| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 1,091,130 | IS2 (–) +5 bp | coding (1156‑1160/2424 nt) | pgaA ← | partially deacetylated poly‑beta‑1,6‑N‑acetyl‑D‑glucosamine export outer membrane porin |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1091134 | 1 (0.010) | 110 (1.040) | 77/598 | 0.1 | 99.1% | coding (1156/2424 nt) | pgaA | partially deacetylated poly‑beta‑1,6‑N‑acetyl‑D‑glucosamine export outer membrane porin |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
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GCTGCCATTCTTGTAACGTTAATGCTGTCCAGGCTTGTTCAACCTCCAGATTAATATTACGTGGCTCGATCACTTCTGCTTTTTTTAATTCATTTTCTGCTGCACGAGGCCAACCGCGGGCTTGTAACACACTCGCGTAATCAATGCGCAGTCCCTGATTTCCTGGTGCGTTATAAGCAAGCTCTCTGGCTGTCATTTCAGCCTGAGGAAGATCATTACTATATTTTGCTACGGTTGAGAGAAACGAATGCCCCTGTAACCAGGTATCATTCGGGATGCTCGTAGGCGTGCCCATTAACCGAAGGAAAGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCCGGATAATTTTCACTCTCCAGGTGGCTGTAAAAGAGATCCGCAAGTTCTTCATCGGATAAATCCGGGGCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCTTTGAGATAAGCCGATGCAACCCAATATTGCCCCCAGGGCGGAATAATTTGCCCCGTCTTTTTTAATCGCTGATAGTGAGAAATAACGTCTTTATAACGATCGCGAGTTAATAA > NC_000913/1090831‑1091428 | gaacaacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgtgcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCGaa > 2:135194‑M1/297‑300 (MQ=255) 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tggttgtctggagattcagggggccagtctaCGAAGGAAAGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCCGGATAATTTTCACTCTCCAGGTGGCTGTAAAAGAGATCCGCAAGTTCTTCATCGGATAAATCCGGGGCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCTTTGAGATAAGCCGATGCAACCCAATATTGCCCCCAGGGCGGAATAATTTGCCCCGTCTTTTTTAATCGCTGATAGTGAGAAAt > 1:668950‑M1/32‑300 (MQ=255) attcagggggccagtctaCGAAGGAAAGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGTTGACAGTTAGCGCGCCCGGATAATTTTCACTCTCCAGGTGGCTGTAAAAGAGATCCGCAAGTTCTTCATCGGATAAATCCGGGGCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCTTTGAGATAAGCCGATGCAACCCAATATTGCCCCCAGGGCGGAATAATTTGCCCCGTCTTTTTTAATCGCTGATAGTGAGAAATAACGTCTTTATaa > 1:336455‑M1/19‑300 (MQ=255) tGCCCATTAACCGAAGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaaccagtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttcggttcaagtcccaacatccgggc < 1:32358‑M1/300‑285 (MQ=255) tGCCCATTAACCGAAGtggatttgcccctatatttccagacagctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttntaatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttcggttcaagtcccaacatccgggc < 2:215302‑M1/300‑285 (MQ=255) ggccagtctaCGAAGGAAAGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCCGGATAATTTTCACTCTCCAGGTGGCTGTAAAAGAGATCCGCAAGTTCTTCATCGGATAAATCCGGGGCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCTTTGAGATAAGCCGATGCAACCCAATATTGCCCCCAGGGCGGAATAATTTGCCCCGTCTTTTTTAATCGCTGATAGTGAGAAATAACGTCTTTATAACGATcgcg > 1:289727‑M1/11‑300 (MQ=255) gtctaCGAAGGAAAGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGGCAGTTAGCGCGCCCGGATAATTTTCACTCTCCAGGTGGCTGTAAAAGAGATCCGCAAGTTCTTCATCGGATAAATCCGGGGCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCTTTGAGATAAGCCGATGCAACCCAATATTGCCCCCAGGGCGGAATAATTTGCCCCGTCTTTTTTAATCGCTGATAGTGAGAAATAACGTCTTTATAACGATCGCGAGTta < 2:62291‑M1/295‑1 (MQ=255) 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GCTGCCATTCTTGTAACGTTAATGCTGTCCAGGCTTGTTCAACCTCCAGATTAATATTACGTGGCTCGATCACTTCTGCTTTTTTTAATTCATTTTCTGCTGCACGAGGCCAACCGCGGGCTTGTAACACACTCGCGTAATCAATGCGCAGTCCCTGATTTCCTGGTGCGTTATAAGCAAGCTCTCTGGCTGTCATTTCAGCCTGAGGAAGATCATTACTATATTTTGCTACGGTTGAGAGAAACGAATGCCCCTGTAACCAGGTATCATTCGGGATGCTCGTAGGCGTGCCCATTAACCGAAGGAAAGGCGGCGAAGTATTAATGGTATGTTGGGTGACAGTTAGCGCGCCCGGATAATTTTCACTCTCCAGGTGGCTGTAAAAGAGATCCGCAAGTTCTTCATCGGATAAATCCGGGGCAATGGTCTCCTTGTGATAAAAGAGCTCGGTCATTATTGACTGTGCTTTTTTCGGCTGATGATCTTTGAGATAAGCCGATGCAACCCAATATTGCCCCCAGGGCGGAATAATTTGCCCCGTCTTTTTTAATCGCTGATAGTGAGAAATAACGTCTTTATAACGATCGCGAGTTAATAA > NC_000913/1090831‑1091428 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |