Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,025,758 | G→A | K257K (AAG→AAA) | ubiD → | 3‑octaprenyl‑4‑hydroxybenzoate decarboxylase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,025,758 | 0 | G | A | 99.2% | 415.7 / ‑6.4 | 127 | K257K (AAG→AAA) | ubiD | 3‑octaprenyl‑4‑hydroxybenzoate decarboxylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (57/69); total (57/70) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 |
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
CCTGGGGGCTGACAGTGACGCGCGGCCCACATAAAGAGCGGCAGAATCTGGGCATTTATCGCCAGCAGCTGATTGGTAAAAACAAACTGATTATGCGCTGGCTGTCGCATCGCGGCGGCGCGCTGGATTATCAGGAGTGGTGTGCGGCGCATCCGGGCGAACGTTTCCCGGTTTCTGTG‑GCGCTGGGTGCCGATCCCGCCACGATTCTCGGTGCAGTCACTCCCGTTCCGGATACGCTTTCAGAGTATGCGTTTGCCGGATTGCTACGTGGCACCAAGACCGAAGTGGTGAAGTGTATCTCCAATGATCTTGAAGTGCCCGCCAGTGCGGAGATTGTGCTGGAAGGGTATATCGAACAAGGCGAAACTGCGCCGGAAGGGCCGTATGGCGACCACACCGGTTACTATAATGAAGTCGATAGTTTCCCGGTATTTACCGTGACGCATATTACCCAGCGTGAAGATGCGATTTACCATTCCACCTATACCGGGCGTCCGCCAGATGAGCCCGCGGTGCTGGGTGTCGCACTGAACGAAGTGTTTGTGCCGATTCTGCAAAAACAGTTCCCGGAAATTGTCGATTTTTACC > NC_000913/4025466‑4026053 | ccTGGGGGCTGACAGTGACGCGCGGCCCACATAAAGAGCGGCAGAATCTGGGCATTTATCGCCAGCAGCTGATTGGTAAAAACAAACTGATTATGCGCTGGCTGTCGCATCGCGGCGGCGCGCTGGATTATCAGGAGTGGTGTGCGGCGCATCCGGGCGAACGTTTCCCGGTTTCTGTG‑GCGCTGGGTGCCGATCCCGCCACGATTCTCGGTGCAGTCACTCCCGTTCCGGATACGCTTTCAGAGTATGCGTTTGCCGGATTGCTACGTGGCACCAAGAACGAAGTGGTGAAATGTAtct > 1:227385/1‑300 (MQ=255) ccTGGGGGCTGACAGTGACGCGCGGCCCACATAAAGAGCGGCAGAATCTGGGCATTTATCGCCAGCAGCTGATTGGTAAAAACAAACTGATTATGCGCTGGCTATCGCATCGCGGCGGCGCGCTGGATTATCAGGAGTGGTGTGCGGCGCATCCGGGCGAACGTTTCCCGGTTTCTGTG‑GCGCTGGGTGCCGATCCCGCCACGATTCTCGGTGCAGTCACTCCCGTTACGGATACGCTTTCAGAGTATGCGTTTGCCGGATTGCTACGTGGCACCAAGACCGAAGTGGTGAGATGTAtct > 2:389700/1‑300 (MQ=255) cTGGGGGCTGACAGTGACGCGCGGCCCACATAAAGAGCGGCAGAATCTGGGCATTTATCGCCAGCAGCTGATTGGTAAAAACAAACTGATTATGCGCTGGCTGTCGCATNGCGGCGGCGCGCTGGATTATCAGGAGTGGTGTGCGGCGCATCCGGGCGAACGTTTCCCGGTTTCTGTG‑GCGCTGGGTGCCGATCCCGCCACGATTCTCGGTGCAGTCACTCCCGTTCCGGATACGCTTTCAGAGTATGCGTTTGCCGGATTGCTACGTGGCACCAAGACCGAAGTGGTGAAATGTAtctc < 1:536974/300‑1 (MQ=255) ggggCTGACAGTGACGCGCGGCCCACATAAAGAGCGGCAGAATCTGGGCATTTATCGCCAGCAGCTGATTGGTAAAAACAAACTGATTATGCGCTGGCTGTCGCATCGCGGCGGCGCGCTGGATTATCAGGAGTGGTGTGCGGCGCATCCGGGCGAACGTTTCCCGGTTTCTGTG‑GCGCTGGGTGCCGATCCCGCCACGATTCTCGGTGCAGTCAATCCCGTTCAGGATACGGTTTCAGAGTATGNGTTTGCCGGATTGCTACGTGGCACCAAGACTGAAGTGGTGAAATGTATCTACaa > 2:602053/1‑300 (MQ=255) gggCTGACAGTGACGCGCGGCCCACATAAAGAGCGGCAGAATCTGGGCATTTATCGCCAGCAGCTGATTGGTAAAAACAAACTGATTATGCGCTGGCTGTCGCATCGCGGCGGCGCGCTGGATTATCAGGAGTGGTGTGCGGCGCATCCGGGCGAACGTTTCCAGGTTTCTGTG‑GCGCTGGGTGCCGATCCCGCCACGATTCTCGGTGCAATCACTCCCGTTCCGGATACGCTTTCAGAGTATGCGCTTGCCGGATTGCTACGTGGCACCAAGACCGAAGTGGTGGAATGTATCTCCacg > 2:407201/1‑298 (MQ=255) gTGACGCGCGGCCCACATAAAGAGCGGCAGAATCTGGGCATTTATCGCCAGCAGCTGATTGGTAAAAACAAACTGATTATGCGCTGGCTGTCGCATCGCGGCGGCGCGCTGGATTATCAGGAGTGGTGTGCGGCGCATCCGGGCGAACGTTTCCCGGTTTCTGTG‑GCGCTGGGTGCCGATCCCGCCACGATTCTCGGTGCAGTCACTCCCGTTCCGGATACGCTTTCAGAGTATGCGTTTGCCGGATTGCTACGTGGCACCAAGACCGAAGTGGTGAAATGTATCTCCAATGATCTTGaa > 1:612863/1‑300 (MQ=255) tGACGCGCGGCCCACATAAAGAGCGGCAGAATCTGGGCATTTATCGCCAGCAGCTGATTGGTAAAAACAAACTGATTATGCGCTGGCTGTCGCATCGCGGCGGCGCGCTGGATTATCAGGAGTGGTGTGCGGCGCATCCGGGCGAACGTTTCCCGGTTTCTGTG‑GCGCTGGGTGCCGATCCCGCCACGATTCTCGGTGCAGTCACTCCCGTTCCGGATACGCTTTCAGAGTATGCGTTTGCCGGATTGCTACGTGGCACCAAGACCGAAGTGGTGAAATGTATCTCCAATGATCTTGAAg < 1:280395/300‑1 (MQ=255) 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aCGTGGCACCAAGACCGAAGTGGTGAAATGTATCTCCAATGATCTTGAAGTGCCCGCCAGTGCGGAGATTGTGCTGGAAGGGTATATCGAACAAGGCGAAACTGCGCCGGAAGGGCCGTATGGCGACCACACCGGTTACTATAATGAAGTCGATAGTTTCCCGGTATTTACCGTGACGCATATTACCCAGCGTGNAGATGCGATTTACCATTCCACCTATACCGGGCGTCCGCCAGATGAGCCCGCGGTGCTGGGTGTCGCACTGAACGAAGTGTTTGTGCCGATTCTGCAAAAACAGtt > 2:694547/1‑300 (MQ=255) aCCAAGACCGAAGTGGTGAAATGTATCTCCAATGATCTTGAAGTGCCCGCCAGTGCGGAGATTGTGCTGGAAGGGTATATCGAACAAGGCGAAACTGCGCCGGAAGGGCCGTATGGCGACCACACCGGTTACTATAATGAAGTCGATAGTTTCCCGGTATTTACCGTGACGCATATTACCCAGCGTGAAGATGCGATTTACCATTCCACCTATACCGGGCGTCCGCCAGATGAGCCCGCGGTGCTGGGTGTCGCACTGAACGAAGTGTTTGTGCCGATTCTGACAAAACAGTTCCCggca > 2:383401/1‑298 (MQ=255) aCCAAGACCGAAGTGGTGAAATGTATCTACAATGATCTTGAAGTGCCCGCCAGTGCGGAGATTGTGCTGGAAGGGTATATCGAACAAGGCGAAACTGCGCCGGAAGGGCCGTATGGCGACCACACCGGTTACTATAATGAAGTCGATAGTTTCCCGGTATTTACCGTGACGCATATTACCCCGCGTGAAGATGCGATTTACCATTCCACCTATACCGGGCGTCCGCCAGATGAGCCCGCGGTGCTGGGTGTCGCACTGAACGAAGTGTTTGTGCCGATTCTGCAAAAACAGTTCCCGGaa > 1:314824/1‑300 (MQ=255) aaGTGGTGAAATGTATCTCCAATGATCTTGAAGTGCCCGCCAGTGCGGAGATTGTGCTGGAAGGGTATATCGAACAAGGCGAAACTGCGCCGGAAGGGCCGTATGGCGACCACACCGGTTACTATAATGAAGTCGATAGTTTCCCGGTATTTACCGTGACGCATATTACCCAGCGTGAAGATGCGATTTACCATTCCACCTATACCGGGCGTCCGCCCGATTCGCCCGCAGTGCTGGGTGTCGCACTGAACGAAGTGTTTGTGCCGATTCTGCCAAAACAGTTCCCGGAAATTGTCGAtt > 1:156949/1‑300 (MQ=255) gtggtgAAATGTATCTCCAATGATCTTGAAGTGCCCGCCAGTGCGGAGATTGTGCTGGAAGGGTATATCGAACAAGGCGAAACTGCGCCGGAAGGGCCGTATGGCGACCACACCGGTTACTATAATGAAGTCGATAGTTTCCCGGTATTTACCGTGACGCATATTACCCAGCGTGAAGATGCGATTTACCATTCCACCTATACCGGGCGTCCGCCAGATGAGCCCGCGGTGCTGGGTGTCGCACTGAACGAAGTGTTTGTGCCGATTCTGCAAAAACAGTTCCCGGAAATTGTCGAtttt > 1:371589/1‑300 (MQ=255) tgAAATGTATCTCCAACGATCTTGAAGTGCCCGCCAGTGCGTAGATTGTTCTGGAGGGGTATATCGAACAAGGCGAAACTGCGCCGGAAGGGCCGCATGGCGACCACACCGGTTACTATAATGAAGTCGATAGTTTCCCGGTATTTACCGGTACGCATATTACCCAGCGTGAAGATGCGATTTACCATTCCACCTATACCGGGCGTCCGCCAGATGAGCCCGCGGTGCTGGGTGTCGCACTGAACGAAGTGTTTGTGCCGATTCTGCAAAAACAGTTCCCGGAAATTGTCGATTTTTAcc < 2:297334/300‑1 (MQ=255) | CCTGGGGGCTGACAGTGACGCGCGGCCCACATAAAGAGCGGCAGAATCTGGGCATTTATCGCCAGCAGCTGATTGGTAAAAACAAACTGATTATGCGCTGGCTGTCGCATCGCGGCGGCGCGCTGGATTATCAGGAGTGGTGTGCGGCGCATCCGGGCGAACGTTTCCCGGTTTCTGTG‑GCGCTGGGTGCCGATCCCGCCACGATTCTCGGTGCAGTCACTCCCGTTCCGGATACGCTTTCAGAGTATGCGTTTGCCGGATTGCTACGTGGCACCAAGACCGAAGTGGTGAAGTGTATCTCCAATGATCTTGAAGTGCCCGCCAGTGCGGAGATTGTGCTGGAAGGGTATATCGAACAAGGCGAAACTGCGCCGGAAGGGCCGTATGGCGACCACACCGGTTACTATAATGAAGTCGATAGTTTCCCGGTATTTACCGTGACGCATATTACCCAGCGTGAAGATGCGATTTACCATTCCACCTATACCGGGCGTCCGCCAGATGAGCCCGCGGTGCTGGGTGTCGCACTGAACGAAGTGTTTGTGCCGATTCTGCAAAAACAGTTCCCGGAAATTGTCGATTTTTACC > NC_000913/4025466‑4026053 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |