| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
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ttCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcnccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaaccaggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatgaatggcgttggatgccggg > 2:209435‑M1/1‑43 (MQ=255) gcTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATCCGATGAAACAGAGTAAAAACAAGCCACGAATTCGCCAGGCGGTTGGAGCCACCCGGCAATGTCGTAAACCACAGGCTTAAACTTCAACTTGGTAGCCTGTATCTTCCAGTGTGGGATTCATCGCCGCGGCACGAGCCAGTTCATCACAGCGTTCGTTTTCCGGGTGTCCGGCATGGCCTTTAACCCATTCCCATTTGATTTGATGCTGCCCCAATGCAGCATCAAGACGTTGCCAGGGATc > 2:372358/1‑300 (MQ=255) gCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATCCGATGAAACAGAGTAAAAACAAGCCACGAATTCGCCAGGCGGTTGGAGCCACCCGGCAATGTCGTAAACCACAGGCTTAAACTTCAACTTGGTAGCCTGTATCTTCCAGTGTGGGATTCATCGCCGCGGCACGAGCCAGTTCATCAAAGCGTTCGTTTTCCGGGTGTCCGGCATGGCCTTTAACCCATTCCCATTTGATTTGATGCTGCCCCAATGCAGCATCAAGACGTTGCCAGAGATCGACAtttt > 1:439659/1‑300 (MQ=255) 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ATCCGCATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATCCGATGAAACAGAGTAAAAACAAGCCACGAATTCGCCAGGCGGTTGGAGCCACCCGGCAATGTCGTAAACCACAGGCTTAAACTTCAACTTGGTAGCCTGTATCTTCCAGTGTGGGATTCATCGCCGCGGCACGAGCCAGTTCATCACAGCGTTCGTTTTCCGGGTGTCCGGCATGGCCTTTAACCCATTCCCATTTGATTTGATGCTGCCCCAATGCAGCATCAAGACGTTGCCAGAGATCGACATTTTTTACTGGTTTTTTGTCTGC > NC_000913/235129‑235726 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |