New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 61 (0.560) | 48/598 | 1.1 | 62.2% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | = 2406443 | 37 (0.340) | coding (199/939 nt) | lrhA | DNA‑binding transcriptional dual regulator LrhA |
GCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289819‑2290113 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ACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACTGAACATGGCATTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTCAATCGCGTGAGTTCGGTTTATCCGAACTTAGCGCTGGATGTCCGCGTTAAACGTAATGCCTATATGGCAGAAATGCTGGAA > 2:437378/1‑300 ACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACTGAACATGGCATTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTAAATCGCGTGAGTTCGGTTTATCCGAAATTAGCGCTGGATGTCCGCGTTAAGCGTAATGCCTATATGGCAGAACTGCTGGAA > 2:54516/1‑300 ACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACTGAACATGGCATTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTAAATCGCGTGAGTTCGGTTTATCCGAAATTAGCGCTGGATGTCCGCGTTAAACGTAATGCCTATATGGCAGAAATGCTGGAA > 1:319095/1‑300 CTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACTGAACATGGCATTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTAAATCGCGTGAGTTCGGTTTATCCGAAATTAGCGCTGGATGTCCGCGTTAAACGTAATGCCTATATGGCAGAAATGCTGGAATCC > 1:491230/1‑300 CTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATACCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACTGAACATGGCATTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTAAATCGCGTGAGTTCGGTTTATCCGAAATTAGCGCTGGATGTCCGCGTTAAACGTAATGCCTATCTGGCAGAAATGCTGGAATCC > 2:584277/1‑300 GCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACTGAACATGGCATTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTAAATCGCGTGAGTTCGGTTTATCCGAAATTAGCGCTGGATGTCCGCGTTAAACGTAATGCCTATATGGCAGAAATGCTGGAATCCCAGGAAGTGG > 1:432689/1‑300 AACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACTGAACATGGCATTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTAAATCGCGTGAGTTCGGTTTATCCGAAATTAGCGCTGGATGTCCGCGTTAAACGTAATGCCTATATGGCAGAAATGCTGGAATCCAAGGAAGTGGATTTGATGGTAAC > 1:232077/1‑300 TCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACTGAACATGGCCTTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTAAATCGCGTGAGTTCGGTTTATCCGCAATTAGCGCTGGATGTCCGCGTTAAACGTAATGCCTACATGGCAGAAATGCTGGAATCCCAGGAAGTGGATTTGATGGTAACCACCCAT > 1:270413/1‑300 TCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACTGAACATGGCATTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTAAATCGCGTGAGTTCGGTTTATCCGAAATTAGCGCTGGATGTCCGCGTTAAACGTAATGCCTATATGGCAGAAATGCTGGAATCCCAGGAAGTGGATTTGATGGTAACCACCCAT > 1:269959/1‑300 CATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAACTGAACATGGCATTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTAAATCGCGTGAGTTCGGTTTATCCGAAATTAGCGCTGGATGTCCGCGTTAAACGTAATGCCTATATGGCAGAAATGCTGGAATCCCAGGAAGTGGATTTGATGGTAAACACCCATCGT > 1:326263/1‑300 ACTTGTTCGCACCTTCCTTAACTGAACATGGCATTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTAAATCGCGTGAGTTCGGTTTATCCGAAATTAGCGCTGGATGTCCGCGTTAAACGTAATGCCTATATGGCAGAAATGCTGGAATCCCAGGAAGTGGATTTGATGGTAACCACCCATCGTCCTTCAGCGT < 1:144295/300‑1 ACTTGTTCGCACCTCCCTTAACTGAACATGGCATTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTAAATCGCGTGAGTTCGGTTTATCCGAAATTAGCGCTGGATGTCCGCGTTAAACGTAATGCCTATATGGCAGAAATGCTGGAATCCCAGGAAGTGGATTTGATGGTAACCACCCATCGTCCTTCAGCGT < 2:561156/300‑1 TGTTCGCACCTTCCTTAACTGAACATGGCATTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTAAATCGCGTGAGTTCGGTTTANCCGAAATTAGCGCTGGATGTCCGCGTTAAACGTAATGCATATATGGCAGAAATGCTGGAATCCCAGGAAGTGGATTTGATGGTAACCACCCATCGTCCTTCAGCGTTTA > 1:635753/1‑300 CGCACCTTCCTTAACTGAACATGGCATTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTAAATCGCGTGAGTTCGGTTTATCCGAAATTAGCGCTGGATGTCCGCGTTAAACGTAATGCCTATATGGCAGAAATGCTGGAATCCCAGGAAGTGGATTTGATGGTAACCACCCATCGTCCTTCAGCGTTTAAGGC < 1:335446/300‑1 TTCCTTAACTGAACATGGCATTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTAAATCGCGTGAGTTCGGTTTATCCGAAATTAGCGCTGGATGTCCGCGTTAAACGTAATGCCTATATGGCAGAAATGCTGGAATCCCAGGAAGTGGATTTGATGGTAACCACCCATCGTCCTTCAGCGTTTAAGGCATTGAA > 1:305382/1‑300 TTCCTTAACTGAACATGGCACTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTAACTTTCCTGTTAAATCGCGTGAGTTCGGTTTATCCGAAATTAGCGCTGGATGTCCGCGTTAAACGTCATGCCTATATGGCAGAAATGCTGGAATCCCAGGAAGTGGATTTGATGGTAACCACTCATCGTCCTTCAGCGTTTACGGCATTGAA > 2:152876/1‑300 TCCTTAACTGAACACGCCATTCAACTTCTTGGTTACGCCATGAAAATCCTGCGTTTTAATGATTAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTTCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTAAATCGCGTGATTTCGGTTTATCCGAAATTAGCGCTGGATGTCCGCGTTAAACGTAATGCCTATATGGCAGAAATGCTGGAATCCCAGGAAGTGGATTTGATGGTAACCACCCATCGTCCTTCAGCGTTTAAGGCATTGAAC < 2:300514/300‑1 CCTTAACTGAACATGGCATTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGAGGCCTGCGCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTAAATCGCGTGAGTTCGGTTTATCCGAAATTAGCGCTGGATGTCCGCGTTAAACGTAATGCCTATATTGCAGAAATGCTGGAATCCCAGGAAGTGGATTTGATGGTAACCACCCATCGTCCTTCAGCGTTTAAGGCATTGAACC < 1:371345/300‑1 GCGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289819‑2290113 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAACTGAACATGGCATTCAACTTCTTGGTTACGCCAGGAAAATCCTGCGTTTTAATGATGAGGCCTGCTCATCATTAATGTTCAGTAATCTTCAGGGCGTATTAACTATCGGTGCTTCAGATGAATCTGCCGATACGATCTTACCTTTCCTGTTAAATCGCGTGAGTTCGGTTTATCCGAAATTAGCGCTGGATGTCCGCGTTAAACGTAATGCCTATATGGCAGAAATGCTGGAATCCCAGGAAGTGGATTTGATGGTAACCACCCATCGTCCTTCAGCGTTTAAGGCATTGAACC < NC_000913/2406443‑2406146 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |