| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
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agtaagtCTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagattttcttgtcccgcatggagcagattctgccatggcaaaacatggtggaagtcatcgagccgttttaccccaaggctggtaatggccggcgaccttatccgctggaaaccatgctacgcattcactgcatgcagcattggtacaacctgagcga < 1:380366‑M1/300‑290 (MQ=255) agtCTAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCCTTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATGTTTACAGCAAAAGATAACCTTCATGGCGCAATAACCACTCTTTTCGCTGAACTCCGCCTGCATATCCGGTCATGGTGCCGTTTCGGCCAATAACCCGATGGCAAGGTACGACGATGCTGATGGGATTCGATCCGTTTGCCGCACCAACGGCACGCGCCGCGCCAGGa < 1:213962/300‑1 (MQ=255) agtCTAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCATTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATGTTTACAGCAAAAGATAACCTTCATGGCGCAATAACCACTCTTTTCGCTGAACTCCGCCTGCATATCCGGTCATGGTGCCGTTTCGGCCAATAACCCGATGGCAAGGTACGACGATGCTGATGGGATTCGATCCGTTTGCCGCACCAACGGCACGCGCCGCGCCAGGa > 2:410313/1‑300 (MQ=255) gtCTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcgtgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagattttcttgtcccgcatggagcagattctgccatggcaaaacatggtggaagtcatcgagccgttttaccccaaggctggtaatggccggcgaccttatccgctggaaaccatgctacgcattcactgcatgcagcattggtacaacctgagcgatggcg > 1:721793‑M1/1‑6 (MQ=255) gtCTAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAAGATATGTCTATCTATTTGAAAACCCTTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATGTTTACAGCAAAAGATAACCTTCATGGCGCAATAACCACTCTTTTCGCTGAACTCCGCCTGCATATCCGGTCATGGTGCCGTTTCGGCCAATAACCCGATGGCAAGGTACGACGATGCTGATGGGATTCGATCCGTTTGCCGCACCAACGGCACGCGCCGCGCCAGGAc < 1:657645/300‑1 (MQ=255) ccCTAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCCTTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATGTTTACAGCAAAAGATAACCTTCATGGCGCAATAACCACTCTTTTCGCTGAACTCCGCCTGCATATCCGGTCATGGTGCCGTTTCGGCCAATAACCCGATGGCAAGGTACGACGATGCTGATGGGATTCGATCCGTTTGCCGCACCAACGGCACGCGCCGCGCCAGGAc > 1:271163‑M1/3‑300 (MQ=255) | TTTTAATCGTACCGGAGCGGATGGCATAAAGCGATTTAAGTTCATCACCAGCCTTAAACAGCGTCTGGCCTTTCTGAATAGGCTTCTTCCGCTCAATGATATTATCAAGCTGATCAAGCTCATGTTCGTTGAGTGTGAACGGGATGCAAAGCTGGCTGATGCTGCAATCCTGGCAATGGATAGCACAACCGCCAGACTGAATGCGCCGTATAATTCGCTTTTCCGGGATCATAGGTCTGCTCAAGCCGTAATTGATATTTGTCAATTTTAACATCTTTTTAGGGAGCAAGTAAGTCTAAGCAAACCTTAACAGCAGAGAATTCCGATATTAGATGTAAATATATGTCTATCTATTTGAAAACCCTTAAGTTGTTAAGGGTAACTTTACATAAAAGTGTGAACAAGCTGGCACAAATTGTTTAATGTTTACAGCAAAAGATAACCTTCATGGCGCAATAACCACTCTTTTCGCTGAACTCCGCCTGCATATCCGGTCATGGTGCCGTTTCGGCCAATAACCCGATGGCAAGGTACGACGATGCTGATGGGATTCGATCCGTTTGCCGCACCAACGGCACGCGCCGCGCCAGGACGGC > NC_000913/1399295‑1399890 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |