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Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
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gCTCCAGATACTGCGtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcaattaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaantgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccggttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgccgccggaga > 2:231269‑M1/1‑15 (MQ=255) cTCCAGATACTGCGCATGAAGATAAATTTTTCATTGCAGACTCTTATTAAGCAATTACTCGTAATGAAATCGGCTGAGGAAGATGCTTTCCGACGCGATTTAATTGACAGCATAATTCGTGATTTTAGCAATAGTGATTCAGGAGGGCCAAACCGAAGAACAGCGACAGCTGACAATAAAAGTATGTTCAATGGTAAGAAAATAAACAGAATACATTAAAATTTCATAAGTAAGATGAGAGGTTACCATGCTTGAAGATACTACAATTCATAATGCAATAACTGATAAAGCGTTAGCAAg < 1:560742/300‑1 (MQ=255) tCCAGATACTGCGCATGAAGATAAATTTTTCATTGCAGACTCTTATTAAGCAATTANTCGTAATGAAATCGGCTGAGGAAGATGCTTTCCGACGCGATTTAATTGACAGCATAATTCGTGATTTTAGCAATAGTGATTCAGGAGGGCCAAACCGAAGAACAGCGACAGCTGACAATAAAAGTATGTTCAATGGTAAGAAAATAAACAGAATACATTAAAATTTCATAAGTAAGATGAGAGGTTACNATGCTTGAAGATACTACAATTCATAATGCAATAACTGATAAAGCGTTAGCAAGt > 2:834560/1‑300 (MQ=255) tCCAGATACTGCGCATGAAGATAAATTTTTCATTGCAGACTCTTATTAAGCAATTACTCGTAATGAAATCGGCTGAGGAAGATGCTTTCCGACGCGATTTAATTGACAGCATAATTCGTGATTTTAGCAATAGTGATTCAGGAGGGCCAAACCGAAGAACAGCGACAGCTGACAATAAAAGTATGTTCAATGGTAAGAAAATAAACAGAATACATTAAAATTTCATAAGTAAGATGAGAGGTTACCATGCTTGAAGATACTACAATTCATAATGCAATAACTGATAAAGCGTTAGCAAGt > 1:845213/1‑300 (MQ=255) ccAGATACTGCGCATGAAGATAAATTTTTCATTGCAGACTCTTATTAAGCAATTACTCGTAATGAAATCGGCTGAGGAAGATGCTTTCCGACGCGATTTAATTGACAGCATAATTCGTGATTTTAGCAATAGTGATTCAGGAGGGCCAAACCGAAGAACAGCGACAGCTGACAATAAAAGTATGTTCAATGGTAAGAAAATAAACAGAATACATTAAAATTTCATAAGTAAGATGAGAGGTTACCATGCTTGAAGATACTACAATTCATAATGCAATAACTGATAAAGCGTTAGCAAGtt > 1:37993/1‑300 (MQ=255) aTACTGCGtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgccgccggagaacaggtt > 1:717673‑M1/1‑8 (MQ=255) | CTCGTTACTTTGCAAAAGCTAACTTGCATACTCAGCAGGAAACTCTCGGGGAAATTGTGACTGAGATTTTGAAAGATGGACGTAATCTGAGTCGAAAGTCGCTTTGTGCCAAACTTCTTTGCCGACTGGAACACGCGACTGGGGAAGAGGAACAGAAACATTATAATGCACTAATTGGGTTGCTTTTTGAATAATGCAACAGCCTGATTATTTAACAGGTTAGCTATGAAGTCGTTATGAAGACATCTGATAATGAACGTATAAAATATGAAATTACTGGCCAGGCGGTGCTCCAGATACTGCGCATGAAGATAAATTTTTCATTGCAGACTCTTATTAAGCAATTACTCGTAATGAAATCGGCTGAGGAAGATGCTTTCCGACGCGATTTAATTGACAGCATAATTCGTGATTTTAGCAATAGTGATTCAGGAGGGCCAAACCGAAGAACAGCGACAGCTGACAATAAAAGTATGTTCAATGGTAAGAAAATAAACAGAATACATTAAAATTTCATAAGTAAGATGAGAGGTTACCATGCTTGAAGATACTACAATTCATAATGCAATAACTGATAAAGCGTTAGCAAGTTACTT > NC_000913/1215832‑1216427 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |