| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 270,325 | A→G | pseudogene (48/263 nt) | insN → | IS911A regulator fragment |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 270,325 | 0 | A | G | 97.6% | 55.4 / ‑3.8 | 42 | pseudogene (48/263 nt) | insN | IS911A regulator fragment |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (32/9); total (33/9) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TCATGAATCCTTTTCACTAGGGATGAAGTGGTTTACTGAATTTGGCCACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGTCATAATGAAAAAAAGAAATTTCAGCGCAGAGTTTAAACGCGAATCCGCTCAA‑CTGGTCGTTGACCAGAACTACACCGTGGCAGATGCAGCCAGCGCTATGGATGTCGGCCTTTCCACAATGACGCGATGGGTGAAACAATTACGTGATGAACGG‑CAGGGCAAAACACCAAAAGCCTCCCCCATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCA‑GGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAAC > NC_000913/270183‑270579 | aaaagtgtcattgatactaaccttgtaGTGGTTTAATAAATTTGGCCACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTg < 1:126061/274‑1 (MQ=2) aagctacatgaagcgatgcctttgtaGTGGTTTAATAAATTTGGCCACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGa > 1:277271/26‑300 (MQ=2) gctacatgaagcgatgcctttgtaGTGGTTTAATAAATTTGGCCACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGc > 1:817217/24‑300 (MQ=9) gtgtcattgatactaaccttttaGTGGTTTAATAAATTTGGCCACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACATGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCt < 1:296553/278‑1 (MQ=9) gtgtcattgatactaaccttgtaGTGGTTTAATAAATTTGGCCACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCt < 1:302724/278‑1 (MQ=9) acatgaagcgatgcctttgtaGTGGTTTAATAAATTTGGCCACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCACTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCtga > 1:329305/21‑298 (MQ=2) cattgatactaaccttgtaGTGGTTTAATAAATTTGGCCACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCtgaag > 1:839355/19‑296 (MQ=9) gatactaaccttgtaGTGGTTTAATAAATTTGGCCACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGaaaa > 1:690065/15‑300 (MQ=9) atactaaccttgtaGTGGTTTAATAAATTTGGCCACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCTAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCACTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGaaaaa > 1:772792/14‑300 (MQ=9) gcctttgtaGTGGTTTAATAAATTTGGCCACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGaaaaaaattc > 1:96875/9‑295 (MQ=9) cctttgtaGTGGTTTAATAAATTTGGCCACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCCCGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGaaaaaaattca > 2:333103/8‑294 (MQ=2) cctttgtaGTGGTTTAATAAATTTGGCCACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGaaaaaaattca > 1:728455/8‑294 (MQ=9) cctttgtaGTGGTTTAATAAATTTGGCCACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCAGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGaaaaaaattca > 2:814596/8‑294 (MQ=2) accttgtaGTGGTTTAATAAATTTGGCCACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGaaaaaaattca > 1:712828/8‑294 (MQ=9) accttgtaGTGGTTTAATAAATTTGGCCACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGaaaaaaattca > 2:772182/8‑294 (MQ=9) accttgtaGTGGTTTAATAAATTTGGCCACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCACTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGaaaaaaattca > 1:163494/8‑294 (MQ=2) ttgtaGTGGTTTAATAAATTTGGCCACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGaaaaaaattcaacg > 1:111210/5‑291 (MQ=9) gtaGTGGTTTAATAAATTTGGCCACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGACTGTTGGGCTTTCCACCTTGACGCGGCGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAAAACCGAAAGCATCCACTATGACGCCGGAACAAATTGAGATAAGTGAGCtgacgaacaaaattcaacgta > 2:74110/3‑280 (MQ=2) ataaaTTTGGCCACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGANAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTNGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGaa < 2:588120/297‑1 (MQ=9) cACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGAAAACGAAATAtt > 1:61221/1‑300 (MQ=9) cACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCACAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGAAAACGAAATAtt > 2:242097/1‑300 (MQ=9) cACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACAAAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACTGAAAGCATTCACTATCACGCAGGAACAAATTGAGATATGTGAGCTAAAGGAAAAA‑CTTAAACGTATTGAAATGGaggaggacagatt > 2:296109/1‑288 (MQ=2) ccTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATCCGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGAAAACGAAATATTaa > 1:288690/1‑300 (MQ=9) ccTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGAAAACGAAATATTaa > 2:350793/1‑300 (MQ=9) gAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGAAAACGAAATATTaaaaa > 2:395237/1‑300 (MQ=9) gAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGAAAACGAAATATTaaaaa > 1:518778/1‑300 (MQ=9) gAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAAAGTATTGAAATGGAAAACGAAATATTaaaaa > 1:170052/1‑300 (MQ=9) gagGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAGAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCACTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGAAAACGAAATATTAAAAAAGGCt > 2:162053/1‑300 (MQ=9) gagGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGAAAACGAAATATTagaagcggct > 2:121364/1‑291 (MQ=9) gagGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGAAAACGAAATATTAAAAAAGGCt > 2:162209/1‑300 (MQ=9) gagGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGAAAACGAAATATTAAAAAAGGCt > 1:192868/1‑300 (MQ=9) ggTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCAGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAANGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGAAAACGAAATATTAAAAAAGGCTAc > 2:192843/1‑300 (MQ=9) gTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGN‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGAAAACGAAATATTAAAAAAGGCTACt > 1:619448/1‑300 (MQ=9) gTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGAAAACGAAATATTAAAAAAGGCTAcc > 2:409520/1‑299 (MQ=9) gTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGC‑CAAGCTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCAACTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCAGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGAAAACGAAATATTAAAAAAGGCTAcc > 2:368482/1‑299 (MQ=255) gAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGAAAACGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCa > 1:382453/1‑300 (MQ=255) gAACAACACAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCACTATCACGCCGGAACAAATTGAGCTACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGAAGACGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCa > 2:745400/1‑300 (MQ=255) aacaCAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGAAAACGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGc < 1:22278/300‑1 (MQ=255) acacAGGTGCCTTAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGAAAACGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCa < 1:514097/300‑1 (MQ=255) aggtgccttAATGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGAAAACGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACac < 1:489140/292‑2 (MQ=2) aTGAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTGACGCGGTGGGTAAAGCAATTACTGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGAAAACGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATCTGTCAATGCAACacccctttcaat < 1:344271/300‑12 (MQ=2) gAAAAAACGAAATTTCAGTGCAGAATTCAGACGTGAATCAGCCCAG‑CTGGTTGTGGATCAGAACTATACAGTTGCAGATGCCGCGAAAGCCATGAATGTCGGGCTTTCCACCTTTACGCGGTGGGTAAAGCAATTACGGGACGAACGGGCAGG‑CAAAACACCGAAAGCATCCCCTATCACGCCGGAACAAATTGAGATACGTGAGCTGA‑AGAAAAAAATTCAACGTATTGAAATGGAAAACGACATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAAc < 2:543435/300‑1 (MQ=255) | TCATGAATCCTTTTCACTAGGGATGAAGTGGTTTACTGAATTTGGCCACCTGAACAGAGGTGATATGCTCACCTCAGAACAACACAGGTGTCATAATGAAAAAAAGAAATTTCAGCGCAGAGTTTAAACGCGAATCCGCTCAA‑CTGGTCGTTGACCAGAACTACACCGTGGCAGATGCAGCCAGCGCTATGGATGTCGGCCTTTCCACAATGACGCGATGGGTGAAACAATTACGTGATGAACGG‑CAGGGCAAAACACCAAAAGCCTCCCCCATTACCCCGGAACAAATTGAAATCCGTGAGCTCA‑GGAAAAAGCTACAACGTATTGAAATGGAAAATGAAATATTAAAAAAGGCTACTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAAC > NC_000913/270183‑270579 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |