| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 2,545,703 | C→T | intergenic (‑94/‑70) | murR ← / → murQ | DNA‑binding transcriptional dual regulator MurR/N‑acetylmuramic acid 6‑phosphate etherase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,545,703 | 0 | C | T | 99.3% | 495.1 / ‑4.4 | 136 | intergenic (‑94/‑70) | murR/murQ | DNA‑binding transcriptional dual regulator MurR/N‑acetylmuramic acid 6‑phosphate etherase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (66/69); total (67/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.93e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
CAGTAAATCCTTGCGCGCCGAGTTTTTGGGCAAATTTCACTATGCTCGACTGGCTAATGCCGAGCTGTTTCGCCATCTGCCGTGAAGAAACGGATTGCAGCTCACTCACGTTGGCCTGCAGAAAGTCAGCGATTTTTTGCTCGTTTTCGGTGAATTCACTCCCCGCATTGCTTATTTTCGTCAGGTACAACATCTTCCACTCTCCTGGGCTGGCAGCATAAATTCCGCTTAAGTTCTTATGACGCTCTTCACACTCTGCGAGTGTAGACTCAATGATTCCTTTAAGCCTGTCAATTCGGGATATATGATTCCATACATCTGCAATTATTTGATCGTAAATAGTAAGGTCACCACCGATGCAATTTGAAAAGATGATTACTGAAGGCTCGAACACCGCCTCGGCTGAAATTGACCGCGTATCGACGCTGGAAATGTGCCGGATTATCAACGATGAAGATAAAACCGTACCGCTTGCCGTTGAGCGCGTACTGCCGGATATCGCCGCGGCGATCGATGTTATCCACGCCCAGGTAAGCGGCGGCGGGCGTCTGATTTACCTCGGTGCGGGAACATCC > NC_000913/2545417‑2545991 | cAGTAAATCCTTGCGCGCCGAGTTTTTGGGCAAATTTCACTATGCTCGACTGGCTAATGCCGAGCTGTTTCGCCATCTGCCGTGAAGAAACGGATTGCAGCTCACTCACGTTGGCCTGCAGAAAGTCAGCGATTTTTTGCTCGTTTTCGGTGAATTCACTCCCCGCATTGCTTATTTTCGTCAGGTACAACATCTTCCACTCTCCTGGGCTGGCAGCATAAATTCCGCTTAAGTTCTTATGACGCTCTTCACACTCTGCGAGTGTAGACTCAATGATTCCTTTAAGTCTGTCAATTCggg > 2:35565/1‑300 (MQ=255) 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cAATGATTCCTTTAAGTCTGTCAATTCGGGATATATGATTCCATACATCTGCAATTATTTGATCGTAAATAGTAAGGTCACCACCGATGCAATTTGAAAAGATGATTACTGAAGGCTCGAACACCGCCTCGGCTGAAATTGACCGCGTATCGACGCTGGAAATGTGCCGGATTATCAACGATGAAGATAAAACCGTACCGCTTGCCGTTGAGCGCGTACTGCCGGATATCGCCGCGGCGATCGATGTTATCCACGCCCAGGTAAGCGGCGGCGGGCGTCTGATTTACCTCGGTGCGGGaa < 2:500938/300‑1 (MQ=255) cAATGATTCCTTTAAGTCTGTCAATTCGGGATATATGATTCCATACATCTGCAATTATTTGATCGTAAATAGTAAGGTCACCACCGATGCAATTTGAAAAGATGATTACTGAAGGCTCGAACACCGCCTCGGCTGAAATTGACCGCGTATCGACGCTGGAAATGTGCCGGATTATCAACGATGAAGATAAAACCGTACCGCTTGCCGTTGAGCGCGTACTGCAGGATATCGCAGCGGCGATCGATGTTATCCACGCACAGGTAATCGGCGGCGGGCGTCTGATCTACCTAGGTGCGGGaa > 2:229984/1‑300 (MQ=255) aaTGATTCCTTTAAGTCTGTCAATTCTGGATATATGATTCCATACATCTGCAATTATTTGATCGTAAATAGTAAGGTCACCACCGATGCAATTTGAAAAGATGATTACTGAAGGCTCGAACACCGCCTCGGCTGAAATTGACCGCGTATCGACGCTGGAAATGTGCCGGATTATCAACGATGAAGATAAAACCGTACCGCTTGCCGTTGAGCGCGTACTGCCGGATATCGCCGCGGCGATCGATGTTATCCACGCCCAGGTAAGCGGCGGCGGGCGTCTGATTTACCTCGGTGCGGGAAc < 1:666457/300‑1 (MQ=255) 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CAGTAAATCCTTGCGCGCCGAGTTTTTGGGCAAATTTCACTATGCTCGACTGGCTAATGCCGAGCTGTTTCGCCATCTGCCGTGAAGAAACGGATTGCAGCTCACTCACGTTGGCCTGCAGAAAGTCAGCGATTTTTTGCTCGTTTTCGGTGAATTCACTCCCCGCATTGCTTATTTTCGTCAGGTACAACATCTTCCACTCTCCTGGGCTGGCAGCATAAATTCCGCTTAAGTTCTTATGACGCTCTTCACACTCTGCGAGTGTAGACTCAATGATTCCTTTAAGCCTGTCAATTCGGGATATATGATTCCATACATCTGCAATTATTTGATCGTAAATAGTAAGGTCACCACCGATGCAATTTGAAAAGATGATTACTGAAGGCTCGAACACCGCCTCGGCTGAAATTGACCGCGTATCGACGCTGGAAATGTGCCGGATTATCAACGATGAAGATAAAACCGTACCGCTTGCCGTTGAGCGCGTACTGCCGGATATCGCCGCGGCGATCGATGTTATCCACGCCCAGGTAAGCGGCGGCGGGCGTCTGATTTACCTCGGTGCGGGAACATCC > NC_000913/2545417‑2545991 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |