| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 3487227 = | 39 (0.360) | coding (437/2103 nt) | yhfK | putative transporter YhfK | |||||
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
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tCTATGCGTTGGGCACTCTCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgccgcc < 1:135123‑M2/300‑281 (MQ=255) ctctctagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgccgccggagaacaggttgtt < 1:254623‑M2/300‑296 (MQ=255) ctctctagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagcaagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcgccgcaggagaacaggttgtt < 2:814400‑M2/300‑296 (MQ=255) | TTCCTGCCTGTTGCAATATTGCGGGCCTTGATACGCCTCATAAACGTTTTTTCAAACGCTTAATCATTGGTGCGTCGCTGTTTGCCACCTGTAGCTTGCTGACACAGCTACTACTGGCAAAAGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAGTCACTAAGTCTGCTGTACCGTGAACTGGCAGATTATTGTGAAGCCAAATACAGCCTGCTTACCCAGCACACCGACCCTGAAAAAGCGCTGCCGCCGCTGCTGGTGCGCCAGCAAAAAGCGGTCGATCTAATTACCCAGTGCTATCAGCAAATGCATATGCTTTCCGCGCAAAATAATACTGACTACAAGCGGATGCTGCGTATTTTCCAGGAGGCGCTGGATTTACAGGAACATA > NC_000913/3486930‑3487526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |