New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 3374874 | 107 (1.010) | coding (6/1368 nt) | dcuD | putative transporter DcuD | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
TGCCTCATCATTACCATAATTAACGGAATAATTAACTATTGCGAAAAATTAATGTAACGCAGATAAAAACATCCCGTTTGAATTATTTATAAGACTATTCACGAGCATTATGAATATTATGAATGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGGTGGTGCTGGCTGCCGCAGGTATCTTCCTGATGATGTGCGGTGTCTGGTTAGGGTTCGGTGGTGTACTCGATCCCACCAAAAGCAGCGGCTACTTGATCGTCGATATTTATAATGAAATCCTGCGCATGCTGTCCAACCGCATTGCCGGATTGGGGCTGTCGATTATGGCGGTGGGCGGTTATGCCCGCTACATGGAGCGCATAGGGGCCAGTCGCGCGATGGTGAGC > NC_000913/3374575‑3375171 | tgCCTCATCATTACCATAATTAACGGAATAATTAACTATTGCGAAAAATTAATGTAACGCAGATAAAAACATCCCGTTTGAATTATTTATAAGACTATTCACGAGCATTATGAATATTATGAATGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTc < 1:479061/300‑1 (MQ=255) 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catcatTACCATAATTAACGGAATAATTAACTATTGCGAAAAATTAATGTAACGCAGATAAAAACATCCCGTTTGAATTATTTATAAGACTATTCACGAGCATTATGAATATTATGAATGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTctagac < 1:45597/300‑6 (MQ=255) catcatTACCATAATTAACGGAATAATTAACTATTGCGAAAAATTAATGTAACGCAGATAAAAACATCCCGTTTGAATTATTTATAAGACTATTCACGAGCATTATGAATATTATGAATGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTCTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATNCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCAt > 2:760989/1‑300 (MQ=255) atcatTACCATAATTAACGGAATAATTAACTATTGCGAAAAATTAATGTAACGCAGATAAAAACATCCCGTTTGAATTATTTATAAGACTATTCACGAGCATTATGAATATTATGAATGTGTTCTTACAAAATAATTATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCAACTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCATTGCACAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGCTTTCTTTTGCCATGGAGTTCAACAATGTTCGACATa > 2:27206/1‑300 (MQ=255) 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TGCCTCATCATTACCATAATTAACGGAATAATTAACTATTGCGAAAAATTAATGTAACGCAGATAAAAACATCCCGTTTGAATTATTTATAAGACTATTCACGAGCATTATGAATATTATGAATGTGTTCTTACAAAATAATCATAAGCGCATATTTTTTAATGAAAAATCACCTCACCTACAATTAAAAACACGACATCCGCACCATAAATAGCCTTGCAAAAAATATAACATCGTTGTTTTCAATCTGCCGTTTATGGGATTGACCGTTTTCTTTTGACACGGAGTTCAACAATGTTCGGCATAATTATATCTGTCATCGTATTAATTACGATGGGCTATTTGATCCTGAAAAACTACAAACCTCAGGTGGTGCTGGCTGCCGCAGGTATCTTCCTGATGATGTGCGGTGTCTGGTTAGGGTTCGGTGGTGTACTCGATCCCACCAAAAGCAGCGGCTACTTGATCGTCGATATTTATAATGAAATCCTGCGCATGCTGTCCAACCGCATTGCCGGATTGGGGCTGTCGATTATGGCGGTGGGCGGTTATGCCCGCTACATGGAGCGCATAGGGGCCAGTCGCGCGATGGTGAGC > NC_000913/3374575‑3375171 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |