| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 2,176,322 | IS1 (–) +9 bp | intergenic (‑1/+20) | gatZ ← / ← gatY | putative tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 2 chaperone/tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 2 |
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| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 93 (0.880) | 60/598 | 0.5 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2176322 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+28) | gatZ/gatY | putative tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 2 chaperone/tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 2 | |||||
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
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gCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATGTTTTTTCCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacgtcaaagggtgaaagcaagctcata < 2:178914‑M2/300‑263 (MQ=255) cTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATGTTTTTTCCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacgtcaaagggtgacagcaggctcataa > 1:41361‑M2/1‑37 (MQ=255) ttATGCCGGGCAATTAACTTTTTCAGGTGTTTTCCggtaatgactccaacttagtgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttttcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcgattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccggcatccatagcaccacgtcaaagggggacagcaggctcataaga > 1:729518‑M2/1‑35 (MQ=255) tATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATGTTTTTTCCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacgtcaaagggtgacagcaggctcataagac > 1:813689‑M2/1‑34 (MQ=255) cagtaagttggcagcatcaccGTTTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACTGCAAATAATCCCGGGGATCGGTCGCTTCAGGGTGCTCGGTCAGGTAATTTTTTAACGCCTGCGAGAAGGCATTTTTCAGCTCCGTTGCAACGTTGATTTTGCATATCCCCAGTTTGATGGTTTGCTGAATATCCTTAGTCGATAACCCTGACGCGCCATGCAGCACCAGCGGTAAGt < 1:563909‑M2/279‑1 (MQ=255) aCGTTTTCATGTTTTTTCCggtaatgactccaacttattgatagttttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccatccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacgtcaaagggtgacagcaggctcataagacgccccagcgtcgcca > 2:286118‑M2/1‑19 (MQ=255) ttttCATGTTTTTTCCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacgtcaaagggtgacagcaggctcataagacgccccagcgtcgccatag > 2:557989‑M2/1‑16 (MQ=255) tttttCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACTGCAAATAATCCCGGGGATCGGTCGCTTCAGGGTGCTCGGTCAGGTAATTTTTTAACGCCTGCGAGAAGGCATTTTTCAGCTCCGTTGCAACGTTGATTTTGCATATCCCCAGTTTGATGGTTTGCTGAATATCCTTAGTCGATAACCCTGACGCGCCATGCAGCACCAGCGGTAAGTTCACCCACTGGCGAATGTTCTcc < 1:274702/300‑1 (MQ=255) tCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACTGCAAATAATCCCGGGGATCGGTCGCTTCAGGGTGCTCGGTCAGGTAATTTTTTAACGCCTGCGAGAAGGCATTTTTCAGCTCCGTTGCAACGTTGATTTTGCATATCCCCAGTTTGATGGTTTGCTGAATATCCTTAGTCGATAACCCTGACGCGCCATGCAGCACCAGCGGTAAGTTCACCCACTGGCGAATGTTCTCCAGTc < 2:401014/300‑1 (MQ=255) | TTCTTGCTGCCAGCAGTTTGGCCCCAGATGATCGCCGCCGAGAATAATGCGTTCGCGTGCAAACCCAACTTTATCGGCAATCGTAAAAACAAATTCGCGAAAGTCTGCCGGTGTCATTCCGGTATAACCGCCAAATTGATTGACCTGGTTTGACGTTGCTTCAATCAGCACTTTGCGCGTGCTGTTGCGATCAAATGCCAGCGCCGCTTCGATAACCAACGGATGGGCAGAACAGACTGAACATATGCCGATATGTTCACCAGCTTTATGCCGGGCAATTAACGTTTTCATGTTTTTTCCTTGTTAAATGGCAGGTGCGTTATGCCCTGCCCTCGCAGCCACAATCGGCAATCACTTTGCTCACCACATCGCGCATTGCGGATTTAGCCGACTGCAAATAATCCCGGGGATCGGTCGCTTCAGGGTGCTCGGTCAGGTAATTTTTTAACGCCTGCGAGAAGGCATTTTTCAGCTCCGTTGCAACGTTGATTTTGCATATCCCCAGTTTGATGGTTTGCTGAATATCCTTAGTCGATAACCCTGACGCGCCATGCAGCACCAGCGGTAAGTTCACCCACTGGCGAATGTTCTCCAGTC > NC_000913/2176031‑2176627 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |