| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 4,050,808 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑43/‑224) | yihA ← / → csrC | GTP‑binding protein YihA/small regulatory RNA CsrC |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 4050812 | 0 (0.000) | 115 (1.070) | 82/598 | 0.1 | 100% | intergenic (‑47/‑224) | yihA/csrC | GTP‑binding protein YihA/small regulatory RNA CsrC |
| ? | NC_000913 | = 4499511 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
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CCGCATAACCGTACCCAGGCAAGTCAACCAGACGCTTGCCGTCAGCCACTTCAAACAGGTTGATAAGCTGGGTGCGCCCTGGGGTTTTTGAGGTACGAGCCAGGCTTTTCTGGTTAGTCAGCGTGTTCAGCGCGCTGGATTTACCTGCGTTGGAACGGCCTGCAAAAGCCACTTCAATTCCGGTATCGGAAGGTAGGTGGCGAATATCAGGCGCACTCATCACAAAATGCGTCTGTTGATAATTCAAATTAGTCAAAGCGGTCGTCTCCGTCAGTCAAAGCTTTGTGGCGATTATACCTGAACCATAATAAAAGGCGGATTTTTCGGCGTGAGCGTTGTAAGTAAAAGCCATACGCTTTGTGAGACATTGCCGATAGTCTTTATGCGAAATAGCAGAGAAAATTCTGCGATGCATGTCAAATAAGCTATATAAATCAGTGAATTGCTTTTATATAAAACTCTGAAAATGTGCAAATACTGATGGCGGTTGATTGTTTGTTTAAAGCAAAGGCGTAAAGTAGCACCCATAGAGCGAGGACGCTAACAGGAACAATGACTCAGGATGAGGGTCAGGAGCGCCAGGAGGCGAAGACAG > NC_000913/4050510‑4051104 | ccGCATAACCGTACCCAGGCAAGTCAACCAGACGCTTGCCGTCAGCCACTTCAAACAGGTTGATAAGCTGGGTGCGCCCTGGGGTTTTTGAGGTACGAGCCAGGCTTTTCTGGTTAGTCAGCGTGTTCAGCGCGCTGGATTTACCTGCGTTGGAACGGCCTGCAAAAGCCACTTCAATTCCGGTATCGGAAGGTAGGTGGCGAATATCAGGCGCACTGATCACAAAATGCGTCTGTTGATAATTCNAATTAGTCAAAGCGGTCGTCTCCGTCAGTCAAAGCTTTGTGGCGATTATACCTg > 2:631210/1‑300 (MQ=255) aacaacctgttctccgtcggcgacagcagtaagacttccttcctgttattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctntgctgaacaattgcggtcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgacgagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTGAAc > 2:207482‑M1/296‑300 (MQ=255) aacaacctgtcctccggcggcggcagcaggaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataacgggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggaggctgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagatatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTGAAc > 2:115047‑M1/296‑300 (MQ=255) aacctgttctccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaTGAACCat < 1:678390‑M1/8‑1 (MQ=255) 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CCGCATAACCGTACCCAGGCAAGTCAACCAGACGCTTGCCGTCAGCCACTTCAAACAGGTTGATAAGCTGGGTGCGCCCTGGGGTTTTTGAGGTACGAGCCAGGCTTTTCTGGTTAGTCAGCGTGTTCAGCGCGCTGGATTTACCTGCGTTGGAACGGCCTGCAAAAGCCACTTCAATTCCGGTATCGGAAGGTAGGTGGCGAATATCAGGCGCACTCATCACAAAATGCGTCTGTTGATAATTCAAATTAGTCAAAGCGGTCGTCTCCGTCAGTCAAAGCTTTGTGGCGATTATACCTGAACCATAATAAAAGGCGGATTTTTCGGCGTGAGCGTTGTAAGTAAAAGCCATACGCTTTGTGAGACATTGCCGATAGTCTTTATGCGAAATAGCAGAGAAAATTCTGCGATGCATGTCAAATAAGCTATATAAATCAGTGAATTGCTTTTATATAAAACTCTGAAAATGTGCAAATACTGATGGCGGTTGATTGTTTGTTTAAAGCAAAGGCGTAAAGTAGCACCCATAGAGCGAGGACGCTAACAGGAACAATGACTCAGGATGAGGGTCAGGAGCGCCAGGAGGCGAAGACAG > NC_000913/4050510‑4051104 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |