Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,078,683 | C→T | intergenic (+245/‑608) | fabY → / → yiiE | putative fatty acid biosynthesis enzyme FabY/putative DNA‑binding transcriptional regulator YiiE |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,078,683 | 0 | C | T | 99.4% | 597.3 / NA | 165 | intergenic (+245/‑608) | fabY/yiiE | putative fatty acid biosynthesis enzyme FabY/putative DNA‑binding transcriptional regulator YiiE |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (81/83); minor base G (0/1); total (81/84) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
CCATTTGGCCCGTATGAAGAGGGCGGGAACGAAGAAGAGTAGCTGATGGAGAGGGGCGGTGCTGCCTCTCTCATTCAGGTCATTTATATTAGTCCTTGGCTATTTCGGTTATATTAAATAAGAACTCTATAAATTTTTATTCTTCGTTGGCTCCATACGTGTCTTGCTACATCACTGTTCAGGAGCATTTAAATATTATTTGTAGAACTGAGTGGCAATTATCGCAGATAATGCTTAATTCATCATCTTAGTTCATGTTTGAGCGATTTTTGATAGTCAAAACCCCCTCTGGTGCCATACTTTTCTCATAAATATTTTTAAAATCTATAGCTAACAAATATTATGCAAAGATAATGGACTAGCATCATTGTCAGTATCATTCATTTACTGCTCTGTATGTTATGAATAATTATGTTGTATGTTTGCTCTTAAACCGTGGGAAGGAGGCTATAATGGTTGCCAATATTAATCTCATTAAACAAGAAAGTTATTCTGTTGTTAATTTAGAAAAACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACC > NC_000913/4078397‑4078981 | ccATTTGGCCCGTATGAAGAGGGCGGGAACGAAGAAGAGTAGCTGATGGAGAGGGGCGGTGCTGCCTCTCTCATTCAGGTCATTTATATTAGTCCTTGGCTATTTCGGTTATATTAAATAAGAACTCTATAAATTTTTATTCTTCGTTGGCTCCATACGTGTCTTGCTACATCACTGTTCAGGAGCATTTAAATATTATTTGTAGAACTGAGTGGCAATTATCGCAGATAATGCTTAATTCATCATCTTAGTTCATGTTTGAGCGATTTTTGATAGTCAAAACCCCTTCTGGTGCCATAc < 1:671381/300‑1 (MQ=255) 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aaCCCCTTCTGGTGCCATACTTTTCTCATAAATATTTTTAAAATCTATAGCTAACAAATATTATGCAAAGATAATGGACTAGCATCATTGTCAGTATCATTCATTTACTGCTCTGTATGTTATGAATAATTATGTTGTATGTTTGCTCTTAAACCGTGGGAAGGAGGCTATAATGGTTGCCAATATTAATCTCATTAAACAAGAAAGTTATTCTGTTGTTAATTTAGAAAAACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTAc < 2:877435/300‑1 (MQ=255) cccctTCTGGTGCCATACTTTTCTCATAAATATTTTTAAAATCTATAGCTAACAAATATTATGCAAAGATAATGGACTAGCATCATTGTCAGTATCATTCATTTACTGCTCTGTATGTTATGAATAATTATGTTGTATGTTTGCTCTTAAACCGTGGGAAGGAGGCTATAATGGTTGCCAATATTAATCTCATTAAACAAGAAAGTTATTCTGTTGTTAATTTAGAAAAACAACTTTCACGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGCTGTTGGTAGTACTg > 2:574070/1‑300 (MQ=255) ccTCTGGTGCCATACTTTTCTCATAAATATTTTTAAAATCTATAGCTAACAAATATTATGCAAAGATAATGGACTAGCATCATTGTCAGTATCATTCATTTACTGCTCTGTATGTTATGAATAATTATGTTGTATGTTTGCTCTTAAACCGTGGGAAGGAGGCTATAATGGTTGCCAATATTAATCTCATTAAACAAGAAAGTTATTCTGTTGTTAATTTAGAAAAACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGAcc < 2:184905/300‑1 (MQ=255) | CCATTTGGCCCGTATGAAGAGGGCGGGAACGAAGAAGAGTAGCTGATGGAGAGGGGCGGTGCTGCCTCTCTCATTCAGGTCATTTATATTAGTCCTTGGCTATTTCGGTTATATTAAATAAGAACTCTATAAATTTTTATTCTTCGTTGGCTCCATACGTGTCTTGCTACATCACTGTTCAGGAGCATTTAAATATTATTTGTAGAACTGAGTGGCAATTATCGCAGATAATGCTTAATTCATCATCTTAGTTCATGTTTGAGCGATTTTTGATAGTCAAAACCCCCTCTGGTGCCATACTTTTCTCATAAATATTTTTAAAATCTATAGCTAACAAATATTATGCAAAGATAATGGACTAGCATCATTGTCAGTATCATTCATTTACTGCTCTGTATGTTATGAATAATTATGTTGTATGTTTGCTCTTAAACCGTGGGAAGGAGGCTATAATGGTTGCCAATATTAATCTCATTAAACAAGAAAGTTATTCTGTTGTTAATTTAGAAAAACAACTTTCCCGAACTGTTACCAACAAAATTATAACGATGAGCAAGTAAAGACCGGTTGGTGGCAGTACTGACC > NC_000913/4078397‑4078981 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |