Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,135,082 | C→T | A191T (GCC→ACC) | wzc ← | protein‑tyrosine kinase Wzc |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,135,082 | 0 | C | T | 99.0% | 352.8 / ‑4.2 | 96 | coding (571/2163 nt) | wzc | protein‑tyrosine kinase Wzc |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (44/51); minor base . (1/0); total (45/51) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.69e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GTTTTCGGCAACATCCAAGCGGCTACGTACTTCCGGTAACTGTTGCGCGAGGAAGGCGAGGCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGCTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTCAGGGTGTAGTTTTTGTTGTCCAGCACATTAAGCGTAAACACCTGATCCGCCATCTCTTTCGGGCGGTTAAAGGTGGTCACTTTCACCGTCTCGTTCTGACGTCCCATCAGGCGATCCCAGCCCGCACCGAAAATCGGGAACGTGTTTTTGCTCACTGCAATATCGAGGTCGAGATCGTCCACCGTTTTACCAAGCACCAGACGCGAACGAATC > NC_000913/2134789‑2135374 | gtttTCGGCAACATCCAAGCGGCTACGTACTTCCGGTAACTGTTGCGCGAGGAAGGCGAGGCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑c < 1:67645/300‑1 (MQ=255) ttttCGGCAACATCCAGGCTGCTACGTACTTCCGGTAACTGTTGCGCGAGGAAGGCGAGGCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGNCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGTTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑cc < 2:174667/300‑1 (MQ=255) ttttCGGCAACATCCAAGCGGCTACGTACTTCCGGTAACTGTTGCGCGAGGAAGGCGAGGCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACTGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑cc < 2:469813/300‑1 (MQ=255) ttttCGGCAACATCCAAGCGGCTACGTACTTCCGGTAACTGTTGCGCGAGGAAGGCGAGGCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑cc < 2:369331/300‑1 (MQ=255) ggCAACATCCAAGCGGCTACGTACTTCCGGTAACTGTTGCGCGAGGAAGGCGAGGCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAg < 1:9647/300‑1 (MQ=255) aCATCCAAGCGGCTACGTACTTCCGGTAACTGTTGCGCGAGGAAGGCGAGGCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTg > 1:125267/1‑300 (MQ=255) cATCCAAGCGGCTACGTACTTCCGGTAACTGTTGCGCGAGGAAGGCGAGGCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGa > 1:179469/1‑300 (MQ=255) cATCCAAGCGGCTACGTACTTCCGGTAACTGTTGCGCGAGGAAGGCGAGGCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGa > 2:725945/1‑300 (MQ=255) ccgccacatACTTCCGGTAACTGTTGCGCGAGGAAGGCGAGGCTCTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAATTACGGGCGACGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCCATGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGTTGTTTTGCAGTTGGTTGCTCCTCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCACCAGCGTGACGCcttct > 2:153435/9‑300 (MQ=255) cGGCTACGTACTTCCGGTAACTGTTGCGCGAGGAAGGCGAGGCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCNTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCCGCGTGACGCcttct > 2:179370/1‑300 (MQ=255) gCTACGTACTTCCGGTAACTGTTGCGCGAGGAAGGCGAGGCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCNGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCttt > 1:506438/1‑300 (MQ=255) aCGTACTTCCGGTAACTGTTGCGCGAGGAAGGCGAGGCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCtttttt > 2:669003/1‑300 (MQ=255) catagttCCGGTAACTGTTGCGCGAGTAAGGCGAGGCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATGTTTTGTTCCTGCGAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATTTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACTGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGATGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CTAGCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTc < 2:217577/295‑1 (MQ=255) gTACTTCCGGTAACTGTTGCGCGAGGAAGGCGAGGCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCa > 1:25786/1‑300 (MQ=255) tACTTCCGGTAACTGTTGCGCGAGGAAGGCGAGGCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAg < 2:217438/300‑1 (MQ=255) tCCGGTAACTGTTGCGCGAGGAAGGCGAGGCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATc < 1:319796/300‑1 (MQ=255) cGGTAACTGTTGCGCGAGGAAGGCGAGGCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGTGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGACTGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTg > 2:123712/1‑300 (MQ=255) gaaCTGTTGCGCGAGGAAGGCGAGGCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTTTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTGGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGTTGACGGTAAACTCACTGCCCTGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGcc < 2:285667/299‑1 (MQ=255) gTTGCGCGAGGAAGGCGAGGCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCACTCAATATTTTGTGCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGGTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCtt < 2:212844/300‑1 (MQ=255) 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ggCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACNGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAgc < 2:554078/300‑1 (MQ=255) gCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAgcc > 1:588723/1‑300 (MQ=255) cTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAANATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAACACGCCAGNGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAAGTTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAgccg > 2:521253/1‑300 (MQ=255) tCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTc < 1:577803/300‑1 (MQ=255) cgATTTGCTCTTAATATTTTTTTCCTGATATTTACGTGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTNGCCGTTCTCCGCTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATNTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTGCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTCAGGgt < 2:587106/300‑1 (MQ=255) cgATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCATGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTCAGGgt < 2:629002/300‑1 (MQ=255) cgATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATNTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTCTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCNGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTCAGGgt < 2:535322/300‑1 (MQ=255) tGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATATTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTCAGGGTGTAGt < 2:416867/300‑1 (MQ=255) tGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGTGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGTTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTCAGGGTGTAGt < 2:87058/300‑1 (MQ=255) cgcTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGCTCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTCAGGGTGTAGttt < 2:708518/300‑1 (MQ=255) cgcTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCATGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGTTTGACCATCCCCAGCGTTGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTCAGGGTGTAGttt < 2:286757/300‑1 (MQ=255) cgcTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTCAGGGTGTAGttt < 1:387816/300‑1 (MQ=255) cAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTCAGGGTGTAGTTTttgt > 1:245675/1‑300 (MQ=255) atatTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTCCGGGTGTAGTTTttgttg > 2:448824/1‑300 (MQ=255) ttttGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTCAGGGTGTAGTTTTTGTTGTcc < 1:262807/300‑1 (MQ=255) ttGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTCAGGGTGTAGTTTTTGTTGTCCAg < 1:577708/300‑1 (MQ=255) ttCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTCAGGGTGTAGTTTTTGTTGTCCAGcac < 1:645918/300‑1 (MQ=255) ccTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGANTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCNGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTCAGGGTGTAGTTTTTGTTGTCCAGCACAt < 2:495380/300‑1 (MQ=255) 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gTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTCAGGGTGTAGTTTTTGTTGTCCAGCACATTAAGCGTAAACACCTGATCCGCCATCTCTTTCGGGCGGNTAAAGGTGGTCACTTTCACCGTCTCGTTCTGACGTCCCATCAGGCGATCCCAGCCCGCACCGAAAATCGGGAACGTGTTTTTGCTCACTGCAATATCGAGGTCGAGATc > 1:521452/1‑300 (MQ=255) cGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTCAGGGTGTAGTTTTTGTTGTCCAGCACATTAAGCGTACCCACCTGATCCGCCATCTCTTTCGGGCGGTTAAAGGTGGTCACTTTCACCGTCTCGTTCTGACGTCCCATCAGGCGATCCCAGCCCGCACCGAAAATCGGGAACGTGTTTTTGCTCACTGCAATATCGAGGTCGAGATCGTCCACCGttt > 2:440059/1‑300 (MQ=255) aaCTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCAGCAGCGTGACGCCTTCGTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTCAGGGTGTAGTTTTTGTTGTCCAGCACATTAAGCGTAAACACCTGATCCGCCATCTCTTTCGGGCGGTTAAAGGTGGTCACTTTCACCGTCTCGTTCTGACGTCCCATCAGGCGATCCCAGCCCGCACCGAAAATCGGGAACGTGTTTTTGCTCACTGCAATATCGAGGTCGAGATCGTCCACCGTTTTACCa < 1:683645/300‑1 (MQ=255) cTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTCAGGGTGTAGTTTTTGTTGTCCAGCACATTAAGCGTAAACACCTGATCCGCCATCTCTTTCGGGCGGTTAAAGGTGGTCACTTTCACCGTCTCGTTCTGACGTCCCATCAGGCGATCCCAGCCCGCACCGAAAATCGGGAACGTGTTTTTGCTCACTGCAATATCGAGGTCGAGATCGTCCACCGTTTTACCAAg > 2:265474/1‑300 (MQ=255) tGAATGGTTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTCAGGGTGTAGTTTTTGTTGTCCAGCACATTAAGCGTAAACACCTGATCCGCCATCTCTTTCGGGCGGTTAAAGGTGGTCACTTTCACCGTCTCGTTCTGACGTCCCATCAGGCGATCCCAGCCCGCACCGAAAATCGGGAACGTGTTTTTGCTCACTGCAATATCGAGGTCGAGATCGTCCACCGTTTTACCAAGCACCAGACGCGAACGAATc < 1:94828/300‑1 (MQ=255) | GTTTTCGGCAACATCCAAGCGGCTACGTACTTCCGGTAACTGTTGCGCGAGGAAGGCGAGGCTTTTCGACGCTTCCGCCGATTTGCGCTCAATATTTTGTTCCTGATAGTTACGGGCGATGCTGTTAAGAATGTCGCGGATCTGTTCACGATCTTCACCGGTATAAGTCAGGCTCAAAACGCCAGCGTCTTTGCCGTTCTCCGTTACCGTCAGGCTGTTTTGCAGTTGGTTGATCATCCCCAGCGTGGAGTATTTGGTGACGGTAAACTCACTGCCCGGGCTGGCGTGAATGGCTTCAA‑CCATCAGCGTGACGCCTTCTTTTTTCAGCATCTGGCCCGCTTGCCCCCGGGCGCTAAAGCCGCCGTCGCTGCTCAGGGTGTAGTTTTTGTTGTCCAGCACATTAAGCGTAAACACCTGATCCGCCATCTCTTTCGGGCGGTTAAAGGTGGTCACTTTCACCGTCTCGTTCTGACGTCCCATCAGGCGATCCCAGCCCGCACCGAAAATCGGGAACGTGTTTTTGCTCACTGCAATATCGAGGTCGAGATCGTCCACCGTTTTACCAAGCACCAGACGCGAACGAATC > NC_000913/2134789‑2135374 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |