTTTTGACTTTCCGTTACGCAACAGAAAAAGTTAAAAACGAAAAGACTAAAATCACACGTCTTGTGACCTTCTAAATTGATTCACATGCTAAATCTGATAAGTTTTAATTTCAATGGTAGGTTTATTTCTTAGCTTTCGCTAGTAAACTGATAATCAGACAAAATGGTGACATGAGGGACATTGTGGACCCTGTATTCTCTATCGGTATCTCATCATTATGGGATGAGCTGCGACATATGCCAGCAGGCGGCGTCTGGTGGTTTAACGTCGATCGCCATGAAGATGCTATCAGTCTGGCGAATCAAACAATTGCATCCCAGGCTGAAACCGCACACGTCGCGGTCATTAGCATGGACAGCGA > NC_000913/3696061‑3696648 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |