| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,983,656 | C→T | R233R (CGC→CGT) | aslB → | putative anaerobic sulfatase maturation enzyme AslB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,983,656 | 0 | C | T | 99.1% | 388.1 / ‑4.7 | 105 | R233R (CGC→CGT) | aslB | putative anaerobic sulfatase maturation enzyme AslB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (64/40); total (64/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.90e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.74e-01 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GAGATCCACAATCAATATCGCGTGACTAAAGGTGGCAGACCCACGCATAAGCTGGTGATGCGTGCCCTGACGCTCCTGCAAAAACATCATGTCGACTATAACGTGCTGGTCTGCGTTAATCGCACCAGCGCGCAGCAACCGTTGCAGGTATATGATTTTTTGTGCGATGCGGGAGTCGAATTCATCCAGTTTATTCCGGTGGTCGAGCGCCTGGCTGATGAAACAACTGCCCGCGATGGACTTAAGTTACATGCGCCTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCTGTGATCACTATGTTTATCCGCAATATCGGCTGGGGAATATGCACCAGCAAACAATTGCAGAAATGATCGATTCCCCGCAACAGCAGGCGTTTGGTGAAGATAAATT > NC_000913/3983360‑3983952 | tCCACAATCAATATCGCGTGACTAAAGGTGGCAGACCCACACATAAGCTGGTGATGCGTGTCCTGACACTCCTGCAAAAACATCATGTCGACTATAACGTGCTGGTCTGCGTTAATCGCACCAGCGCGCAGCAACCGTTGCAGGTATATGATTTTTTGTGCGATGCGGGAGTCGAATTCATCCAGTTTATTCCGGTGGTCGAGCGCCTGGCTGATGAAACAACTGCCCGCGATGGACTTAAGTTACATGCGCCTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGTCCCgagg < 2:314187/300‑1 (MQ=255) 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ggTCGGTGCGTCCAGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCAATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCTGTGATCACTATGTTTATCCGCAATATCGGTTGGGGAATATGCACCCGTCAACAATTGCAGAAATGATCGATTCCCCGCAACAGCAGGCGTTTGGTgcag > 2:375151/1‑297 (MQ=255) gTCGGTGCGTCCCGAGGAGTTCGGTGGGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCTGTGATCACTATGTTTATCCGCAATATCGGCTGGGGAATATGCACCAGCAAACAATTGCAGAAATGATCGATTCCCCGCAACAGCAGGCGTTTGGTGCAGa > 1:463731/1‑300 (MQ=255) gTGCGTCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCTGTGATCACTATGTTTATCCGCAATATCGGCTGGGGAATATGCACCAGCAAACAATTGCAGAAATGATCGATTCCCCGCAACAGCAGGCGTTTGGTGAAGATaaa > 1:578057/1‑300 (MQ=255) gTGCGTCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCTGTGATCACTATGTTTATCCGCAATATCGGCTGGGGAATATGCACCAGCAAACAATTGCAGAAATGATCGATTCCCCGCAACAGCAGGCGTTTGGTGAAGATaaa > 2:875009/1‑300 (MQ=255) gTGCGTCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCTGTGATCACTATGCTTATCCGCAATATCGGCTGGGGAATATGCACCAGCAAACAATTGCAGAAATGATCGATTCCCCGCAACAGCAGGCGTTTGGTGAAGATaaa > 1:270079/1‑300 (MQ=255) gcgcCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATGCGACTACTGGAGCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGGGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCTGTGATCACTATGTTTATCCGCAATATCGGCTGGGGAATATGCACCAGCAAACAATTGCAGAAATGATCGATTCCCCGCAACAGCAGGCGTTTGGTGAAGATAAAtt < 2:131410/300‑1 (MQ=255) | GAGATCCACAATCAATATCGCGTGACTAAAGGTGGCAGACCCACGCATAAGCTGGTGATGCGTGCCCTGACGCTCCTGCAAAAACATCATGTCGACTATAACGTGCTGGTCTGCGTTAATCGCACCAGCGCGCAGCAACCGTTGCAGGTATATGATTTTTTGTGCGATGCGGGAGTCGAATTCATCCAGTTTATTCCGGTGGTCGAGCGCCTGGCTGATGAAACAACTGCCCGCGATGGACTTAAGTTACATGCGCCTGGTGATATTCAGGGTGAGCTAACGGAATGGTCGGTGCGCCCCGAGGAGTTCGGTGAGTTTCTGGTGGCGATATTCGACCACTGGATCAAACGCGACGTCGGCAAGATTTTCGTGATGAATATCGAATGGGCGTTTGCCAATTTTGTCGGTGCGCCGGGTGCGGTTTGCCATCATCAGCCAACCTGTGGGCGCTCGGTGATTGTTGAGCACAACGGCGACGTTTACGCCTGTGATCACTATGTTTATCCGCAATATCGGCTGGGGAATATGCACCAGCAAACAATTGCAGAAATGATCGATTCCCCGCAACAGCAGGCGTTTGGTGAAGATAAATT > NC_000913/3983360‑3983952 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |