| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2818275 | 47 (0.460) | 3 (0.040) | 3/440 | 7.7 | 4.9% | intergenic (‑1/+198) | argY/argV | tRNA‑Arg/tRNA‑Arg |
| ? | NC_000913 | 2818551 = | 83 (1.100) | intergenic (‑2/+2) | argV/serV | tRNA‑Arg/tRNA‑Ser | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATC‑GGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAA‑CTT‑A‑CTTTA‑CTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGG > NC_000913/2817983‑2818563 | aCGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATC‑GGGAAATTTATTTTACTGCTGATCTTGATACCGCTCCTCCAGCCATATCACGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTACGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTAAGGATGCATCGGGaa > 1:693815/1‑300 (MQ=255) ttATCATCCATAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATC‑GGGAAATTTATTTTACTGCTGATCTTGATACCGCTCCTACAGCCATATCCAGTAGGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCagatggcggct > 2:518598/1‑290 (MQ=21) tcCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTCCCCCGATACGCCTCT‑AAGAACCCAGGAGACGTCTTCTAATACTGATATTGATACCGCTACTCCAGCCATATCAAGTAGGAGGTGGTGCATACGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAACTGAGCTACGGATGCATCGGGAAA‑Ctt‑a‑cttt > 1:392013/1‑300 (MQ=18) tcCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATC‑GGGAAGTTTATTTTACTGCTGATCTTGATACCGCTCCTACAGCCACATCACGCAAGAGACGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCCACGACCGCTCGGTTTGTAGCCGAGTACTCTCCCCCACTGATCTACGGATGTATctggcgacccactct > 2:168018/1‑286 (MQ=17) tcCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATC‑GGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAA‑Ctt‑a‑cttt > 1:32627/1‑300 (MQ=255) tcCCTAGTACCTGCGGTTAAGTCCGCTACCTCTTCGAGATATTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCTGGGAGGATTCGAGCCTCCGACCGCGCGGTTCGTGGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATC‑GGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATGCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAA‑Ctt‑a‑cttt < 2:625398/300‑1 (MQ=21) gTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATC‑GGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGCCCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAA‑CTT‑A‑CTTTA‑CTGCa > 1:762338/1‑300 (MQ=255) 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acaggAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTT‑A‑TTCTA‑CTGCTGATATT‑‑GATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAATGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGTTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAGTACTTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCgg < 2:207619/296‑1 (MQ=11) gAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTT‑A‑TTCTA‑CTGCTGATATT‑‑GATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTAGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCggctgt > 1:208593/1‑296 (MQ=11) aGCTACGGATGCATCGGGAAA‑CTT‑A‑CTTTA‑CTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTANAGCCGTATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTNGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAg > 2:749959/1‑300 (MQ=255) 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ACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATC‑GGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAA‑CTT‑A‑CTTTA‑CTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAGTACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAAATGGCGGTGAGG > NC_000913/2817983‑2818563 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |