| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1186387 = | 87 (0.800) | 13 (0.120) | 12/596 | 6.9 | 13.0% | coding (544/1227 nt) | pepT | peptidase T |
| ? | NC_000913 | = 1186391 | 88 (0.810) | coding (548/1227 nt) | pepT | peptidase T | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
ATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGTTCCCGGTGCTGCATCAGCTACTGGGTCAGACGCTGATTACCACCGATGGTAAAACCTTGTTAGGTGCCGATGACAAAGCAGGTATTGCAGAAATCATGACCGCGCTGGCGGTATTGCAACAGAAAAAAATTCCGCATGGTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACAT‑‑‑‑‑TTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACACTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATGTTCATCCGGGCACGGCGAAAGGAGTGATGGTAAATGCGCTGTCGCTGGCGGCACGTATTCATGCGGAAGTTCCGGCGGATGAAAGCCCGGAAATGACAGAAGGCTATGAAGGTTTCTATCATCTGGCGAGCATGAAAGGCACCGTTGAACGGGCCGATATGCACTACATCATCCGTGATTTC > NC_000913/1186109‑1186689 | aTGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGTTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGTTCCCGGTGCTGCATCAGCTACTGGGTCAGACGCTGATTACCACCGATGGTAAAACCTTGTTAGGTGCCGATGACAAAGCAGGTATTGCAGAAATCATGACCGCGCTGGCGGTATTGCAACAGAAAAAAATTCCGCATGGTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACAT‑‑‑‑‑TTTGATGTTGACGCCTTCGATg < 2:516273/300‑1 (MQ=255) gtgAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGTTCCCGGTGCTGCATCAGCTACTGNGTCAGACGCTGATTACCACCGATGGTAAAACCTTGTTAGGTGCCGATGACAAAGCAGGTATTGCAGAAATCATGACCGCGCTGGCGGTATTGCAACAGAAAAAAATTCCGCATGGTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACAT‑‑‑‑‑TTTGATGTTGACGCCTTCGATGcc < 2:791213/300‑1 (MQ=255) gCAAGTTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGANGTTTTATCACCGGTTATGTTCCCGGTGCTGCATCAGCTACTGGTTCAGACGCTGATTACCACCGATGTTAAAACCTTGTTAGGTGCCGATGACAAAGCAGGTATTGCAGAAATCATGACCGCGCTGGCGGTATTGCAACAGAAAAAAATTCCGCATGGTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGANGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACAT‑‑‑‑‑TTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCACTGGGc < 2:824143/300‑1 (MQ=255) gCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGTTCCCGGTGCTGCATCAGCTACTGGGTCAGACGCTGATTACCACCGATGGTAAAACCTTGTTAGGTGCCGATGACAAAGCAGGTATTGCAGAAATCATGACCGCGCTGGCGGTATTGCAACAGAAAAAAATTCCGCATGGTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACAT‑‑‑‑‑TTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGc < 1:521249/300‑1 (MQ=255) aaaTTGTTGAAAACTATCGCGGTGTCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGTTTATGTTCCCGGTGCTGCATCAGCTACTGGGTCAGACGCTGATTACCACCGATGGTAAAACCTTGTTAGGTGCCGATGACAAAGCAGGTATTGCAGAAATCATGACCGCGCTGGCGGTATTGCAACAGAAAAAAATTCCGCATGGTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACAT‑‑‑‑‑TTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCtt < 1:676340/300‑1 (MQ=255) tttttgAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGTTCCCGGTGCTGCATCAGCTACTGGGTCAGACGCTGATTACCACCGATGGTAAAACCTTGTTAGGTGCCGATGACAAAGCAGGTATTGCAGAAATCATGACCGCGCTGGCGGTATTGCAACAGAAAAAAATTCCGCATGGTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACATTTTGATTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGc < 1:213271/297‑1 (MQ=255) ttgttgAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTAGCACCGGTTATGTTCCCGGTGCTGCATCAGCTACTGGGTCAGACGCTGATTACCACCGATGGTAAAACCTTGTTAGGTGCCGATGACAAAGCAGGTATTGCAGAAATCATGACCGCGCTGGCGGTATTGCAACAGAAAAAAATTCCGCATGGTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACAT‑‑‑‑‑TTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTaca > 2:808630/1‑300 (MQ=255) ttttgAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGTTCCCGGTGCTGCATCAGCTACTGGGTCAGACGCTGATTACCACCGATGGTAAAACCTTGTTAGGTGCCGATGACAAAGCAGGTATTGCAGAAATCATGACCGCGCTGGCGGTATTGCAACAGAAAAAAATTCCGCATGGTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACAT‑‑‑‑‑TTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTacac < 1:210398/298‑1 (MQ=255) tgttgAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGTTCCCGGTGCTGCATCAGCTACTGGGTCAGACGCTGATTACCACCGATGGTAAAACCTTGTTAGGTGCCGATGACAAAGCAGGTATTGCAGAAATCATGACCGCGCTGGCGGTATTGCAACAGAAAAAAATTCCGCATGTTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACAT‑‑‑‑‑TTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTacac < 2:399776/300‑1 (MQ=255) tgttgAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGTTCCCGGTGCTGCATCAGCTACTGGGTCAGACGCTGATTACCACCGATGGTAAAACCTTGTTAGGTGCCGATGACAAAGCAGGTATTGCAGAAATCATGACCGCGCTGGCGGTATTGCAACAGAAAAAAATTCCGCATGTTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACAT‑‑‑‑‑TTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTacac < 1:210415/300‑1 (MQ=255) tgttgAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGTTCCCGGTGCTGCATCAGCTACTGGGTCAGACGCTGATTACCACCGATGGTAAAACCTTGTTAGGTGCCGATGACAAAGCAGGTATTGCAGAAATCATGACCGCGCTGGCGGTATTGCAACAGAAAAAAATTCCGCATGGTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACAT‑‑‑‑‑TTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTacac < 1:65556/300‑1 (MQ=255) tgttgAAAACTAGCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGTTCCCGGTGCTGCATCAGCTACTGGGTCAGACGCTGATTACCACCGATGGTAAAACCTTGTTAGGTGCCGATGACAAAGCAGGTATTGCAGAAATCATGACCGCGCTGGCGGTATTGCAACAGAAAAAAATTCCGCATGGTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACAT‑‑‑‑‑TTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTacac < 2:166191/300‑1 (MQ=255) gcTATCGCGTTGTCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGTTCCCGGTGCTGCATCAGCTACTGGGTCAGACGCTGATTACCACCGATGGTAAAACCTTGTTAGGTGCCGATGACAAAGCAGGTATTGCAGAAATCATGACCGCGCTGGCGGTATTGCAACAGAAAAAAATTCCGCATGGTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACAT‑‑‑‑‑TTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACACTGTTGAtg < 2:71246/299‑1 (MQ=255) 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tATCGCGGTGGCGATATGGTGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGTTCCCGGTGCTGCATCAGCTACTGGTTCAGACGCTGATTACCACCGATGGTAAAACCTTGTTAGGTGCCGATGACAAAGCAGGTATTGCAGAAATCATGACCGCGCTGGCGGTATTGCAACAGAAAAAAATTCCGCATGGTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACAT‑‑‑‑‑TTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACACTGTTGAtggt < 2:474897/300‑1 (MQ=255) gtgtcggtatTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGTTCCCGGTGCTGCATCAGCTACTGGGTCAGACGCTGATTACCACCGATGGTAAAACCTTGTTAGGTGCCGATGACAAAGCAGGTATTGCAGAAATCATGACCGCGCTGGCGGTATTGCAACAGAANAAAATTCCGCATGGTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACAT‑‑‑‑‑TTTGATGTTGACGCCTTCGATGCNCGCTGGGCTTACACTGTTGATGGTGGTGGCg < 2:627610/293‑1 (MQ=255) gtggcaagatTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGTTCCCGGTGCTGCATCAGCTACTGGGTCAGACGCTGAGTACCACCGACGGGAAAACCTTGTTAGGTGCCGATGACAAAGCAGGTATTGCAGAAATCATGACCGCGCTGGCGGTATTGCAACAGAAAAAAATTCCGCATGGTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACAT‑‑‑‑‑TTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGTTTACACTGTTGATGGTGGTGGCg < 1:157879/292‑1 (MQ=255) 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ATGTGAATCCGCAAATTGTTGAAAACTATCGCGGTGGCGATATTGCGCTGGGTATCGGCGATGAAGTTTTATCACCGGTTATGTTCCCGGTGCTGCATCAGCTACTGGGTCAGACGCTGATTACCACCGATGGTAAAACCTTGTTAGGTGCCGATGACAAAGCAGGTATTGCAGAAATCATGACCGCGCTGGCGGTATTGCAACAGAAAAAAATTCCGCATGGTGATATTCGCGTCGCCTTTACCCCGGATGAAGAAGTGGGCAAAGGGGCGAAACAT‑‑‑‑‑TTTGATGTTGACGCCTTCGATGCCCGCTGGGCTTACACTGTTGATGGTGGTGGCGTAGGCGAACTGGAGTTTGAAAACTTCAACGCCGCGTCGGTCAATATCAAAATTGTCGGTAACAATGTTCATCCGGGCACGGCGAAAGGAGTGATGGTAAATGCGCTGTCGCTGGCGGCACGTATTCATGCGGAAGTTCCGGCGGATGAAAGCCCGGAAATGACAGAAGGCTATGAAGGTTTCTATCATCTGGCGAGCATGAAAGGCACCGTTGAACGGGCCGATATGCACTACATCATCCGTGATTTC > NC_000913/1186109‑1186689 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |