| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,200,082 | 0 | G | C | 99.0% | 376.9 / NA | 98 | intergenic (+2784/‑197) | yehF/yehI | PF05406 family protein YehF/DUF4132 domain‑containing protein YehI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (58/39); minor base T (1/0); total (59/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACTCCTCACGTTCTGGAAATATCACCAACGGATGCTGCCGCCTTTGGTCAGCTTTTTGCCGACTACGAACTGCTACCACCGTTCCGCCAGCTCGACCGTAACAGCTACGCCCTGACAGAAGCCGAGCGCAATGCCAGTGAACTGACCCGCTGGGCAGGCAGAAAATGCCCGAGTGGTCGGGTCATGGGGCTGGCGAATAAAGGCTGGATAAAGGGCGAACCACAGGATGGAGGCTGGATCGGATGGATGATCAAACCTTTGGGTCGCTGGTCGTTAATCATGGAAATCGATGAAGGCTTTGCGGTAGGCATGTCGCCAGCCGAACTCAGCGCTGAGCAGCTCTTAAGCAAGCTGTGGCTATGGGAAGGCAAAGCAGAAAGATATGGCTGGGGGAGTAATTCAACACAGGAAGCGCAGTTCTCCGTAATCGATGCCATCACCGCCAGCGAGCTAATTAACGATATTGAAGCCCTGTTTGAATAAGGAAAGAGCATGGACAAGGAATTACCGTGGCTGGCGGATAACGCCCAACTGGAACTGAAATATAAAAAAGGCAAAACGCCGCTCAGTCATCGTCGCTGGCCGGGC > NC_000913/2199787‑2200374 | aCTCCTCACGTTCTGGAAATATCACCAACGGATGCTGCCGCCTTTGGTCAGCTTTTTGCCGACTACGAACTGCTACCACCGTTCCGCCAGCTCGACCGTAACAGCTACGCCCTGACAGAAGCCGAGCGCAATGCCAGTGAACTGACCCGCTGGGCAGGCAGAAAATGCCCGAGTGGTCGGGTCATGGGGCTGGCGAATAAAGGCTGGATAAAGGGCGAACCACAGGATGGAGGCTGGATCGGATGGATGATCAAACCTTTGGGTCGCTGGTCGTTAATCATGGAAATCGATGAAGCCttt > 1:336933/1‑300 (MQ=255) 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ggAAATCGATGAAGCCTTTGCGGTAGGCATGTCGCCAGCCGAACTCAGCGCTGAGCAGCTCTTAAGCAAGCTGTGGCTATGGGAAGGCAAAGCAGAAAGATATGGCTGGGGGAGTAATTCAACACAGGAAGCGCAGTTCTCCGTAATCGATGCCATCACCGCCAGCGAGCTAATTAACGATATGGAAGCCCTGTTTGAATAAGGAAAGAGCATGGACAAGGAATTACCGTGGCTGGCGGATAACGCCCAACTGGAACTGAAATATAAAAAAGGCAAAACGCCGCTCAGTCATCGTCGCTg < 2:334683/300‑1 (MQ=255) aaTCGATGAAGCCTTTGCGGTAGGCATGTCGCCAGCCGGACTCAGCGCTGAGCAGCTCTTAAGCAAGCTGTGGCTATTGGAAGGCAAAGCAGAGAGATATGGCTGGGGGAGTAATTCAACACAGGAAGCGCAGTTCTCCGTAATCGCTGCCATCACCGCCAGCGAGCTAATTAACGATATTGAAGCCCTGTTTGAATAAGGAAAGAGCATGGACAAGGAATTACCGTGGCTGGCGGATAACGCCCAACTGGAACTGAAATATAAAAAAGGCAAAACGCCGCTCAGTCATCGTCGCTGGcc < 2:123576/300‑1 (MQ=255) aaTCGATGAAGCCTTTGCGGTAGGCATGTCGCCAGCCGAACTCAGCGCTGAGCAGCTCTTAAGCAAGCTGTGGCTATGGGAAGGCAAAGCAGAAAGATATGGCTGGGGGAGTAATTCAACACAGGAAGCGCAGTTCTCCGTAATCGATGCCATCACCGCCAGCGAGCTAATTAACGATATTGAAGCCCTGTTTGAATAAGGAAAGAGCATGGACAAGGAATTACCGTGGCTGGCGGATAACGCCCAACTGGAACTGAAATATAAAAAAGGCAAAACGCCGCTCAGTCATCGTCGCTGGcc < 1:450484/300‑1 (MQ=255) gATGAAGCCTTTGCGGTAGGCATGTCGCCAGCCGAACTCAGCGCTGAGCAGCTCTTAAGCAAGCTGTGGCTATGGGAAGGCAAAGCAGAAAGATATGGCTGGGGGAGTAATTCAACACAGGAAGCGCAGTTCTCCGTAATCGATGCCATCACCGCCAGCGAGCTAATTAACGATATTGAAGCCCTGTTTGAATAAGGAAAGAGCATGGACAAGGAATTACCGTGGCTGGCGGATAACGCCCCACTGGAACTGAAATATAAAAAAGGCAAAACGCCGCTCAGTCATCGTCGCTGGCAGGGc > 2:323818/1‑300 (MQ=255) | ACTCCTCACGTTCTGGAAATATCACCAACGGATGCTGCCGCCTTTGGTCAGCTTTTTGCCGACTACGAACTGCTACCACCGTTCCGCCAGCTCGACCGTAACAGCTACGCCCTGACAGAAGCCGAGCGCAATGCCAGTGAACTGACCCGCTGGGCAGGCAGAAAATGCCCGAGTGGTCGGGTCATGGGGCTGGCGAATAAAGGCTGGATAAAGGGCGAACCACAGGATGGAGGCTGGATCGGATGGATGATCAAACCTTTGGGTCGCTGGTCGTTAATCATGGAAATCGATGAAGGCTTTGCGGTAGGCATGTCGCCAGCCGAACTCAGCGCTGAGCAGCTCTTAAGCAAGCTGTGGCTATGGGAAGGCAAAGCAGAAAGATATGGCTGGGGGAGTAATTCAACACAGGAAGCGCAGTTCTCCGTAATCGATGCCATCACCGCCAGCGAGCTAATTAACGATATTGAAGCCCTGTTTGAATAAGGAAAGAGCATGGACAAGGAATTACCGTGGCTGGCGGATAACGCCCAACTGGAACTGAAATATAAAAAAGGCAAAACGCCGCTCAGTCATCGTCGCTGGCCGGGC > NC_000913/2199787‑2200374 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |