| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 1470516 | NA (NA) | noncoding (1221/1221 nt) | IS30 | repeat region | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
TTTACCACTGGCAATTAAATACAGCAGCGCCGCTGCAACAATACCGCCGACAACCTGGGCAATTACGTAGCCAACGACTTCTTTTGCCGGAAAACGTCCGCCAGCCCATAAACCAATAGTGACCGCCGGGTTAAAATGACCACCAGAAATATGACCAACAGCAAAGGCCATCGTCAGAACGGTCAGACCGAACGCCAACGCCACGCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGGAAGCCTGCGGCCAGTACAGCACTACCACAGCCACCAAAAACAAGCCAGAAAGTACCAAAACATTCAGCTGCTAATTTTCTGAACATATCCACCACAATTAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGCCCCATATAGTCATTTGTCTGATTGACAGTGTAGTGCACGCAAAAGATTTAATCCTTTAGGCGTAATAAAAAATAATTTATCATGCTAATTATTTGATTTTGTTGTTTT > NC_000913/915730‑916320 | aTTAAATACAGCAGCGCCGCTGCAACAATACCGCCGACAACCTGGGCAATTACGTAGCCAACGACTTCTTTTGCCGGAAAACGTCCGCCAGCCCATAAGCCAATAGTGACCGCCGGGTTAAAATGACCACCAGAAATATGACCAACAGCAAAGGCCATCGTCAGAACGGTCAGACCGAACGCCAACGCCACGCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGGAAGCCTGCGGCCAGTACAGCACTACCACAGCCACCAAAAACAAGCCAGAAAGTACCAAAACATTCAGCTGCTAATTTTCTg > 1:787645/1‑300 (MQ=255) aTTAAATACAGCAGCGCCGCTGCAACAATACCGCCGACAACCTGGGCAATTACGTAGCCAACGACTTCTTTTGCCGGAAAACGTCCGCCAGCCCATAAACCAATAGTGACCGCCGGGTTAAAATGACCACCAGAAATATGACCAACAGCAAAGGCCATCGTCAGAACGGTCAGACCGAACGCCAACGCCACGCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGGAAGCCTGCGGCCAGTACAGCACTACCACAGCCACCAAAGACAAGCCAGAAAGTACCAAAACATTCAGCTGCTAATTTTCTg > 1:318536/1‑300 (MQ=255) aTTAAATACAGCAGCGCCGCTGCAACAATACCGCCGACAACCTGGGCAATTACGTAGCCAACGACTTCTTTTGCCGGAAAACGTCCGCCAGCCCATAAACCAATAGTGACCGCCGGGTTAAAATGACCACCAGAAATATGACCAACAGCAAAGGCCATCGTCAGAACGGTCAGACCGAACGCCAACGCCACGCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGGAAGCCTGCGGCCAGTACAGCACTACCACAGCCACCAAAAACAAGCCAGAAAGTACCAAAACATTCAGCTGCTAATTTTCTg > 1:322853/1‑300 (MQ=255) aTTAAATACAGCAGCGCCGCTGCAACAATACCGCCGACAACCTGGGCAATTACGTAGCCAACGACTTCTTTTGCCGGAAAACGTCCGCCAGCCCATAAACCAATAGTGACCGCCGGGTTAAAATGACCACCAGAAATATGAACAACAGCAAAGGCCATCGTCAGAACGGTCAGACCGAACGCCAACGCCACGCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGGAAGCCTGCGGCCAGTACAGCACTACCACAGCCACCAAAAACAAGCCAGAAAGTACCAAAACATTCAGCTGCTAATTTTCTg > 1:323012/1‑300 (MQ=255) aaaTACAGCAGCGCCGCTGCAACAATACCGCCGACAACCTGGGCAATTACGTAGCCAACGACTTCTTTTGCCGGAAAACGTCCGCCAGCCCATAAACCAATAGTGACCGCCGGGTTAAAATGACCACCAGAAATATGACCAACAGCAAAGGCCATCGTCAGAACGGTCAGACCGAACGCCAACGCCACGCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGGAAGCCTGCGGCCAGTACAGCACTACCACAGCCACCAAAAACAAGCCAGAAAGTACCAAAACATTCAGCTGCTAATTTTCTGAAc < 1:822619/300‑1 (MQ=255) aaaTACAGCAGCGCCGCTGCAACAATACCGCCGACAACCTGGGCAATTACGTAGCCAACGACTTCTTTTGCCGGAAAACGTCCGCCAGCCCATAAACCAATAGTGACCGCCGGGTTAAAATGACCACCAGAAATATGACCAACAGCAAAGGCCATCGTCAGAACGGTCAGACCGAACGCCAACGCCACGCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGGAAGCCTGCGGCCAGTACAGCACTACCACAGCCACCAAAAACAAGCCAGAAAGTACCAAAACATTCAGCTGCTAATTTTCTGAAc < 2:867578/300‑1 (MQ=255) aTACAGCAGCGCCGCTGCAACAATACCGCCGACAACCTGGGCAATTACGTAGCCAACGACTTCTTTTGCCGGAAAACGTCCGCCAGCCCATAAACCAATAGTGACCGCCGGGTTAAAATGACCACCAGAAATATGACCAACAGCAAAGGCCATCGTCAGAACGGTCAGACCGAACGCCAACGCCACGCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGGAAGCCTGCGGCCAGTACAGCACTACCACAGCCACCAAAAACAAGCCAGAAAGTACCAAAACATTCAGCTGCTAATTTTCTGAACat > 1:895006/1‑300 (MQ=255) 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gTACCAAAACATTCAGCTGCTAATTTTCTGAACATATCCACCACAATTAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCNATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCNCCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGCCCCATATAGTCATTTGTCTGATTGACAGTGTAGTGCACGCAAAAGATTTAATCCTTTAGGCGTAATAAAAAATAATTTATCATGCTAATTATTTGAtttt > 2:596309/1‑300 (MQ=255) cAAAACATTCAGCTGCTAATTTTCTGAACATATCCACCACAATTAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGCCCCATATAGTCATTTGTCTGATTGACAGTGTAGTGCACGCAAAAGATTTAATCCTTTAGGCGTAATAAAAAATAATTTATCATGCTAATTATTTGATTttgttg > 2:747154/1‑300 (MQ=255) aCATTCAGCTGCTAATTTTCTGAACATATCCACCACAATTAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGCCCCATATAGTCATTTGTCTGATTGACAGTGTAGTGCACGCAAAAGATTTAATCCTTTAGGCGTAATAAAAAATAATTTATCATGCTAATTATTTGATTTTGTTGtttt > 1:150507/1‑300 (MQ=255) | TTTACCACTGGCAATTAAATACAGCAGCGCCGCTGCAACAATACCGCCGACAACCTGGGCAATTACGTAGCCAACGACTTCTTTTGCCGGAAAACGTCCGCCAGCCCATAAACCAATAGTGACCGCCGGGTTAAAATGACCACCAGAAATATGACCAACAGCAAAGGCCATCGTCAGAACGGTCAGACCGAACGCCAACGCCACGCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGGAAGCCTGCGGCCAGTACAGCACTACCACAGCCACCAAAAACAAGCCAGAAAGTACCAAAACATTCAGCTGCTAATTTTCTGAACATATCCACCACAATTAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGCCCCATATAGTCATTTGTCTGATTGACAGTGTAGTGCACGCAAAAGATTTAATCCTTTAGGCGTAATAAAAAATAATTTATCATGCTAATTATTTGATTTTGTTGTTTT > NC_000913/915730‑916320 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |