| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 2,470,639 | IS2 (–) +5 bp | coding (1‑5/147 nt) | yodE ← | toxic protein YodE |
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| * | ? | NC_000913 | = 2470643 | 6 (0.060) | 90 (0.880) | 65/598 | 0.3 | 93.7% | coding (1/147 nt) | yodE | toxic protein YodE |
| ? | NC_000913 | 2996361 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
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GATTTAAGCAAGCATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATAACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCTGATTG > NC_000913/2470340‑2470932 | ttgaagnaagcATTTATTTGGAATGTATTTTTCGTTCGACCTTTGCTTATACATNACAGTCGTTTTTTTAATTTATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCACACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGccc < 2:671208/297‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |