Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,136,467 | 0 | A | C | 29.6% | 184.3 / 20.5 | 98 | E120D (GAA→GAC) | yijE | cystine exporter |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.08e-07 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
GGAGTTATAGCTGGATTTTCATGAAGCAAGTCACCAGTTACATCGGTGCCTTCGACTTTACCGCCTTACGCTGCATTTTCGGCGCTCTCGTTTTATTCATCGTCCTTTTATTACGTGGTCGCGGAATGCGCCCGACACCGTTTAAATACACCTTAGCCATTGCCCTGTTACAAACCTGCGGGATGGTTGGTCTGGCGCAGTGGGCGTTGGTCAGCGGAGGTGCGGGGAAGGTGGCGATCCTGAGCTATACCATGCCGTTCTGGGTGGTGATTTTCGCCGCGTTGTTTCTCGGTGAACGCCTGCGACGTGGGCAATATTTCGCGATTCTGATTGCCGCTTTCGGCTTATTTTTGGTGTTGCAGCCGTGGCAACTCGATTTCTCTTCGATGAAAAGTGCCATGCTGGCAATCCTCTCCGGCGTCAGTTGGGGGGCGAGCGCGATTGTTGCTAAACGTCTGTATGCCCGTCATCCGCGCGTGGATTTATTGTCGTTAACATCCTGGCAGATGCTGTATGCGGCGCTGGTGATGAGTGTGGTCGCTTTACTGGTGCCGCAACGTGAAATTGACTGGCAGCCCACCGTGTTCTGGGC > NC_000913/4136172‑4136763 | ggAGTTATAGCTGGATTTTCATGAAGCAAGTCACCAGTTACATCGGTGCCTTCGACTTTACCGCCTTACGCTGCATTTTCGGCGCTCTCGTTTTATTCATCGTCCTTTTNTTACGTGGTCGCGGAATGCGCCCGACACCGTTTAAATACACCTTAGCCATTGCCCTGTTACAAACCTGCGGGATGGTTGGTCTGGCGCAGTGGGCGTTGGTCAGCGGAGGTGCGGGGAAGGTGGCGATCCTGAGCTATACCATGCCGTTCTGGGTGGTGATTTTCGCCGCGTTGTTTCTCGGTGAACGcc < 1:592124/300‑1 (MQ=255) 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ggTGAACGCCTGCGACGTGGGCAATATTTCGCGATTCTGATTGCCGCTTTCGGCTTATTTTTGGTGTTGCAGCCGTGGCAACTCGATTTCTCTTCGATGAAAAGTGCCATGCTGGCAATCCTCTCCGGCGTCAGTTGGGGGGCGAGCGCGATTGTTGCTAAACGTCTGTATGCCCGTCATCCGCGCGTGGATTTATTGTCGTTAACATCCTGGCAGATGCTGTATGCGGCGCTGGTGATGAGTGTGGTCGCTTTACTGGTGCCGCAACGTGAAATTGACTGGCAGCCCACCGTGTTCTgg < 1:233795/300‑1 (MQ=255) gTGAACGCCTGCGACGTGGGCAATATTTCGCGATTCTGATTGCCGCTTTCGGCTTATTTTTGGTGTTGCAGCCGTGGCAACTCGATTTCTCTTCGATGAAAAGTGCCATGCTGGCAATCCTCTCCGGCGTCAGTTGGGGGGCGAGCGCGATTGTTGCTAAACGTCTGTATGCCCGTCATCCGCGCGTGGATTTATTGTCGTTAACGTCCTGGCAGATGCTGTATGCGGCGCTGGTGATGAGTGTGGTCGCTTTACTGGTGCCGCAACGTGAAATTGACTGGCAGCCCACCGTGTTCTggg > 2:512961/1‑300 (MQ=255) gTGAACGCCTGCGACGTGGGCAATATTTCGCGATTCTGATTGCCGCTTTCGGCTTATTTTTGGTGTTGCAGCCGTGGCAACTCGATTTCTCTTCGATGAAAAGTGCCATGCTGGCAATCCTCTCCGGCGTCAGTTGGGGGGCGAGCGCGATTGTTGCTAAACGTCTGTATGCCCGTCATCCGCGCGTGGATTTATTGTCGTTAACATCCTGGCAGATGCTGTATGCGGCGCTGGTGATGAGTGTGGTCGCTTTACTGGTGCCGCAACGTGAAATTGACTGGCAGCCCACCGTGTTCTggg > 1:86929/1‑300 (MQ=255) tGAACGCCTGCGACGTGGGCAATATTTCGCGATTCTGATTGCCGCTTTCGGCTTATTTTTGGTGTTGCAGCCGTGGCAACTCGATTTCTCTTCGATGAAAAGTGCCATGCTGGCAATCCTCTCCGGCGTCAGTTGGGGGGCGAGCGCGATTGTTGCTAAACGTCTGTATGCCCGTCATCCGCGCGTGGATTTATTGTCGTTAACATCCTGGCAGATGCTGTATGCTGCGCTGGGGATGAGTGTGGTCGCTTTACTGGTGCCGCAACGTGAAATTGACTGGCAGCTCACCGTGTTCTGGgc < 2:519233/300‑1 (MQ=255) | GGAGTTATAGCTGGATTTTCATGAAGCAAGTCACCAGTTACATCGGTGCCTTCGACTTTACCGCCTTACGCTGCATTTTCGGCGCTCTCGTTTTATTCATCGTCCTTTTATTACGTGGTCGCGGAATGCGCCCGACACCGTTTAAATACACCTTAGCCATTGCCCTGTTACAAACCTGCGGGATGGTTGGTCTGGCGCAGTGGGCGTTGGTCAGCGGAGGTGCGGGGAAGGTGGCGATCCTGAGCTATACCATGCCGTTCTGGGTGGTGATTTTCGCCGCGTTGTTTCTCGGTGAACGCCTGCGACGTGGGCAATATTTCGCGATTCTGATTGCCGCTTTCGGCTTATTTTTGGTGTTGCAGCCGTGGCAACTCGATTTCTCTTCGATGAAAAGTGCCATGCTGGCAATCCTCTCCGGCGTCAGTTGGGGGGCGAGCGCGATTGTTGCTAAACGTCTGTATGCCCGTCATCCGCGCGTGGATTTATTGTCGTTAACATCCTGGCAGATGCTGTATGCGGCGCTGGTGATGAGTGTGGTCGCTTTACTGGTGCCGCAACGTGAAATTGACTGGCAGCCCACCGTGTTCTGGGC > NC_000913/4136172‑4136763 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |