| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2521006 | 71 (0.690) | 3 (0.040) | 3/446 | 7.7 | 5.6% | noncoding (76/76 nt) | valU | tRNA‑Val |
| ? | NC_000913 | 2521127 = | 49 (0.640) | intergenic (+1/‑46) | valX/valY | tRNA‑Val/tRNA‑Val | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GATCATCTTGCTTAAATTTACGACGAACGAACAATTTCTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAA‑GGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑ACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTACTATCTGCGATACTCAAAGATTCGAACCTGCAGCAGGTTTGAGTTGAGCGCAGCGAAA > NC_000913/2520835‑2521418 | aatcagctggCTTAAATTTACGACGAACGAACAATTTCTTTAGAAAATGCGTTGACTCATGTTGAACCCTCCCTATAATGCGACTCCACACAACGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGGTCGATCCCTTCATCACCCACCAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAA‑GGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑ACTTTCTCg < 2:168101/291‑1 (MQ=255) ctgtagaaaacgcttttaatCATTTTGAACTCTCCCTATAATTCCACGCCACACAACGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGTGGAGCACCTCCCTTACAATTAGGGGTGCGGCGGTTCGATCCCTTTATCACCCACCGGCTGCTGTGTTTAGTCTCCGCCGTGGAGCAAGAAATGGGGAAGTGGGGGATGAGCTCAGCTGGGAGAGCACCGCCCTTACAA‑GGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCTGTCATCACCCACC‑ACTTTCTAGCCAGCGAAATGTCTTGGAAAAATGTGAAGTACCGAAg < 2:65397/281‑1 (MQ=19) cTTTAGAAAATGCGTTGACTTATTTTGAACTCTCTCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGGTTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTGACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCAGCACCCACCAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAA‑GGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑ACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCggag < 2:519036/300‑4 (MQ=255) cTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAA‑GGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑ACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAg < 1:792589/300‑1 (MQ=255) gCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAA‑GGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑ACTTTCTCGACAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAg > 1:694349/1‑300 (MQ=255) tCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGTTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAACTACTGTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAA‑GGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑ACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTg < 2:469861/300‑1 (MQ=255) tCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGTTATAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAA‑GGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑ACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTg < 2:451934/300‑1 (MQ=255) 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cTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCGTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAACTACTTTATGTAGTCTCCGCTGTGTAGCAGGGGATTTATAAGCGGGTGATTCGCTCTTCTGGGAGAGCGCCTCCCTCCCAC‑GGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCTTCTTCCCCCCCC‑CCCTTCTAGACCGCTAAATTCCTTGTCAGAATGTGCAGTCTCGAAGCGGGTggtcagagcagcgggtagcgcacatccagc > 2:510656/1‑271 (MQ=16) ataATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAA‑GGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑ACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTAc < 1:181462/300‑1 (MQ=255) aaTGGGACTCCACACGGTGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGATCACCTCCCTTACAAGGAGGGGTTCGGTGGTTTGATCCCGTCATCACCCACCAGCTGCTTTATGTAGTCTTCTCTGTGTAGCAAGAAATTGAGGATTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAA‑GGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCTTCATCACCCACC‑ACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACaa < 2:86945/300‑1 (MQ=37) aaTGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAA‑GGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑ACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACaa < 1:417329/300‑1 (MQ=255) aCTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAACTACTTTATGTAGTCTCCNCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAA‑GGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑ACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAggg < 1:551960/300‑1 (MQ=255) aCTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAACTAATGTATGTAGTCTCCTCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGCGAGTGATTAGCTCAGCTAGGAGGGCACACCCCCCAAAA‑GGAGAGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑AATTTCTAGCCAGCTAGATTTTGTGTAAAAATGTGGAGTACCGCAGTGGGCTATTAGCTCCGCttgtagcgcacttccattacgtggatga > 2:425035/1‑273 (MQ=19) 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GATCATCTTGCTTAAATTTACGACGAACGAACAATTTCTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAA‑GGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑ACTTTCTCGCCAGCTAAATTTCTTGTAAAAATGTGAAGTACCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTACTATCTGCGATACTCAAAGATTCGAACCTGCAGCAGGTTTGAGTTGAGCGCAGCGAAA > NC_000913/2520835‑2521418 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |