Predicted mutation | ||||||
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JC JC | NC_000913 | 2,955,094 | Δ1 bp :: IS186 (+) +6 bp :: Δ1 bp | coding (905‑910/3543 nt) | recB ← | exodeoxyribonuclease V subunit RecB |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 2515616 | NA (NA) | 105 (1.130) | 78/592 | 0.1 | 98.1% | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region |
? | NC_000913 | 2955094 = | 2 (0.020) | coding (910/3543 nt) | recB | exodeoxyribonuclease V subunit RecB |
CGACCAAACTGGTTTCCAACGAGTTCGTTGCGATGATGGATCTGCAGAAAATTGCTTCCACGCTCTCTCCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCATGGGCTCAGCTCCATGACGTTGCAACATTATCTGACGTGGCTCTCCTGAAG > NC_000913/2513982‑2514567 | cGACCAAACTGTTTTCCAACGAGTTCGTTGCGATGATGGATCTGCAGAAAATTGCTTCCACATTCTCTCCGCGTGCTGAATGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGTGGATAATTCCCATAAg < 2:189646/300‑1 (MQ=255) cGACCAAACTGGTTTCCAACGAGTTCGTTGCGATGATGGATCTGCAGAAAATTGCTTCCACGCTCTCTCCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCAATAAg > 2:306951/1‑300 (MQ=255) gACCAAACTGGTTTCCAACGAGTTCGTTGCGATGATGGATCTGCAGAAAATTGCTTCCACGCTCTCTCCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAgc > 1:484742/1‑300 (MQ=255) aaaCTGGTTTCCAACGAGTTCGTTGCGATGATGGATCTGCAGAAAATTGCTTCCACGCTCTCTCCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTa > 1:345779/1‑300 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |