| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 2,774,080 | G→T | V255F (GTC→TTC) | yfjW → | uncharacterized protein YfjW |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,774,080 | 0 | G | T | 99.3% | 532.9 / ‑4.9 | 146 | V255F (GTC→TTC) | yfjW | uncharacterized protein YfjW |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (77/68); minor base C (0/1); total (77/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
AGATAAAACATATTCCAATGATTTTATCGGCAATGATTCCATTAGTTTCCGCAATAATAATAGCCATACTCATAACCGCTGTTATATATTTATTGTTTGCCCGGCAGGCGGTAGAGATTGAGATGGATATATCTGAAGGTTCAGACATCGCATATGTAGGTGTAAAAGATAATGAGGAATCATTTGGGTTTTTAAATGATAAAAAAACAGACACACCAACGTATCTGGATGTAATCAAAAATGGTAGTTTGATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGATGTGATGCCTAAAGCAGCATCCAGGTTAAGTTTGAGCAAGCAAGATGATAAATTTATGCTAGCCTCAAGTGTTACTGACTCTCAAATAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTT > NC_000913/2773784‑2774374 | aaaCATATTCCAATGATTTTATCGGCAATGATTCCATTAGTTTCCGCAATAATAATAGCCATACTCATAACCGCTGTTATATATTTATTGTTTGCCCGGCAGGCGGTAGAGATTGAGATGGATATATCTGAAGGTTCAGACATCGCATATGTAGGTGTAAAAGATAATGAGGAATCATTTGGGTTTTTAAATGATAAAAAAACAGACACACCAACGTATCTGGATGTAATCAAAAATGGTAGTTTGATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTTTCTCCGgt > 1:370581/1‑300 (MQ=255) 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gtgCTGATATTTATACTTTCTCCTGTTGTTATTCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTGCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGATGTGATGCCTAAAGCAGCATCCAGGTTAAGTTTGAGCAAGCAAGATGATAAATTTATACTAGCCTCAAGTGTTACTGACTCTCAAATAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATaacaa < 2:66324/300‑1 (MQ=255) tatTTATATTTTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGATGTGATGCCTAAAGCAGCATCCAGGTTAAGTTTGAGCAAGCAAGATGATAAATTTATGCTAGCCTCAAGTGTTACTGACTCTCAAATAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAAAGAATgg > 1:285200/1‑300 (MQ=255) atatTTTCTCCGTTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGATGTGATGCCTAAAGCAGCATCCAGGTTAAGTTTGAGCAAGCAAGATGATAAATTTATGCTAGCCTCAAGTGTTACTGACTCTCAAATAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTAttt < 2:718901/300‑1 (MQ=255) | AGATAAAACATATTCCAATGATTTTATCGGCAATGATTCCATTAGTTTCCGCAATAATAATAGCCATACTCATAACCGCTGTTATATATTTATTGTTTGCCCGGCAGGCGGTAGAGATTGAGATGGATATATCTGAAGGTTCAGACATCGCATATGTAGGTGTAAAAGATAATGAGGAATCATTTGGGTTTTTAAATGATAAAAAAACAGACACACCAACGTATCTGGATGTAATCAAAAATGGTAGTTTGATATATAATGATACACAGGGTTTAAGTGGTGCTGATATTTATATTGTCTCCGGTTGTTATGCCCTTCCAGATTTACTTCGCAATGTACCGCTTGATGCTAAAAAATCTTTTCTGAATGTAAAAAAGCTAGAAATCACACAGAAACTTCCAATGATGGGGTTCATACAAGGTGAATCCGCTGATGTGATGCCTAAAGCAGCATCCAGGTTAAGTTTGAGCAAGCAAGATGATAAATTTATGCTAGCCTCAAGTGTTACTGACTCTCAAATAAAATTTAAATCAAACAATGCACAATTGATGGTTGCTTTCGCATTTATGCCAATAACAACGAATGGTATTT > NC_000913/2773784‑2774374 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |