| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 1,153,007 | G→A | A357T (GCG→ACG) | fabF → | 3‑oxoacyl‑[acyl carrier protein] synthase 2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,153,007 | 0 | G | A | 98.9% | 302.0 / NA | 88 | A357T (GCG→ACG) | fabF | 3‑oxoacyl‑[acyl carrier protein] synthase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (54/33); minor base C (1/0); total (55/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TCGTCGGCTTTGGTATGAGCAGCGATGCTTATCATATGACGTCACCGCCAGAAAATGGCGCAGGCGCAGCTCTGGCGATGGCAAATGCTCTGCGTGATGCAGGCATTGAAGCGAGTCAGATTGGCTACGTTAACGCGCACGGTACTTCTACGCCGGCTGGCGATAAAGCTGAAGCGCAGGCGGTGAAAACCATCTTCGGTGAAGCTGCAAGCCGTGTGTTGGTAAGCTCCACGAAATCTATGACCGGTCACCTGTTAGGTGCGGCGGGTGCAGTAGAATCTATCTACTCCATCCTGGCGCTGCGCGATCAGGCTGTTCCGCCAACCATCAACCTGGATAACCCGGATGAAGGTTGCGATCTGGATTTCGTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTAT > NC_000913/1152711‑1153301 | tcgtcgGCTTTGGTATGAGCAGCGATGCTTATCATATGACGTCACCGCCAGAAAATGGCGCAGGCGCAGCTCTGGCGATGGCAAATGCTCTGCGTGATGCAGGCATTGAAGCGAGTCAGATTGGCTACGTTAACGCGCACGGTACTTCTACGCCGGCTGGCGATAAAGCTGAAGCGCAGGCGGTGAAAACCATCTTCGGTGAAGCTGCAAGCCGTGTGTTGGTAAGCTCCACGAAATCTATGACCGGTCACCTGTTAGGTGCGGCGGGTGCAGTAGAATCTATCTACTCCATCCTGacgc < 1:52532/300‑1 (MQ=255)tcgtcgGCTTTGGTATGAGCAGCGATGCTTATCATATGACGTCACCGCCAGAAAATGGCGCAGGCGCAGCTCTGGCGATGGCAAATGCTCTGCGTGATGCAGGCATTGAAGCGAGTCAGATTGGCTACGTTAACGCGCACGGTACTTCTACGCCGGCTGGCGATAAAGCTGAAGCGCAGGCGGTGAAAACCATCTTCGGTGAAGCTGCAAGCCGTGTGTTGGTAAGCTCCACGAAATCTATGACCGGTCACCTGTTAGGTGCGGCGGGTGCAGTAGAATCTATCTACTCCATCCTGacgc < 2:697910/300‑1 (MQ=255) tttGGTATGAGCAGCGATGCTTATCATATGACGTCACCGCCAGAAAATGGCGCAGGCGCAGCTCTGGCGATGGCAAATGCTCTGCGTGATGCAGGCATTGAAGCGAGTCAGATTGGCTACGTTAACGCGCACGGTACTTCTACGCCGGCTGGCGATAAAGCTGAAGCGCAGGCGGTGAAAACCATCTTCGGTGAAGCTGCAAGCCGTGTGTTGGTAAGCTCCACGAAATCTATGACCGGTCACCTGTTAGGTGCGGCGGGTGCAGTAGAATCTATCTACTCCATCCTGACGCTGCGCGAt < 2:492290/300‑1 (MQ=255) gAGCAGCGATGCTTATCATATGACGTCACCGCCAGAAAATGGCGCAGGCGCAGCTCTGGCGATGGCAAATGCTCTGCGTGATGCAGGCATTGAAGCGAGTCAGATTGGCTACGTTAACGCGCACGGTACTTCTACGCCGGCTGGCGATAAAGCTGAAGCGCAGGCGGTGAAAACCATCTTCGGTGAAGCTGCAAGCCGTGTGTTGGTAAGCTCCACGAAATCTATGACCGGTCACCTGTTAGGTGCGGCGGGTGCAGTAGAATCTATCTACTCCATCCTGACGCTGCGCGATCAGGCTGt > 1:74532/1‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |