| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ? | NC_000913 | = 738757 | 211 (1.950) | coding (666/762 nt) | ybfD | H repeat‑associated putative transposase YbfD | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCACGAATGCTCATTTTGGCTGACAAACCAGCTCGTATCTCCTCGCGCTCAGACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/270838‑270541‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aACTGTCATGCTTGGGATTATTTAATTCTTTCAGCGGAAATTTTTCCTCGAAGGCTTTATTTAGCCGCCCCTGGTTTCCTTTTACAGCGAATAAATAATCACCTCCCTGTTTTTGTATCTTCTCTGCAATATCTTTCTGGCAACCCATCGCATCGGTTTTGATGATTTTTCCTTTAATATCCAGCATGTTAAGAAGTTCAGGGATAGCTGTGATCTCATTGGATTTCTTATCCGTCTTGATCTGTCCGATGACCAGACTGTGCATTGTTGAGAACGCACTAATGACATGAATCG < NC_000913/738757‑738465 GCACGAATGCTCATTTTGGCTGACAAACCAGCTCGTATCTCCTCGCGCTCAGACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAC < 1:244226/300‑1 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ACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACTGTCATGCTTTGGATTATTTAATTCTTTCAGCGGAAATTTTTCCTCGAAGGCTTTATTTAGCCGCCCCTGGTTTCCTTTTACAGCGAATAAATAATCACCTCCCTGTTTTTGTATCTTCTCTGCAATATCTTTCTGGCAACCCATCGCATCGGTTTTGATGATTTTTCCTTTAATATCCAGCATGTTAAGAAGTTCAGGGATAGCTGTGATCTCATTGGATTTCTTATCCGTCTTGATCTGTCCGATGACCAGACTGTGCATTGT < 1:240712/300‑1 CTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACTGTCATGCTTGGGATTATTTAATTCTTTCAGCGGAAATTTTTCCTCGAAGGCTTTATTTAGCCGCCCCTGGTTTCCTTTTACAGCGAATAAATAATCACCTCCCTGTTTTTGTATCTTCTCTGCAATATCTTTCTGGCAACCCATCGCATCGGTTTTGATGATTTTTCCTTTAATATCCAGCATGTTAAGAAGTTCAGGGATAGCTGTGATCTCATTGGATTTCTTATCCGTCTTGATCTGTCCGATGACCAGACTGTGCATTGTTGAGAA > 1:441531/1‑300 TGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAACTGTCATGCTTGGGATTATTTAATTCTTTCAGCGGAAATTTTTCCTCGAAGGCTTTATTTAGCCGCCCCTGGTTTCCTTTTACAGCGAATAAATAATCACCTCCCTGTTTTTGTATCTTCTCTGCAATATCTTTCTGGCAACCCATCGCATCGGTTTTGATGATTTTTCCTTTAATATCCAGCATGTTAAGAAGTTCAGGGATAGCTGTGATCTCATTGGATTTCTTATCCGTCTTGATCTGTCCGATGACCAGACTGTGCATTGTTGAGAAC < 1:677846/300‑1 GACCAATTGAATCTACAACTGTCATGCTTGGGATTATTTAATTCTTTCAGCGGAAATTTTTCCTCGAAGGCTTTATTTAGCCGCCCCTGGTTTCCTTTTACAGCGAATANATAATCACCTCCCTGTTTTTGTATCTTCTCTGCAATATCTTTCTGGCAACCCATCGCATCGGTTTTGATGATTTTTCCTTTAATATCCAGCATGTTAAGAAGTTCAGGGATAGCTGTGATCTCATTGGATTTCTTATCCGTCTTGATCTGTCCGATGACCAGACTGTGCATTGTTGAGAACGCACTAATG < 1:636218/300‑1 ATCTACAACTGTCATGCTTGGGATTATTTAATTCTTTCAGCGGAAATTTTTCCTCGAAGGCTTTATTTAGCCGCCCCTGGTTTCCTTTTACAGCGAATAAATAATCACCTCCCTGTTTTTGTATCTTCTCTGCAATATCTTTCTGGCAACCCATCGCATCGGTTTTGATGATTTTTCCTTTAATATCCAGCATGTTAAGAAGTTCAGGGATAGCTGTGATCTCATTGGATTTCTTATCCGTCTTGATCTGTCCGATGACCAGACTGTGCATTGTTGAGAACGCACTAATGACATGAATCG > 2:874844/1‑300 GCACGAATGCTCATTTTGGCTGACAAACCAGCTCGTATCTCCTCGCGCTCAGACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/270838‑270541‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aACTGTCATGCTTGGGATTATTTAATTCTTTCAGCGGAAATTTTTCCTCGAAGGCTTTATTTAGCCGCCCCTGGTTTCCTTTTACAGCGAATAAATAATCACCTCCCTGTTTTTGTATCTTCTCTGCAATATCTTTCTGGCAACCCATCGCATCGGTTTTGATGATTTTTCCTTTAATATCCAGCATGTTAAGAAGTTCAGGGATAGCTGTGATCTCATTGGATTTCTTATCCGTCTTGATCTGTCCGATGACCAGACTGTGCATTGTTGAGAACGCACTAATGACATGAATCG < NC_000913/738757‑738465 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |