| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 4,123,637 | IS150 (+) +4 bp | coding (817‑820/1026 nt) | cytR ← | DNA‑binding transcriptional repressor CytR |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3720633 = | NA (NA) | 133 (1.310) | 89/598 | 0.0 | 100% | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4123640 | 0 (0.000) | coding (817/1026 nt) | cytR | DNA‑binding transcriptional repressor CytR | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3722075 | NA (NA) | 104 (1.020) | 70/598 | 0.2 | 100% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4123637 = | 0 (0.000) | coding (820/1026 nt) | cytR | DNA‑binding transcriptional repressor CytR | |||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
TGATTAAGGGACATGTGCTGCTCGATCACAGCTTTCACGACCTTAATACGCAACTCTGGATCAGCACTAACGCCTTTAGGTTTGGGAATTAAACCTTTTTCTCCATGTTTTTCATAGAGGGCAACCCATGTCCTGACCTGGGTTCGGGGGACACCAAAACGTGCCGAGATGATCCTGTAACCATCATCAGTTGTGAAGTAGTGATTCACGACTTCAAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3720930‑3720633‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAAGACCTTTCCATAATCGGTTTTGATAACATCGACCTGACGCAATTTTGTGATCCGCCGCTGACAACCATCGCGCAGCCGCGTTACGAAATCGGTCGGGAAGCTATGCTGTTATTGCTTGATCAAATGCAGGGGCAACACGTTGGCAGTGGCTCTCGTTTAATGGACTGCGAACTTATCATCCGGGGATCAACACGCGCGTTACCTTAAAGTAAACCTTTAAGACTGCCGTGACTGGTCAAAGGCCCGCCGCTTAAGTAACATGGCGGGCTGACGAACGAATAAATACAGCGAAACG < NC_000913/4123640‑4123343 GATTAAGGGACATGTGCTGCTCGATCACAGCTTTCACGACCTTAATACGCAACTCTGGATCAGCACTAACGCCTTTAGGTTTGGGAATTAAACCTTTTTCTCCATGTTTTTCATAGAGGGCAACCCATGTCCTGACCTGGGTTCGGGGGACACCAAAACGTGCCGAGATGATCCTGTAACCATCATCAGTTGTGAAGTAGTGATTCACGACTTCAAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACAGAA > 1:381532/1‑300 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GTACAGAAGACCTTTCCATAACCGGTTTTAATAACATCGACCTGACGCAATTTTGTGATCCGCCGCTGACAACCATCGCGCAGCCGCGTTACGAAATCGGTCGGGAAGCTATGCTGTTATTGCTTGATCAAATGCAGGGGCAACACGTTGGCAGTGGCTCTCGTTTAATGGACTGCGAACTTATCATCCGGGGATCAACACGCGCGTTACCTTAACGTAAACCTTTAAGACTGCCGTGACTGGTCACAGGCCCGCCGCTTAAGTAACATGGCGGGCTGACGAACGAATAAATACAACGAA > 1:756842/1‑300 ACAGAAGACCTTTCCATAATCGGTTTTGATAACATCGACCTGACGCAATTTTGTGATCCGCCGCTGACAACCATCGCGCAGCCGCGTTACGAAATCGGTCGGGAAGCTATGCTGTTATTGCTTGATCAAATGCAGGGGCAACACGTTGGCAGTGGCTCTCGTTTAATGGACTGCGAACTTATCATCCGGGGATCAACACGCGCGTTACCTTAAAGTAAACCTTTAAGACTGCCGTGACTGGTCAAAGGCCCGCCGCTTAAGTAACATGGCGGGCTGACGAACGAATAAATACAGCGAAAC > 1:423465/1‑300 ACAGAAGACCTTTCCATAATCGGTTTTGATAACATCGACCTGACGCAATTTTGTGATCCGCCGCTGACAACCATCGCGCAGCCGCGTTACGAAATCGGTCGGGAAGCTATGCTGTTATTGCTTGATCAAATGCAGGGGCAACACGTTGGCAGTGGCTCTCGTTTAATGGACTGCGAACTTATCATCCGGGGATCAACACGCGCGTTACCTTAAAGTAAACCTTTAAGACTGCCGTGACTGGTCAAAGGCCCGCCGCCTAAGTAACATGGCGGGCTGACGAACGAATAAATACAGCGAAAC > 2:348262/1‑300 TGATTAAGGGACATGTGCTGCTCGATCACAGCTTTCACGACCTTAATACGCAACTCTGGATCAGCACTAACGCCTTTAGGTTTGGGAATTAAACCTTTTTCTCCATGTTTTTCATAGAGGGCAACCCATGTCCTGACCTGGGTTCGGGGGACACCAAAACGTGCCGAGATGATCCTGTAACCATCATCAGTTGTGAAGTAGTGATTCACGACTTCAAGGCGCTTTTCAAAAGGGTATTTTGGCTTTGACATATTAGGGGCTATTCCATTTCATCGTCCAACAAAATGGGTGCAGTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3720930‑3720633‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAAGACCTTTCCATAATCGGTTTTGATAACATCGACCTGACGCAATTTTGTGATCCGCCGCTGACAACCATCGCGCAGCCGCGTTACGAAATCGGTCGGGAAGCTATGCTGTTATTGCTTGATCAAATGCAGGGGCAACACGTTGGCAGTGGCTCTCGTTTAATGGACTGCGAACTTATCATCCGGGGATCAACACGCGCGTTACCTTAAAGTAAACCTTTAAGACTGCCGTGACTGGTCAAAGGCCCGCCGCTTAAGTAACATGGCGGGCTGACGAACGAATAAATACAGCGAAACG < NC_000913/4123640‑4123343 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |