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New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
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GAAGTTTTTGGTCCCCTTTCTATTCAGGCGCTAAAAGTTTTTGGTCCCCTTTCTATTCAGGCGCTAAAAGATGAAGGGCGCTATGAACGTTTAACCAGCGGTTACCTGCCGGAAGCAGAAATTGTCTTTCTGGATGAGATCTGGAAAGCGGGCCCGGCAATTCTTAATACCTTGCTCACCGCCATTAACGAGCGCCAGTTCCGCAACGGTGCACACGTAGAAAAAATCCCGATGCGTCTGCTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAGACAGCAGTCTGGAAGCGTTATATGAC < 1:300212/300‑1 GAAGTTTTTGGTCCCCTTTCTATTCAGGCGCTAAAAGTTTTCGGTCCCCTTTCTATTCAGGCGCTAAAAGATGAAGGGCGCTATGAACGTTTAACCAGCGGTTACCTGCCGGAAGCAGAAATTGTCTTTCTGGATGAGATCTGGAAAGCGGGCCCGGCAATTCTTAATACCTTGCTCACCGCCATTAACGAGCGCCAGTTCCGCAACGGTGCACACGTAGAAAAAATCCCGATGCGTCTGCTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAGACAGCAGTCTGGAAGCGTTATATGAC < 2:167735/300‑1 CCTTTCTATTCAGGCGCTAAAAGTTTTTGGTCCCCTTTCTATTCAGGCGCTAAAAGATGAAGGGCGCTATGAACGTTTAACCAGCGGTTACCTGCCGGAAGCAGAAATTGTCTTTCTGGATGAGATCTGGAAAGCGGGCCCGGCAATTCTTAATACCTTGCTCACCGCCATTAACGAGCGCCAGTTCCGCAACGGTGCACACGTAGAAAAAATCCCGATGCGTCTGCTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAGACAGCAGTCTGGAAGCGTTATATGACCGCATGCTGATTCG < 1:796445/300‑1 TTTCTATTCAGGCGCTAAAAGTTTTTGGTCCCCTTTCTATTCAGGCGCTAAAAGATGAAGGGCGCTATGAACGTTTAACCAGCGGTTACCTGCCGGAAGCAGAAATTGTCTTTCTGGATGAGATCTGGAAAGCGGGCCCGGCAATTCTTAATACCTTGCTCACCGCCATTAACGAGCGCCAGTTCCGCAACGGTGCACACGTAGAAAAAATCCCGATGCGTCTGCTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAGACAGCAGTCTGGAAGCGTTATATGACCGCATGCTGATTCGTC > 1:390335/1‑300 TTTCTATTCAGGCGCTAAAAGTTTTTGGTCCCCTTTCTATTCAGGCGCTAAAAGATGAAGGGCGCTATGAACGTTTAACCAGCGGTTACCTGCCGGAAGCAGAAATTGTCTTTCTGGATGAGATCTGGAAAGCGGGCCCGGCAATTCTTAATACCTTGCTCACCGCCATTAACGAGCGCCAGTTCCACAACGGTGCACATGTAGAAAAAATCCCGATGCGTCTGCTGGTGGCGGCCTCCACCGAGCTGCCGGAAGCAGACAGCAGTCTGGAAGCGTTATATGACCGCATGCTGATTCGTC > 2:288302/1‑300 TTTCTATTCAGGCGCTAAAAGTTTTTGGTCCCCTTTCTATTCAGGCGCTAAAAGATGAAGGGCGCTATGAACGTTTAACCAGCGGTTACCTGCCGGAAGCAGAAATTGTCTTTCTGGATGAGATCTGGAAAGCGGGCCCGGCAATTCTTAAGACCTTGCTCACCGCCATTAACGAGCGCCAGTTCCGCAACGGTNCACACGTAGAAAAAATCCCGATGCGTCTGCTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAGACAGCAGTCTGGAAGCGTTATATGACCGCATGCTGATTCGTC > 2:788547/1‑300 TTTCTATTCAGGCGCTAAAAGTTTTTGGTCCCCTTTCTATTCAGGCGCTAAAAGATGAAGGGCGCTATGAACGTTTAACCAGCGGTTACCTGCCGGAAGCAGAAATTGTCTTTATGGATGAGATCTGGAAAGCGGGCCCGGCAATTCTTAATACCTTGCTCACCGCCATTAACGAGCGCCAGTTCCGCAACGGTGCACACGTAGAAAAAATCCCGATGCGTCTGCTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAGACAGCAGTCTGGAAGCGTTATATGACCGCATGCTGATTCGTC > 2:500997/1‑300 CTATTCAGGCGCTAAAAGTTTCTGGTCCCCTCTCTATCCCGGCGCTCCAAGATGAAGGGCGCTATGACCGTTTAACCAGTGGTTACCTGCCGGAAGCAGGAATTGTCCTTCTGGATGAGATCTGGAAAGCGGGCCCGGCCATTCTTAATACCTTGCTCACTGCAATTAACGAGCACCAGTTCCGCAACGGTGCACACGTAGAAAAAATCCCGATGCGTCTACTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAGACAGCAGTCTGGAAGCGTTATCTGCCAGCATACTGATCCGTCcat > 2:116462/1‑297 ATTCAGGCGCTAAAAGTTTTTGGTCCCCTTTCTATTCAGGCGCTAAAAGATGAAGGGCGCTATGAACGTTTAACCAGCGGTTACCTGCCGGAAGCAGAAATTGTCTTTCTGGATGAGATCTGGAAAGCGGGCCCGGCAATTCTTAATACCTTGCTCACCGCCATTAACGAGCGCCAGTTCCGCAACGGTGNACACGTAGAAAAAATCCCGATGCGTCTGCTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAGACAGCAGTCTGGAAGCGTTATATGACCGCATGCTGATTCGTCTGTGG > 1:640545/1‑300 ATTCAGGCGCTAAAAGTTTTTGGTCCCCTTTCTATTCAGGCGCTAAAAGATGAAGGGCGCTATGAACGTTTAACCAGCGGTTACCTGCCGGAAGCAGAAATTGTCTTTCTGGATGAGATCTGGAAAGCGGGCCCGGCAATTCTTAATACCTTGCTCACCGCCATTAACGAGCGCCAGTTCCGCAACGGTGCACACGTAGAAAAAATCCCGATGCGTCTGCTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAGACAGCAGTCTGGAAGCGTTATATGACCGCATGCTGATTCGTCTGTGG > 1:821415/1‑300 TCAGGCGCTAAAAGTTTTTGGTCCCCTTTCTATTCAGGCGCTAAAAGATGAAGGGCGCTATGAACGTTTAACCAGCGGTTACCTGCCGGAAGCAGAAATTGTCTTTCTGGATGAGATCTGGAAAGCGGGCCCGGCAATTCTTAATACCTTGCTCACCGCCATTAACGAGCGCCAGTTCCGCAACGGTGCACACGTAGAAAAAATCCCGATGCGTCTGCTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAGACAGCAGTCTGGAAGCGTTATATGACCGCATGCTGATTCGTCTGTGGTT < 1:755608/300‑1 TCAGGCGCTAAAAGTTTTTGGTCCCCTTTCTATTCAGGCGCTAAAAGATGAAGGGCGCTATGAACGTTTAACCAGCGGTTACCTGCCGGAAGCAGAAATTGTCTTTCTGGATGAGATCTGGAAAGCGGGCCCGGCAATTCTTAATACCTTGCTCACCGCCATTAACGAGCGCCAGTTCCGCAACGGTGCACACGTAGAAAAAATCCCGATGCGTCTGCTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAGACAGCAGTCTGGAAGCGTTATATGACCACATGCTGATTCGTCTGTGGTT < 2:7181/300‑1 GACGCCACTTCATTATGGCTCACCCTCATTTATTAGCGGAAAGAATTTCCCGCCTGAGCAGTTCGTTGGAAAAGGGGCTTTATGAACGTAGCCACGCCATCCGCTTGTGTTTATTAGCGGCATTAAGTGGTGAAAGTGTGTTCCTCCTTGGCCCGCCAGGTATTGCCAAAAGTTTGATCGCCCGGCGCTTAAAATTCGCCTTTCAGAATGCCCGCGCGTTTGAATATCTGATGACCCGCTTCTCCACGCCGGAAGAAGTTTTTGGTCCCCTTTCTATTCAGGCGCTAAAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3931107‑3930817 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aagTTTTTGGTCCCCTTTCTATTCAGGCGCTAAAAGATGAAGGGCGCTATGAACGTTTAACCAGCGGTTACCTGCCGGAAGCAGAAATTGTCTTTCTGGATGAGATCTGGAAAGCGGGCCCGGCAATTCTTAATACCTTGCTCACCGCCATTAACGAGCGCCAGTTCCGCAACGGTGCACACGTAGAAAAAATCCCGATGCGTCTGCTGGTGGCGGCCTCCAACGAGCTGCCGGAAGCAGACAGCAGTCTGGAAGCGTTATATGACCGCATGCTGATTCGTCTGTGGTT < NC_000913/3930849‑3930564 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |