New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4392437 | 80 (0.750) | 4 (0.050) | 4/442 | 8.0 | 4.8% | intergenic (+2/‑35) | glyV/glyX | tRNA‑Gly/tRNA‑Gly |
? | NC_000913 | 4392661 = | 98 (1.240) | intergenic (+3/‑231) | glyY/yjeV | tRNA‑Gly/uncharacterized protein YjeV | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
GCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGTTTTGTCGAGTCGATCACTTGACGATTTTATTCGTCTTGAATTGCAATGCGTTTTTATTTTTATTCACAAGCTGTGGATGAATCAGGCGTCACGCGGTAACCCTTTTTC > NC_000913/4392369‑4392954 | gCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTATTGCAAATCCCAGACCACCCAAGTGGGAATAGCTAGGTTGTTANAGCCCGACCTTACCAAGGTCGGGGTC‑NCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCACTCCAAACTTTAAAAATACTACACGGCACAGACCACC‑CAATTGGGCATCGCTAAGTTGGTAGATCCCGACCCCGCCCGTGTCAGGGTCGCTAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAtccttcca > 2:569070/1‑298 (MQ=9) aGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGGTATTGCAAATCACAAACCACCCAAGCGGGAATAGCTAAGTTGGTAGATCACGACCTTACCAAGGTCGGGGTA‑GGGAGTTCAAGCCTAGTTTCNCGCTCCAAAATTTGAAAACACTACACAGCACAAAACACA‑CAAGTGGGGATCGCTCAGTTTGTGCAGCCCGAACCTGCCCAGGTCGGGTTAGTGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAttttcacctcaa > 2:192128/1‑290 (MQ=9) tAGAGCACGACCGTGCCAAGGGCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAat < 1:191826/300‑1 (MQ=255) aCGACCTTGCCGAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCcac < 1:205171/300‑1 (MQ=255) aCCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCACATTCTTCTCTCAATCAAATATCCACAGc > 1:847730/1‑300 (MQ=255) aCCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCACTAAAATATCCCCAGc > 1:384134/1‑300 (MQ=255) ccTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGcc < 1:5165/300‑2 (MQ=255) tGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGACAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCCTGCCAAGGTCGGGGTCGCGCGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTATAAATAAAATATCCACAGCGAcg > 1:775238/1‑300 (MQ=255) gCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGAcgc < 1:209590/300‑1 (MQ=255) ggTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTTACAGTGCTGTAAGGCCCAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGATCAGTTGGTATCGCCCGCACTCACCACGGTCAGGATCGCGCGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTTTTATATCAATAAAATATCCCAAGCGACGCGTTGc > 1:781505/1‑300 (MQ=18) ggTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAACTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAACTATCCACAGCGACGCGATGc > 1:285401/1‑300 (MQ=255) gggTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTAt > 1:739861/1‑300 (MQ=255) gCTCCAAAATTTGAAAAGTGCGGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGGTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAAc < 1:65834/300‑1 (MQ=255) aaTTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGTTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTa > 1:274962/1‑300 (MQ=255) ttGAAACGTACTGCAAAACACAGACCACACAAGCGGTAATAGCGCATTTTTTGGAGCACGACCTCGCCAAGGTCGGGGTC‑TCGAGTTCGAATCTCGTCTCCCGCTCCAAAATTTAAAAATACTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAAc < 2:445516/300‑1 (MQ=21) gTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTTAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGATATAAGGCACAGACCACC‑CAAGTGGGAATAGCTCAGTTGGTAGCGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTATCTAAATAAAATATCCACAACGACGCGGTGTGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTATATGATAAACTCTTGTGAAGAGAGTTa > 2:67020/1‑300 (MQ=18) gTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTa > 1:104228/1‑300 (MQ=255) gTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTATCAATAAAGTATCCACAGCGACGCGATGCGTCATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTCGTAAACAGAGTTa > 2:522021/1‑300 (MQ=255) gTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGCGCTGTAATGCCCAGACCACC‑CAAGCGGGAATCGCTCAGTTGTTATAGCACGACCTCAACAAGGTCGGGGTAGAGCGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCACATTCTCATCTCAATACAACATCCCCAGCAACGCTATGCGTGATTGCTGGTTGGTGTTGTCTATGACAAACTCTTGTaccccgagtta > 2:475853/1‑290 (MQ=17) ctgcAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCATTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATcc < 1:536097/300‑1 (MQ=255) ctgcAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGACAGCGCTGTAAGGCCCAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGCGCACGACATTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTATCTCAATCACATATCCCCAGCGACGCGATTCGTTCTTTCTGGTTTTTGCTGTCTCTGACAAACTCTCGTAAACAGAGTTATcc > 2:254236/1‑300 (MQ=18) ctgcAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATcc < 1:679457/300‑1 (MQ=255) ctgcAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTATAAGGCCCAGAACACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAACTTGCCAAGGTCGGGGTCACGAGTTCGAGTCTCGTTTCCAGCTCCAAATTCTTCTATCAATAAAATATCCCCAGCGACGCGGTGCGCTCTTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGCCAAACTCTTGTAAACCAAGTTATcc > 2:657514/1‑300 (MQ=18) cggcAAAACACGGACCACTCAAGCGTGAAGAGTTAGGTTGTTAGATCACGACTTTGCCAAAGGCGGG‑TCTACGAGGTCGAGTCTCGTTTCTTGCTCCAAAGGTTGAAAGTGCTGTAAGGCACGGACCACC‑CAAGTGGGAATAGCTCAGTTGTTAGAGCACGATCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGATTTCGAGGCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCCTCTCTCAATAAAAGATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTGGTCGCTGACAAACTCTTGTAAACAGATTTATcc < 2:292189/298‑1 (MQ=255) gcAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGTGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGCGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTCCTATCAATAAAACATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTATGACAAACTCTCGTAAACAGAGTTATCcac > 2:271550/1‑300 (MQ=255) gcAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGACTAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGAGTCGCGAGTTCGCGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTATCTCAATACAATATCCACAGCGACGCGATGTGTTCTTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCcac > 2:270192/1‑300 (MQ=255) gcAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCcac > 1:688524/1‑300 (MQ=255) gcAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCAAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCCCAGACCACC‑AAAGCGGGAACAGATCAGTTGGTAGAGCACGACCTTACCCAGGTCGGAGTAGAGAATTCGAGGCTCGTTTCCAGATCCCTAGTCTCATAGCAATAAAATATGCATAGCGACGCGGTGCGTTCTTGTTGGTTTTTATTGTCCATGACCAAATTTTGTCAACCGAGTTCTCcac > 2:75308/1‑300 (MQ=9) aaacacaGACCACCCACGCGGGAATAGCTCAGTTTGTAGAGCACTACCTTGCCAAGGTCGGGTTC‑GCGAGTGCGAGTCTCGTTTCCCGTTCCAAAATTTGAAAGTGCTGGAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTNGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTNGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGc < 2:590743/297‑1 (MQ=21) aaGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAACTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTATCTCAATCAAATATCCACAGCGACACGATGCGCNATTGCTGGTTGTTGTTGTCTATGACAAACTCTTGTACACAGAGTTCTNCACAGc > 2:701328/1‑300 (MQ=18) aGCACGGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGcc > 1:459102/1‑300 (MQ=255) gCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTCGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTAAAAGTGCTGTAAGGCATAGACCGCC‑ACAGCGGGGCTATTTCGGTTGGTAGAGCACGAACTTACCAATTTCGGGGTCACTCGTTCGAGTCTCGTTTCCAGCTCCCCATTCTTATATAAATAAAATATCCACAGCGACGGGATGCGCCATTGCTTGTTTTTATTGTCTACGACAAACTCTTGtcgccagggttctgcccatcat > 2:445199/1‑279 (MQ=12) gCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGACTAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAACTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGCGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTATCAATAAAATATCCACAGCGACGCGGTGTGTTATTGTTGGTTTTTGTTGTCTATGCCAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGcat > 2:822845/1‑298 (MQ=21) gCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAACCAGAGTTATCCACAGCCt > 1:758216/1‑300 (MQ=255) gacaaccCAATCTGGAATAGCTCAGTTGTTAGAGCACGACCTGGCTAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGATTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCGCC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGc < 2:650120/296‑1 (MQ=21) gACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTAGGCACAGCCTCAGGc < 1:484215/300‑1 (MQ=255) ccaccCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAACTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAACTCTTATATCAATGAAATATCCACAGCGACGCGATGTGTTATTGCTGGTGTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAACCAGAGTTATcccacgcctcagtctg > 2:359562/1‑286 (MQ=18) 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gCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGCTTCCCTATCCAAATTCTTATCTAAATAAAACATCCAAAGTGACGCGATGCGTTATTGTCGATTTTTGTTGTCTATGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGTATCAGGCTTTAATCTCAATTTCAAAg > 2:45932/1‑300 (MQ=18) aGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATCTGACAGTGCTGCAATGCACAGACCACCACAA‑CGGGACTAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAACTTACCAAGGTCGGGATCGCGCGTTCGAGTCCCGTTTCCATCTCCAAATTCTTCTCTAAATAAAGTATCCACAGTGGCGTGGTGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTCCCCCGAGCTATCTACAGCCCAAAGCTGTAATCTTAATTTCCAAGAAAc > 2:323386/1‑300 (MQ=12) gTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAACAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAACATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCCGGTTTTTGTTATCTATGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTCCAAAGAAACt > 2:358195/1‑300 (MQ=255) 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cGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGTTTTGTCGAGTCGATCACTTGACGATTTTATTCGTCTTGAATTGCAATGCGTTTTTATTTTTATTCACAAGCTGTGGa < 1:307303/300‑1 (MQ=255) ggggTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACTGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGTTTTGTCGAGTCGATCACTTGACGATTTTATTCGTCTTGAATTGCAATGCGTTTTTATTTTTATTCACAAGCTGTGGAt < 1:227658/300‑1 (MQ=255) cgcgAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGTTTTGTCGAGTCGATCACTTGACGATTTTATTCGTCTTGAATTGCAATGCGTTTTTATTTTTATTCACAAGCTGTGGATGAATc < 2:717210/300‑1 (MQ=255) cGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGTTTTGTCGAGTCGATCACTTGACGATTTTATTCGTCTTGAATTGCAATGCGTTTTTATTTTTATTCACAAGCTGTGGATGAATCAGGCGTcg > 2:527828/1‑299 (MQ=255) ctcGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTATTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTCATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGTTTTGTCGAGTCGATCACTTGACGATTTTATTCGTCTTGAATTGCAATGCGTTTTTATTTTTATTCACAAGCTGTGGATGACTCAGGCGTCACGCgg > 2:468368/1‑300 (MQ=255) tCCCACTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACATCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGTTTTGTCGAGTCGATCACTTGACGATTTTATTCGTCTTGAATTGCAATGCGTTTTTATTTTTATTCACAAGCTGTGGATGAATCAGGCGTCACGCGGTAAccc < 2:378509/300‑1 (MQ=255) | GCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTC‑GCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACAGACCACC‑CAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACAGCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGTTTTGTCGAGTCGATCACTTGACGATTTTATTCGTCTTGAATTGCAATGCGTTTTTATTTTTATTCACAAGCTGTGGATGAATCAGGCGTCACGCGGTAACCCTTTTTC > NC_000913/4392369‑4392954 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |