| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 780918 | 54 (0.470) | 9 (0.110) | 9/446 | 5.7 | 19.1% | noncoding (76/76 nt) | lysW | tRNA‑Lys |
| ? | NC_000913 | 781445 = | 36 (0.420) | intergenic (+1/‑132) | lysZ/lysQ | tRNA‑Lys/tRNA‑Lys | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATACTCAAAGA > NC_000913/781154‑781704 | tAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTGAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAgg < 1:505996/300‑1 (MQ=255) aGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGCCTCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCACCGAGCAAAAATCCTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTCCAGGTGGTTa > 1:95433/1‑300 (MQ=255) gTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGACCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCATATGGGTCGCTCGCTCAGTCGGTAGAACAGTTGACTTCTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGAACCAACAATTTAAAGGTGGTTAc > 1:314101/1‑300 (MQ=25) agCAGTTTACTTTTAATCAATTGTTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAATGCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAAATTGGCCCCGATTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGTACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTagag < 1:113458/300‑1 (MQ=255) agCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTagag < 1:362738/300‑1 (MQ=255) agCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACGCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTagag < 1:90001/300‑1 (MQ=255) aCTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGaa < 1:216975/300‑1 (MQ=255) ggTCGCGGGTTCGAATCCTGCGCTATCCACCAGTTTTAACATCAAACGTAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAATCATCCTGTACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATTTTTCGTGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGt < 1:145106/300‑1 (MQ=38) aGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATTTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGGAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCaa < 1:870800/300‑1 (MQ=255) ggTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTCAACATCTTTAAGGTCACACCCGTCTGGGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGATCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGCACCACTAATTTAAAGGTGGTCACT‑GGTAGAGAA‑TGTGAGGGATAACGTTGCGTTAGCAAc > 2:868220/1‑300 (MQ=37) aCCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGTGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGTTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCGGCACGACCCACCAATTTAAAGTTTGTGACT‑GGGGGAGAA‑CGTTAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGAc < 1:392297/300‑1 (MQ=38) aCCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGAc > 1:83828/1‑300 (MQ=255) tcaGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTGAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGt < 1:228128/299‑1 (MQ=255) gTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCAGAGTAAACATCTTTCAGGTAACACCCGTCTGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGACGGGCGAGACGAAGTCGa > 1:476555/1‑300 (MQ=255) aaCTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGTGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCAc < 1:199686/300‑1 (MQ=255) gAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCGGCACGACCCACCACTCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACANCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATg < 1:638046/300‑1 (MQ=255) ggATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGTTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAACTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCATTAGCAATGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCCTCCTACACGACCCACCATCCTGAATGAtt > 1:440353/1‑300 (MQ=255) aCGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGgc < 1:842416/300‑1 (MQ=255) gagcgaAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCt > 1:694741/1‑300 (MQ=255) agcgaagcgaGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGNCTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAATGGGTCGTTAGCTc < 1:594325/300‑1 (MQ=255) aGTCATCCTGTACGACCCCCCACTCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCCTTNCGTTAACACCCCTATGGGTTGGTAGTTCAGTTGGTAGAGAGGTTTACTTGTGAT‑AAATGGTGTGTAGGGTTGAATCCTGCGCGACCCATCGATGTGTAGATGGTGACT‑GGGATGGGA‑CGTGGGGGGGAGCGTTGTGTTAGCAACGGTTCGAGGGGTGAGATGGAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACNATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTag < 2:827317/300‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGCAGGGAGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCa > 1:510483/1‑300 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGAGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCa > 1:510543/1‑300 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGACGGTTACT‑AGCAGAGCA‑CGTGCAGGATCCCATTGCGTTAGCAACGACCCAACGAGCAAGACGCAGTCGAGTCATCCTGCACCACCCACCATACTAACTGCTTAAGGCAGCATAATCCAGAAAGGGGTTGTTCGCTCAGTCGGTAGCGCa > 1:40045/1‑300 (MQ=25) cTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGtt > 1:428158/1‑300 (MQ=255) cGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCACGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACtt > 2:801738/1‑300 (MQ=255) aaCCCACCAATCTTAAAAACTGGTTCCGAGGAAAAAGCTTTCATGGACAACCCGTATGGGGCGGTAGCTCAGGTGGTAGAGCAGGTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCGGGTTCGAAGCCTGCACGACCCACCAACTTAAAGGTGGGTATT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGAGAACGTTGCGTTAGCAGCGGCCCGGAGGGCTAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACttt < 2:370225/299‑1 (MQ=25) aaTCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAt > 1:208368/1‑300 (MQ=255) ccGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAAt < 1:882758/300‑1 (MQ=255) tgccgacctacgaagaagcaattgcacGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAATTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGAc < 2:797763/274‑1 (MQ=37) tcatcacccaccactcggttCGTTAGCTCATTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGTT‑CGCAGGTTCGACTCTTGCACGACCCACCATTTTTAACATC‑AAACTCAGATGTGAAGCGGGAAGGATAGCGTTGTGCCAGCAATGGCTCGTGGGGCGAG‑CGAAG‑CGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCaa < 1:848041/281‑1 (MQ=2) aGGTAACACTCGTATTGTTCGTTAGCTCAGTTGTTAAAGCAGTTGACTTGTAATTAATTGGT‑CGAAGGGTCGAGTCATGCGCGACCCATCACTTTAAGTGTGGTTGCT‑AGGAGAGAG‑CGTGAATGATAACGTTGCATTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGGAGTAGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGGATGAGTAATTCAGCATAACCACGCAATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCaa < 2:260980/300‑1 (MQ=19) aGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTTACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCTAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCaa < 1:245346/300‑1 (MQ=255) ggTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCACGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCACCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCCGGTTCGAATCCTGCACGACccacccct > 2:768131/1‑297 (MQ=255) cacCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGCGCAGTTGACTTTTAATCAAGTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTaaa > 2:761185/1‑300 (MQ=255) cacCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTaaa > 1:701894/1‑300 (MQ=255) cccGTGTGGGTCGTTAGCTCGGTTGTTATAGCAGTTGACTTTTAATTAATTGGT‑CGCAGGTGCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGAGAACGTTGCGTTAGCAACGGCTCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTaaaaa < 1:282281/300‑1 (MQ=38) cccGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTCATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTaaaaa > 1:841567/1‑300 (MQ=255) gTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATACCGTTGCGTTAGCAACGGCACGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGAANCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAgagcacca > 2:223757/1‑293 (MQ=255) gTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAACGCCCTAAAGGCGCttttt > 1:485978/1‑300 (MQ=255) ggTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCAGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGCATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTCAAGGCGCTTTTTTGc > 1:744807/1‑300 (MQ=255) taacgcatttGACTCTTAATCAATCTGT‑CGCAGATTCGAATCCCGAACGACTCAATAATTGAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAAAA‑CGTGAAGGACAACATTGCGTTAGCGACGGCCCGAAGGGCGAGACTACATCAATTCACCCTGCGCAACCCACCATCCTGAGAAAGTAATGCAACATAATCCCACAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTa < 2:503094/292‑1 (MQ=12) tAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATCGTT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAGGGTGGGTACT‑GTTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCAGAAGGGAGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATGAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTa < 2:503151/300‑1 (MQ=37) gTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGCGAA‑CGTGAAAGATACCGTTGCGTCAGCAACGGCCCGAAGGACGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAGTCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCACTTGGTCATCGGTTCGAATCCTGCACGACTCACCCCTGTAAAGAAGCGCCATAAAGGCGGCTTTTTGCTAGCTGCGa > 2:161630/1‑300 (MQ=37) aaTCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCACCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGGTGACTTTTAATCAATTGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATACTCAAAGa < 1:91603/300‑1 (MQ=255) | TAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCAATCTTAAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT‑CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACT‑GGTAGAGAA‑CGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCATCCTGAATGATTAAGGCAGCATAATCCCGCAAGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTTGCTATCTGCGATACTCAAAGA > NC_000913/781154‑781704 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |