| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,905,605 | C→T | intergenic (‑8/+126) | bglF ← / ← bglG | beta‑glucoside specific PTS enzyme II/BglG kinase/BglG phosphatase/transcriptional antiterminator BglG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 3,905,605 | 0 | C | T | 99.4% | 640.2 / NA | 175 | intergenic (‑8/+126) | bglF/bglG | beta‑glucoside specific PTS enzyme II/BglG kinase/BglG phosphatase/transcriptional antiterminator BglG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (109/65); total (109/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
AGATTACCTTTATCATCATTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTAATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTCACAATGTTATCTGCGCCCCCGACTCCTGCGACTATTTTTCTGGCTAACTCCGTCATAACTTGCCCTCTACCGCTTTGCGGCAAAACTCCAAAAAAAAACCTGAAAAAAACGGCCTGACGTGAATCAAGCAATTTTTTTCAGGTTTTGCCCGCTTAGTGCGGTAACAATCCTTTACTCAGTAATAATATTTCAGTGTTCTTTGCGCACGCGCTCTATATTTATGGCTAAAAACATAATCTCTGCGGGTGAAATTTTACGTTGATACTGCAAACCAATAAAAATGGCGATCCGTTCCGCACATTGCCATGCTTGCGGGTAATTTTGTTTTACTGCTTGTTGTAATGATTCATCACTATCG > NC_000913/3905311‑3905899 | tACCTTTATCATCATTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGTAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTNCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTAATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTCACAATGTTATCTGCGCCCCCGACTCCTGCGACTATTTTTCTNGCTAACTCCGTCATAACTTGCTCTCTACCGc < 2:632645/300‑1 (MQ=255) 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aaCTTGCTCTCTACCGCTTTGCGGCAAAACTNCAAAAAAAAACCTGAAAAAAACGGCCTGACGTGAATCAAGCAATTTTTTTCAGGTTTTGCCCGCTTAGTGCGGTAACAATCCTTTACTCAGTNATAATATTTAAGTGTTCTTTGCGCACGCGCTCTATATTTATGGCTAAAAACATAATCTCTGCGGGTGAAATTTTACGTTGATACTGCAAACCAATAAAAATGGCGATCCGTTCCGCACATTGCCATGCTTGCGGGTAATTTTGTTTTACTGCTTGTTGTAATGATTCAGCACTAt > 2:621219/1‑300 (MQ=255) aaCTTGCTCTCTACCGCTTTGCGGCAAAACTCCAAAAAAAAACCTGAAAAAAACGGCCTGACGTGAATCAAGCAATTTTTTTCAGGTTTTGCCCGCTTAGTGCGGTAACAATCCTTTACTCAGTAATAATATTTCAGTGTTCTTTGCGCACGCGCTCTATATTTATGGCTAAAAACATAATCTCTGCGGGTGAAATTTTACGTTGATACTGCAAACCAATAAAAATGGCGATCCGTTCCGCACATTGCCATGCTTGCGGGTAATTTTGTTTTACTGCTTGTTGTAATGATTCATCACTAt > 1:57918/1‑300 (MQ=255) cTTGCTCTCTACCGCTTTGCGGCAAAACTCCAAAAAAAAACCTGAAAAAAACGGCCTGACGTGAATCAAGCAATTTTTTTCAGGTTTTGCCCGCTTAGTGCGGTAACAATCCTTTACTCAGTAATAATATTTCAGTGTTCTTTGCGCACGCGCTCTATATTTATGGCTAAAAACATAATCTCTGCGGGTGAAATTTTACGTTGATACTGCAAACCAATAAAAATGGCGATCCGTTCCGCACATTGCCATGCTTGCGGGTAATTTTGTTTTACTGCTTGTTGTAATGATTCATCACTATCg < 1:771788/300‑1 (MQ=255) | AGATTACCTTTATCATCATTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTAATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTCACAATGTTATCTGCGCCCCCGACTCCTGCGACTATTTTTCTGGCTAACTCCGTCATAACTTGCCCTCTACCGCTTTGCGGCAAAACTCCAAAAAAAAACCTGAAAAAAACGGCCTGACGTGAATCAAGCAATTTTTTTCAGGTTTTGCCCGCTTAGTGCGGTAACAATCCTTTACTCAGTAATAATATTTCAGTGTTCTTTGCGCACGCGCTCTATATTTATGGCTAAAAACATAATCTCTGCGGGTGAAATTTTACGTTGATACTGCAAACCAATAAAAATGGCGATCCGTTCCGCACATTGCCATGCTTGCGGGTAATTTTGTTTTACTGCTTGTTGTAATGATTCATCACTATCG > NC_000913/3905311‑3905899 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |