New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 2140138 = | 25 (0.250) | coding (1475/1854 nt) | asmA | putative assembly protein AsmA |
TCAGGCGACGTTTCGCTTCGTCCTGTAGATGTTTGCGCAGTAACTGATCCACTTGCAGGCTGTAATTGAGTTGCTGCCAGTTGCCATAAACCCGCAGCGGTACTGGCGTTTCTTTCAGGAAATCAATCAGTTTGCTTTCCCCGTTCCAGCCACCCACGACCCGAATATCAAACTGGGTGTCGCAGGTTTGATCTGCCAGATTCAACATGCCTTCCCCTGTCAGCGCCAGCACAGGCGATTGACCTTGCATGTCGTTTAACGTCACGACGCCATCCTTCAACGTCAAATCGGTGGTAAAGCGGTCAAGCCGCGTCACGTTATCAAAGTTTTCAGCGGCCTTCACATCACCGCCATTACGCTCTACCGCTTGCTGAATCATCTGCTGGAAGTTCATCCCTTCCATGCGCGTGTCGGTCATTTCGACATGTGCCTGTCCTTGCCAGTTGTGGCGGAATGCGTCGGCATCTATGTCAGCACCGGAGAAATCACCAGCCAGTGACATTTTTCCGGTCAACGAAATCGGATAGTTAAACGCCTTCAGAATGGTACCAATCTCAACGTTTTCCAGCCGTGGCTGGAAGTTTATCCGCGG > NC_000913/2139830‑2140421 | tCAGGCGACGTTTCGCTTCGTCCTGTAGATGTTTGCGCAGTAACTGATCCACTTGCAGGCTGTAATTGAGTTGCTGCCAGTTGCCATAAACCCGCAGCGGTACTGGCGTTTCTTTCAGGAAATCAATCAGTTTGCTTTCCCCGTTCCAGCCACCCACGACCCGAATATCAAACTGGGTGTCGCAGGTTTGATCTGCCAGATTCAACATGCCTTCCCCTGTCAGCGCCAGCACAGGCGATTGACCTTGCATGTCGTTTAACGTCACGACGCCATCCTTCAACGTCAAATCGGTGGTAAAGc < 1:610341/300‑1 (MQ=255) 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cTGTAGATGTTTGCGCAGTAACTGATCCACTTGCAGGCTGTAATTGAGTTGCTGCCAGTTGCCATAAACCCGCAGCGGTACTGGCGTTTCTTTCAGGAAATCAATCAGTTTGCTTTCCCCGTTCCAGCCACCCACGACCCGAATATCAAACTGGGTGTCGCAGGTTTGATCTGCCAGATTCAACATGCCTNCCCCTGTCAGCGCCAGCACAGGCGATTGACCTTGCATGTCGTTTAACGTCACGACGCCATCCTTCAACGTCAAATCGGTGGTAAAGCcgcgtcacgttatcaaagtttt > 1:564723‑M1/1‑278 (MQ=255) tGTTTGCGCAGTAACTGATCCACTTGCAGGCTGTAATTGAGTTGCTGCCAGTTGCCATAAACCCGCAGCGGTACTGGCGTTTCTTTCAGGAAATCAATCAGTTTGCTTTCCCCGTTCCAGCCACCCACGACCCGAATATCCAACTGGGTGTCGCAGGTTTGATCTGCCAGATTCAACATGCCTTCCCCTGTCAGCGCCAGCACAGGCGATTGACCTTGCATGTCGTTTAACGCCACGACGCCATCCTTCAACGTCAAATCGGTGGTAAAGCcgcgtaaagttatcaaagttttcagcggc > 1:761900‑M1/1‑271 (MQ=255) cgcAGTAACTGATCCACTTGCAGGCTGTAATTGAGTTGCTGCCAGTTGCCATAAACCCGCAGCGGTACTGGCGTTTCTTTCAGGAAATCAATCAGTTTGCTTTCCCCGTTCCAGCCACCCACGACCCGAATATCAAACTGGGTGTCGCAGGTTTGATCTGCCAGATTCAACATGCCTTCCCCTGTCAGCGCCAGCACAGGCGATTGACCTTGCATGTCGTTTAACGTCACGACGCCATCCTTCAACGTCAAATCGGTGGTAAAGCcgcgtcacgttatcaaagttttcagcggccttcac > 1:482831‑M1/1‑265 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |