| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,068,504 | 0 | C | T | 98.7% | 525.5 / NA | 149 | intergenic (‑1219/‑131) | insH6/yoeA | IS5 family transposase and trans‑activator/TonB‑dependent receptor plug domain‑containing protein YoeA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base T (86/60); total (88/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.15e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
CATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGTCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCAGACACCATTTTTTCAACTCCGTTTTCCACGGACCGCACTCTTATGTCAAGAGTGCGGTCCGTGGATACAACCAGAGACCGACTGACACGAGTCAGAGGAAACGACGGATATGTTCAGTCGTAAAATATCTATCAAAAAACATGATTAAGGTCAAAAATGTTTGATATTTACAATTTATGAAGATGACAATAATTATAGATATATGAGAACATAAATGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCTTTCCACTCTGTCATTATGCATTTCTGGGATAGTTTCTACTGCAACCGCAACTTCTTCAGAAACAAAAATCAGCAACGAAGAGACGCTCGTCGTGACCACGAATCGTTCGGCAAGCAACCTTTGGGA > NC_000913/2068216‑2068795 | cATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGTCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATNCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCAGACACCATTTTTTCAACTCCGTTTTCCACGGACCGCACTCTTATGTCAAGAGTGCGGTCCGTGGATACAACCAGAGACCGACTGACACGAGTCAGAGGAAACGACGGATATGTTCAGTCGTAAAATATCTATCAAAAAATATGATTAAGGt < 2:773040/300‑1 (MQ=255) 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gTAAAATATCTATCAAAAAATATGATTAAGGTCAAAAATGTTTGATATTTACAATTTATGAAGATGACAATAATTATAGATATATGAGAACATAAATGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCTTTCCACTCTGTCATTATGCATTTCTGGGATAGTTTCTACTGCAACCGCAACTTTTTCAGAAACAAAAATCAGCAACGAAGAGACGCTCGTCGTGACCACGAATCGTTCGgcaag > 1:817271/1‑300 (MQ=255) tcAAAANATATGATTAAGGTCAAAAATGTTTGATATTTACAATTTATGAAGATGNCAATAATTATAGATATATGAGAACATAAATGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATGATATACCTTGTCGAATTTATATCCTTTCCACTCTGTCATTATGCATTTCTGGGATAGTTTCTACTGCAACCGCAACTTTTTCAGAAACAAAAATCAGCAACGAAGAGACGCTCGTCGTGACCACGAATCGTTCGGCAAGCAACCTTTGGGa < 2:745150/300‑1 (MQ=255) tcAAAAAATATGATTAAGGTCAAAAATGTTTGATATTTACAATTTATGAAGATGACAATAATTATAGATATAGGAGAACATAAATGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCTTTCCACTCTTTCATTATGCATTTCTGGGATAGTTTCTACTGCAACCGCAACTTTTTCAGAAACAAAAATCAGCAACGAATAGATGCTCGTCGTGACCACGAATCGTTCGGCAAGCAACCTTTGGGa < 1:794361/300‑1 (MQ=255) | CATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGTCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCAGACACCATTTTTTCAACTCCGTTTTCCACGGACCGCACTCTTATGTCAAGAGTGCGGTCCGTGGATACAACCAGAGACCGACTGACACGAGTCAGAGGAAACGACGGATATGTTCAGTCGTAAAATATCTATCAAAAAACATGATTAAGGTCAAAAATGTTTGATATTTACAATTTATGAAGATGACAATAATTATAGATATATGAGAACATAAATGAAAATAATTATCATTACAGTAATCATTTGTACTTTGTATTAATGAGGGATGAAATGTTATATAATATACCTTGTCGAATTTATATCCTTTCCACTCTGTCATTATGCATTTCTGGGATAGTTTCTACTGCAACCGCAACTTCTTCAGAAACAAAAATCAGCAACGAAGAGACGCTCGTCGTGACCACGAATCGTTCGGCAAGCAACCTTTGGGA > NC_000913/2068216‑2068795 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |