Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 537,024 | C→T | P147S (CCG→TCG) | glxR → | tartronate semialdehyde reductase 2 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 537,024 | 0 | C | T | 99.1% | 411.6 / NA | 114 | P147S (CCG→TCG) | glxR | tartronate semialdehyde reductase 2 |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.51e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
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tATTTGAACGTGTTAAATCGCTGTTTGAACTGCTCGGTAAAAATATCACCCTCGTGGGCGGTAACGGCGATGGTCAAACCTGCAAAGTGGCAAATCAGATTATCGTGGCGCTCAATATTGAAGCGGTTTCTGAAGCCCTGCTATTTGCTTCAAAAGCCGGTGCGGACCCGGTACGTGTGCGCCAGGCGCTGATGGGCGGCTTTGCTTCCTCACGTATTCTGGAAGTTCATGGCGAGCGTATGATTAAACGCACCTTTAATCCGGGCTTCAAAATCGCTCTGCACCAGAAAGATCTCAAcc < 1:114690/300‑1 (MQ=255) aaCGTGTTAAATCGCTGTTTGAACTGCTCGGTAAAAATATCACCCTCGTGGGCGGTAACGGCGATGGTCAAACCTGCAAAGTGGCAAATCAGATTATCGTGGCGCTCAATATTGAAGCGGTTTCTGAAGCCCTGCTATTTGCTTCAAAAGCCGGTGCGGACCCGGTACGTGTGCGCCAGGCGCTGATGGGCGGCTTTGCTTCCTCACGTATTCTGGAAGTTCATGGCGAGCGTATGATTAAACGCACCTTTAATCCGGGCTTCAAAATCGCTCTGCACCAGAAAGATCTCAACCTGGCAc < 1:429881/300‑1 (MQ=255) gtgtTCAACCGCTGTTTGAACTGCTCGGTAAAAACACCCACCTCGTGGGCGGTAACGGCGATGGTCAAACCTGCAAAGTGGCAAATCCGATTATCGTGGCGCTCAATATTGCAGCGGTTTCTGAAACCCTGCTCTTTTCTTCACAAACCGGTGCGGACCCGGTACGTGTGCGCCAGGCGCTGATGGGCGGCTTTGCTTCCTCACGTATTCTGGAAGTTCCTGGCGAGCGTATGATTAAACGCACCTTTCATCCGGGTTTCACAATCGCTCTGCACCAGAAAGATCTCAAACTTGCACTGc > 2:876573/1‑300 (MQ=255) 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CTGCTCGCCAGGTAACGGAAGCATCGGACATCATTTTTATTATGGTGCCGGACACACCTCAGGTTGAAGAAGTTCTGTTCGGTGAAAATGGTTGTACCAAAGCCTCGCTGAAGGGCAAAACCATTGTTGATATGAGCTCCATTTCCCCGATTGAAACTAAGCGTTTCGCTCGTCAGGTGAATGAACTGGGCGGCGATTATCTCGATGCGCCAGTCTCCGGCGGTGAAATCGGTGCGCGTGAAGGGACGTTGTCGATTATGGTTGGCGGTGATGAAGCGGTATTTGAACGTGTTAAACCGCTGTTTGAACTGCTCGGTAAAAATATCACCCTCGTGGGCGGTAACGGCGATGGTCAAACCTGCAAAGTGGCAAATCAGATTATCGTGGCGCTCAATATTGAAGCGGTTTCTGAAGCCCTGCTATTTGCTTCAAAAGCCGGTGCGGACCCGGTACGTGTGCGCCAGGCGCTGATGGGCGGCTTTGCTTCCTCACGTATTCTGGAAGTTCATGGCGAGCGTATGATTAAACGCACCTTTAATCCGGGCTTCAAAATCGCTCTGCACCAGAAAGATCTCAACCTGGCACTGCAA > NC_000913/536728‑537317 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |