New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2537837 | 16 (0.340) | 16 (0.340) | 14/484 | 1.7 | 50.0% | coding (89/735 nt) | yfeS | PF05406 family protein YfeS |
? | NC_000913 | 2996361 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
CGATTACTGGGAAGCCGTATATTGTGAAGATCCCCGGTAAGAGCGATGAGAACGCACAGCCTTTTTTACATGCGTTAATTGCGCAGACGGATAAAACGGTGCCTGCGGAAGGAAATTAATCCGCTTTGGGAAGGCATTTACAGGAGGTAACATGAAAAAACGCTTTATTTATCACGATGAAAAATCGAATAAATTTTGGTGGATAGATTACGAAGGGGATAGTTTAGCTGTCAACTATGGCAAGGTAGGTAGTATTGGTAAATTCCAGACAAAAGAGTTCGATAATGAAGAACAGTGTCTGAAAGAAGCCAGTAAATTGATTGCCGCAAAAATGAAGAAAGGCTATCAAGAAGATCCAAAGTTTAACTTCATGGATCGCTACTATTTTGATGATGAAGAAATTGGGTTACATGTTAAAACGTCACACCCAAACTTCCAGTGCCATTTTACTGATCCACTTTATATGTGTTGCTGGGATGAAGAATCTCC > NC_000913/2537598‑2538086 | ggaTTACTGGGAAGCCGTATATAGTGAAGAGCCCCGGTAAGAGCGATAAGAACGCGCAGCCTGGTTTACATGCGGTAATTGCGCAGACGGATAAAAAGGTGCCTGCGGAAGGAAATTAATCCGCTTTGGGAAGGCATTTACAGGAGGTAACATGAAAAAACGCTTTATTTATCACGATGAAAAATCGAATAAATTTTGGTGGATAGATTACGAAGGGGATAGTTTAGCTGTCAACTATGGtggatttgccc < 2:366864‑M1/250‑12 (MQ=255) gggAAGCCGTATATTGTGAAGATCCCCGGTAAGAGCGATGAGAACGCACAGCCTTTTTTACATGCGTTAATTGCGCAGACGGATAAAACGGTGCCTGCGGAAGGAAATTAATCCGCTTTGGGAAGGCATTTACAGGAGGTAACATGAAAAAACGCTTTATTTATCACGATGAAAAATCGAATAAATTTTGGTGGATAGATTACGAAGGGGATAGTTTAGCTGTCAACTATGGCAAGGTAGGTAGTATTgg < 2:39601/250‑1 (MQ=255) gctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTATGGCAAGGTAGGTAGTATTGGTAAATTcc < 2:128238‑M1/31‑1 (MQ=255) accgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtcttgagattcagggggccagtctaTATgg > 2:467723‑M1/187‑191 (MQ=255) accgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTATgg < 1:467723‑M1/5‑1 (MQ=255) aaCGCACAGCCTTTTTTACATGCGTTAATTGCGCAGACGGATAAAACGGTGCCTGCGCACGGAAATTAATCCGCTTTGGGAAGGAATTTACAGCAGGTACCATGAAAAAACGCTTTATTTATCACGATGCAAAATCGAATAAATTTTGGTGGATAGATTACGAAGGGGATAGTTTAGCTGTCAACTATGGCAAGGTAGGTAGTATTGGTAACTTCCAGACAAAAGAGCTCGATAATGAAGAACAGTGTCTg > 1:280655/1‑251 (MQ=255) cgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTATGGCAAGGTAGGTAGTATTGGTAAATTCCAGACAAAAGAGTTCGATAATGAAGAACAGTGTCTGa > 1:178561‑M1/185‑251 (MQ=255) cacaGCCTTTTTTACATGCGTTAATTGCGCAGACGGATAAAACGGTGCCTGCGGAAGGAAATTAATCCGCTTTGGGAAGGCATTTACAGGAGGCAACATGAAAAAACGCTTTATTTATCACGATGAAAAATCGAATAAATTTTGGTGGATAGATTACGAAGGGGATAGTTTAGCTGTCAACTATGGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgc > 2:189596‑M1/1‑186 (MQ=255) 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aaCTATGGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactc > 1:290226‑M1/1‑8 (MQ=255) aaCTATGGCAAGGTAGGTAGTATTGGTAAATTCCAGACAAAAGAGTTCGATAATGAAGAACAGTGTCTGAAAGAAGCCAGTAAATTGATTGCCGCAAAAATGAAGAAAGGCTATCAAGAAGATCCAAAGTTTAACTTCATGGATCGCTACTATTTTGATGATGAAGAAATTGGGTTACATGTTAAAACGTCACACCCAAACTTCCAGTGCCATTTTACTGATCCACTTTATATGTGTTGGTGGGATgaaga < 2:160467/251‑1 (MQ=255) cTATGGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgg < 2:136071‑M1/178‑173 (MQ=255) cTATGGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgg > 1:136071‑M1/1‑6 (MQ=255) ggCAAGGTAGGTAGTATTGGTAAATTCCAGACAAAAGAGTTCGATAATGAAGAACAGTGTCTGAAAGAAGCCAGTAAATTGATTGCCGCAAAAATGAAGAAAGGCTATCAAGAAGATCCAAAGTTTAACTTCATGGATCGCTACTATTTTGATGATGAAGAAATTGGGTTACATGTTAAAACGTCACACCCAAACTTCCAGTGCCATTTTACTGATCCACTTTATATGTGTTGCTGGGATGAAGAATCTcc > 2:264261/1‑251 (MQ=255) | CGATTACTGGGAAGCCGTATATTGTGAAGATCCCCGGTAAGAGCGATGAGAACGCACAGCCTTTTTTACATGCGTTAATTGCGCAGACGGATAAAACGGTGCCTGCGGAAGGAAATTAATCCGCTTTGGGAAGGCATTTACAGGAGGTAACATGAAAAAACGCTTTATTTATCACGATGAAAAATCGAATAAATTTTGGTGGATAGATTACGAAGGGGATAGTTTAGCTGTCAACTATGGCAAGGTAGGTAGTATTGGTAAATTCCAGACAAAAGAGTTCGATAATGAAGAACAGTGTCTGAAAGAAGCCAGTAAATTGATTGCCGCAAAAATGAAGAAAGGCTATCAAGAAGATCCAAAGTTTAACTTCATGGATCGCTACTATTTTGATGATGAAGAAATTGGGTTACATGTTAAAACGTCACACCCAAACTTCCAGTGCCATTTTACTGATCCACTTTATATGTGTTGCTGGGATGAAGAATCTCC > NC_000913/2537598‑2538086 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |