| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 1995730 | 108 (1.040) | coding (76/177 nt) | yecU | protein YecU | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCCACAGTTATGGTCACGCCCGTCACCAACGGCTTACCGGATCGTTTCACAGTAAGCCCTACGATGAAATGTGACAAAAATTGACTTTATTCAGCAAAAATGAAAATCAGCCCGCTGAATATGTAACATTAATTAACCCGAACAATACGGGCAAAAAACATTCATGATAAAAATATTTATTGGTCATTATATTAACGTATTTTATAGCACTGCCGATATCACGCTCAAAAAACAACCACTGCTATTTTTAGCAAAGCTTATGGTATACTCCGCCGCCTTAACATTTTTCACCGCAAATTTTCATTGCAACATGACGAGGAAAATAAATGAGTACGCCTGATTTTTCTACTGCCGAGAATAATCAAGAACTGGCAAATGAAGTCTCCTGCCTGAAAGCGATGCTGACGCTGATGCTGCAGGCGATGGGACAAGCTGACGCGGGCCGCGTGATGTTAAAGATGGAAAAACAGCTTGCGCTGATCGAAGACGAAACCCAGGCTGCAGTATTTTCCAAAACGGTTAAGCAAATTAAACAAGC > NC_000913/1995432‑1996029 | cTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCCACAGTTATGGTCACGCCCGTCACCAACGGCTTACCGGATCGTTTCACAGTAAGCCCTACGATGAAATGTGACAAAAATTGACTTTATTCAGCAAAAATGAAAATCAGCCCGCTGAATATGTAACATTAATTAACCCGAACAATACGGGCAAAAAACATTCATGATAAAAATATTTATTGGTCATTATATTAACGTATTTTATAGCACTGCCGATATCACGCTCAAAAAACAACCACt > 2:263987/1‑300 (MQ=255) 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aaaaaCAACCACTGCTATTTTTAGCAAAGCTTATGGTATACTCCGCCGCCTTAACATTTTTCACCGCAAATTTTCATTGCAACATGACGAGGAAAATAAATGAGTACGCCTGATTTTTCTACTGCCGAGAATAATCAAGAACTGGCAAATGAAGTCTCCTGCCTGAAAGCGATGCTGACGCTGATGCTGCAGGCGATGGGACAAGCTGACGCGGGCCGCGTGATGTTAAAGATGGAAAAACAGCTTGCGCTGATCGAAGACGAAACCCAGGCTGCAGTATTTTCCAAAACGGTTAAGCaa < 2:20235/300‑1 (MQ=255) ccACTGCTATTTTTAGCAAAGCTTATGGTATACTCCGCCGCCTTAACATTTTTCACCGCAAATTTTCATTGCAACATGACGAGGAAAATAAATGAGTACGCCTGATTTTTCTACTGCCGAGAATAATCAAGAACTGGCAAATGAAGTCTCCTGCCTGAAAGCGATGCTGACGCTGNTGCTGCAGGCGATGGGACAAGCTGACGCGGGCCGCGTGATGTTAAAGATGGAAAAACAGCTTGCGCTGATCGAAGACGAAACCCAGGCTGCANTATTTTCCAAAACGGTTAAGCAAATTAAACa < 2:623862/300‑1 (MQ=255) cTGCTATTTTTAGCAAAGCTTATGGTATACTCCGCCGCCTTAACATTTTTCACCGCAAATTTTCATTGCAACATGACGAGGAAAATAAATGAGTACGCCTGATTTTTCTACTGCCGAGAATAATTAAGAACTGGCAAATGAAGTCTCCTGCCTGAAAGCGATGCTGACGCTGATGCTGCAGGCGATGGGACAAGCTGACGCGGGCCGCGTGATGTTAAAGATGGAAAAACAGCTTGCGCTGATCGAAGACGAAACCCAGGCTGCAGTATTTTCCAAAACGGTTAAGCAAATTAAACAAGc > 2:148023/1‑300 (MQ=255) | CTTTGAAACGTTAAAAATGGTGGGTATTCGATTTTTCTCTCGTTTTTGTCAATTCGATTGTCCACAGTTATGGTCACGCCCGTCACCAACGGCTTACCGGATCGTTTCACAGTAAGCCCTACGATGAAATGTGACAAAAATTGACTTTATTCAGCAAAAATGAAAATCAGCCCGCTGAATATGTAACATTAATTAACCCGAACAATACGGGCAAAAAACATTCATGATAAAAATATTTATTGGTCATTATATTAACGTATTTTATAGCACTGCCGATATCACGCTCAAAAAACAACCACTGCTATTTTTAGCAAAGCTTATGGTATACTCCGCCGCCTTAACATTTTTCACCGCAAATTTTCATTGCAACATGACGAGGAAAATAAATGAGTACGCCTGATTTTTCTACTGCCGAGAATAATCAAGAACTGGCAAATGAAGTCTCCTGCCTGAAAGCGATGCTGACGCTGATGCTGCAGGCGATGGGACAAGCTGACGCGGGCCGCGTGATGTTAAAGATGGAAAAACAGCTTGCGCTGATCGAAGACGAAACCCAGGCTGCAGTATTTTCCAAAACGGTTAAGCAAATTAAACAAGC > NC_000913/1995432‑1996029 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |