| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,465,517 | IS2 (–) +5 bp | pseudogene (126‑130/2518 nt) | ydbA → | putative outer membrane protein, N‑terminal fragment |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 1465517 = | 0 (0.000) | 101 (0.960) | 69/598 | 0.2 | 100% | pseudogene (126/2518 nt) | ydbA | putative outer membrane protein, N‑terminal fragment |
| ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1465521 | 0 (0.000) | 116 (1.100) | 75/598 | 0.1 | 100% | pseudogene (130/2518 nt) | ydbA | putative outer membrane protein, N‑terminal fragment |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
TCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAGGAAAGTATGTTTGATTAGATAATAATCTACTGGCAATATTGGATGTCTTCTATGTTTTAAATAACTAATTGGTCGGGTTAGTGCATCCGGCTTTCTTTATATTCGCCAGAAGGATTTATTATGCAAAGGAAAACTCTATTGTCGGCCTGTATTGCATTAGCTCTGAGTGGTCAGGGTTGGGCGGCAGATATCACAGAGGTAGAAACCACCACAGGTGAAAAGAAAAATACCAATGTGACTTGTCCGGCAGACCCAGGAAAACTCAGTCCGGAAGAGCTTAAACGCTTACCCTCTGAATGCTCTCCTTTAGTCGAACAAAACCTGATGCCATGGCTTTCCACAGGCGCTGCTGCGTTAATCACGGCCTTAGCCGTAGTGGAACTAAACGACGATGATGATCATCATCATCGCAACAATTCTCCACTCCCACCGACACCCCCTGATGATGAATCAGACGACAC‑TCCAGTTCCCCCAACTCCTGGCGGAGATGAGATAATACCGGACGATCCGGATGATACGCCTACACCTCCCAAACCGGTTTCGTTTAAT > NC_000913/1465227‑1465820 | tCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAGGAAAGTATGTTTGATTAGATAATAATCTACTGGCAATATTGGATGTCTTCTATGTTTTAAATAACTAATTGGTCGGGTTAGTGCATCCGGCTTTCTTTATATTNGCCAGAAGGATTTATTATGCAAAGGANAACTCTATTGTCGGCCTGTATTGCATTAGCTCTGAGTGGTCAGGGTTGGGCGGCAGATATCACAGAGGTAGAAACCACCACAGGTGAAAAGAAAAATACCAATGTGACTTGTCCGGCAGtggat < 2:578198‑M1/300‑6 (MQ=255)tCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAGGAAAGTATGTTTGATTAGATAATAATCTACTGGCAATATTGGATGTCTTCTATGTTTTAAATAACTAATTGGTCGGGTTAGTGCATCCGGCTTTCTTTATATTCGCCAGAAGGATTTATTATGCAAAGGAAAACTCTATTGTCGGCCTGTATTGCATTAGCTCTGAGTGGTCAGGGTTGGGCGGCAGATATCACAGAGGTAGAAACCACCACAGGTGAAAAGAAAAATACCAATGTGACTTGTCCGGCAGtggat < 1:768870‑M1/300‑6 (MQ=255) tttATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAGGAAAGTATGTTTGATTAGATANTAATCTACTGGCAATATTGGATGTCTTCTATGTTTTAAATAACTAATTGGTCGGGTTAGTGCATCCGGCTTTCTTTATATTCGCCAGAAGGATTTATTATGCAAAGGAAAACTCTATTGTCGGCCTGTATTGCATTAGCTCTGAGTGGTCAGGGTTGGGCGGCAGATATCACAGAGGTAGAAACCACCNCAGGTGAAAAGAAAAATACCAATGTGACTTGTCCGGCAGtggatttgcccctatat < 2:800579‑M1/300‑18 (MQ=255) cagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccgaacccaagaaatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaaatagtattaagactatcaattatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGCAGACCCAGGAAAACTCAGTCCGGaa < 1:534318‑M1/28‑1 (MQ=255) 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tgtgAATTATAGGAAAGTATGTTTGATTAGATAATAATCTACTGGCAATATTGGATGTCTTCTATGTTTTAAATAACTAATTGGTAGGGTTAGTGCATCCGGCTTTCTTNATATTCGCCAGAAGGATTTATTATGCAAAGGAAAACTCTATTGTCGGCCTGTATTGCATTAGCTCTGAGTGGTCAGGGTTGGGCGGCAGATATCACAGAGGTAGAAACCACCACAGGTGAAAAGAAAAATACCAATGTGACTTGTCCGGCAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcact < 1:598460‑M1/300‑39 (MQ=255) gtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGCAGACCCAGGAAAACTCCGTCCGGAAGAGCTTAAACGCTTACCCTCTg < 2:550085‑M1/50‑1 (MQ=255) ggAAAGTATGTTTGATTAGATAATAATCTACTGGCAATATTGGATGTCTTCTATGTTTTAAATAACTAATTGGTCGGGTTAGTGCATCCGGCTTTCTTTATATTCGCCAGAAGGATTTATTATGCAAAGGAAAACTCTATTGTCGTCCTGTATTGCATTAGCTCTGAGTGGTCAGGGTTGGGCGGCAGATATCACAGAGGTAGAAACCACCACAGGTGAAAAGAAAAATACCAATGTGACTTGTCCGGCAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattac < 1:282115‑M1/300‑50 (MQ=255) 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caGGTGAAAAGAAAAATACCAATGTGACTTGTCCGGCAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttc < 1:845479‑M1/300‑262 (MQ=255) tcaATGTGACTTGTCCGGCGGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcaataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcactaagctccctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttcggttcaagtcccaacatc < 1:385287‑M1/299‑280 (MQ=255) agtctaGGCAGACCCAGGAAAACTCAGTCCGGAAGAGCTTAAACGCTTACCCTCTGAATGCTCTCCTTTAGTCGAACAAAACCTGATGCCATGGCTTTCCACAGGCGCTGCTGCGTTAATCACGGCCTTAGCCGTAGTGGAACTAAACGACGATGATGATCATCATCATCGCAACAATTCTCCACTCCCACCGACACCCCCTGATGATGAATCAGACGACAC‑TCCAGTTCCCCCAACTCCTGGCGGAGATGAGATAATACCGGACGATCCGGATTATACGCCTACACCTCCCAAACCGGt < 1:857643‑M1/294‑1 (MQ=255) agtctaGGCAGACCCAGGAAAACTCAGTCCGGAAGAGCTTAAACGCTTACCCTCTGAATGCTCTCCTTTAGTCGAACAAAACCTGATGCCATGGCTTTCCACAGGCGCTGCTGCGTTAATCACGGCCTTAGCCGTAGTGGAACTAAACGACGATGATGATCATCATCATCGCAACAATTCTCCACTCCCACCGACACCCCCTGATGATGAATCAGACGACAC‑TCCAGTTCCCCCAACTCCTGGCGGAGATGAGATAATACCGGACGATCCGGATGATACGCCTACACCTCCCAAACCGGt < 1:192146‑M1/294‑1 (MQ=255) agtctaGGCAGACCCAGGAAAACTCAGTCCGGAAGAGCTTAAACGCTTACCCTCTGAATGCTCTCCTTTAGTCGAACAAAACCTGATGCCATGGCTTTCCACAGGCGCTGCTGCGTTAATCACGGCCTTAGCCGTAGTGGAACTAAACGACGATGATGATCATCATCATCGCAACAATTCTCCACTCCCACCGACACCCCCTGATGATGAATCAGACGACAC‑TCCAGTTCCCCCAACTCCTGGCGGAGATGAGATAATACCGGACGATCCGGATGATACGCCTACACCTACCAAACCGGt < 1:679957‑M1/294‑1 (MQ=255) gtctaggCAGACCCAGGAAAACTCAGTCCGGAAGAGCTTAAACGCTTACCCTCTGAATGCTCTCCTTTAGTCGAACAAAACCTGATGCCATGGCTTTCCACAGGCGCTGCTGCGTTAATCACGGCCTTAGCCGTAGTGGAACTAAACGACGATGATGATCATCATCACCGCAACAATCCTCCACCACCAACAACACCCCATGATGATGAAGCAGACAACACGACCA‑TCCCCCCCACTCACGGAGGNGAGGAGATAATAAAGGACGATCCGgatgatcctactcaacctcccaaaacggcg > 2:650245/6‑276 (MQ=255) gtctaGGCAGACCCAGGAAAACTCAGTCCGGAAGAGCTTAAACGCTTAAACTCTGAATGCTCTCCTTTAGTCGAACAAAACCTGATGCCATGGCTTTCCACAGGCGCTGCTGCGTTAATCACGGCCTTAGCCGTAGTGGAACTAAACGACGATGATGATCATCATCANCGCAACAATTCTCCACTCCCACCGACACCCCCTGATGATGAATCAGACGCCAC‑TCAAGTTCCCCCAACTCCTGGTGGAGATGAGATAATAACGAACGATCCGGATAATACGCTTAAAcctaccaaaaaggtt < 2:218473‑M1/295‑7 (MQ=255) gTCCGGCAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttcggttcaagtcccaacatccgggcgaactgg > 1:686623‑M1/1‑9 (MQ=255) gACCCAGGAAAACTCAGTCCGGAAGAGCTTAAACGCTTACCCTCTTAATGCTCTCCTTTAGTCGAACAAAACCTGATGCCATGGCTTTCCACAGGCGCTGCTGCGTTAATCACGGCCTTAGCCGTAGTGGAACTAAACGACGATGATGATCATCATCATCGCAACAATTCTCCACTCCCACCGACACCCCCTGATGATGAATCAGACGACAC‑TCCAGTTCCCCCAACTCCTGGCGGAGATGAGATAATACCGGACGATCCGGATGATACGCCTACACCTCCCAAACCGGTTTCGTTtaat > 1:697952/1‑300 (MQ=255) | TCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAGGAAAGTATGTTTGATTAGATAATAATCTACTGGCAATATTGGATGTCTTCTATGTTTTAAATAACTAATTGGTCGGGTTAGTGCATCCGGCTTTCTTTATATTCGCCAGAAGGATTTATTATGCAAAGGAAAACTCTATTGTCGGCCTGTATTGCATTAGCTCTGAGTGGTCAGGGTTGGGCGGCAGATATCACAGAGGTAGAAACCACCACAGGTGAAAAGAAAAATACCAATGTGACTTGTCCGGCAGACCCAGGAAAACTCAGTCCGGAAGAGCTTAAACGCTTACCCTCTGAATGCTCTCCTTTAGTCGAACAAAACCTGATGCCATGGCTTTCCACAGGCGCTGCTGCGTTAATCACGGCCTTAGCCGTAGTGGAACTAAACGACGATGATGATCATCATCATCGCAACAATTCTCCACTCCCACCGACACCCCCTGATGATGAATCAGACGACAC‑TCCAGTTCCCCCAACTCCTGGCGGAGATGAGATAATACCGGACGATCCGGATGATACGCCTACACCTCCCAAACCGGTTTCGTTTAAT > NC_000913/1465227‑1465820 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |