Predicted mutation | ||||||
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New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 1589976 = | 0 (0.000) | 123 (1.130) | 79/596 | 0.1 | 100% | coding (26/1149 nt) | ydeT | fimbrial usher domain‑containing protein YdeT |
? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
GGAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1468944‑1469240 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ggCTACCTCCTACCGTAGACACCAATGAGCAGACACAATTTATTGATTATTTTAATCTGTTCTACAGTAAGCGTGGTCAGGAACAAATAAGCATCTCTCAGCAGCTTGGAAATTACGGTACGACATTTTTCAGTGCCAGTCGCCAAAGTTACTGGAACACGTCACGCAGCGACCAGCAAATATCATTTGGATTAAATGTGCCGTTTGGTGATATTACGACTTCGCTGAATTACAGCTATTCCAATAATATATGGCAAAACGATCGGGATCATTTACTCGCTTTTACGCTTAATGTTCCCT < 2:488931/298‑1 GTCTACCTCCTACCGGAGACACCAATGAGCAGACACAATTTATTGATTATTTTAATCTGTTCTACAGTAAGCGTGGTCAGGAACAAATAAGCATCTCTCAGCAGCTTGGAAATTACGGTACGACATTTTTCAGTGCCAGTCGCCAAAGTTACTGGAACACGTCACGCAGCGACCAGCAAATATCATTTGGATTAAATGTGCCGTTTGGTGATATTACGACTTCGCTGAATTACAGCTATTCCAATAATATATGGCAAAACGATCGGGATCATTTACTCGCTTTTACGCTTAATGTTCCCT > 1:40686/1‑300 GTCTACCTCCTACCGGAGACACCAATGAGCAGACACAATTTATTGATTATTTTAATCTGTTCTACAGTAAGCGTGGTCAGGAACAAATAAGCATCTCTCAGCAGCTTGGAAATTACGGTACGACATTTTTCAGTGCCAGTCGCCAAAGTTACTGGAACACGTCAAGCAGCGACCAGCAAATATCATTTGGATTAAATGTGCCGTTTGGTGATATTACGACTTCGCTGAATTACAGCTATTCCAATCATATATGGCAAAACGATCGGGATCATTTACTCGCTTTTACGCTTAATGTTCCCT > 2:858907/1‑300 ACCTCCTACCGGAGACACCAATGAGCAGACACAATTTATTGATTATTTTAATCTGTTCTACAGTAAGCGTGGTCAGGAACAAATAAGCATCTCTCAGCAGCTTGGAAATTACGGTACGACATTTTTCAGTGCCAGTCGCCAAAGTTACTGGAACACGTCACGCAGCGACCAGCAAATATCATTTGGATTAAATGTGCCGTTTGGTGATATTACGACTTCGCTGAATTACAGCTATTCCAATAATATATGGCAAAACGATCGGGATCATTTACTCGCTTTTACGCTTAATGTTCCCTTCAG > 2:683901/1‑300 ACCTCCTACCGGAGACACCAATGAGCAGACACAATTTATTGATTATTTTAATCTGTTCTACAGTAAGCGTGGTCAGGAACAAATAAGCATCTCTCAGCAGCTTGGAAATTACGGTACGACATTTTTCAGTGCCAGTCGCCAAAGTTACTGGAACACGTCACGCAGCGACCAGCAAATATCATTTGGATTAAATGTGCCGTTTGGTGATATTACGACTTCGCTGAATTACAGCTATTCCAATAATATATGGCAAAACGATCGGGATCATTTACTCGCTTTTACGCTTAATGTTCCCTTCAG > 1:515509/1‑300 ACCTCCTACCGGAGACACCAATGAGCAGACACAATTTATTGATTATTTTAATCTGTTCTAAAGTAAGCGTGGTCAGGAACAAATAAGCATCTCTAAGCAGCTTGGAAATTACGGTACGACATTTTTCAGTGCCAGTCGCCAAAGTTACTGGAACACGTCACGCAGCGNCCAGCAAATATCATTTGGATTCAATGTGCCGTTTGGTGATATTACGACTTCGCTGAATTACAGCTATTCCAATAATATATGGCAAAACGATCGGGGTCATTTACTCGCTTTTACGCTTAATATTCCacccag > 2:224235/1‑294 GGAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1468944‑1469240 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTCCTACCGGAGACACCAATGAGCAGACACAATTTATTGATTATTTTAATCTGTTCTACAGTAAGCGTGGTCAGGAACAAATAAGCATCTCTCAGCAGCTTGGAAATTACGGTACGACATTTTTCAGTGCCAGTCGCCAAAGTTACTGGAACACGTCACGCAGCGACCAGCAAATATCATTTGGATTAAATGTGCCGTTTGGTGATATTACGACTTCGCTGAATTACAGCTATTCCAATAATATATGGCAAAACGATCGGGATCATTTACTCGCTTTTACGCTTAATGTTCCCTTCAG < NC_000913/1589980‑1589682 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |