| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 3,350,539 | IS1 (+) +9 bp | intergenic (‑80/‑30) | elbB ← / → arcZ | low activity glyoxalase ElbB/small regulatory RNA ArcZ |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 3350539 = | 0 (0.000) | 108 (1.030) | 73/598 | 0.2 | 100% | intergenic (‑80/‑38) | elbB/arcZ | low activity glyoxalase ElbB/small regulatory RNA ArcZ |
| ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
ATTCGTGCCGCTTCAATCAGCACATTGCGCGTTTCCGTCATCGCTTCGCCAGTTAAATGGTTGATAACATCAACCTGCTGCTTATCCGGTGCAAAGCAGACCGCCTGCGCACCGCTGCGTGAAATAGCTAACAACGTCAACACCGCTTCATGAATTTCAGAACCGTCATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATT‑CATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGGCGCAGCCAAGATTTCCCTGGTGTTGGCGCAGTATTCGCGCACCCCGGTCTAGCCGGGGTCATTTTTTAGTGGCTTTTGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG > NC_000913/3350251‑3350841 | acgcactatggcgacgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCATGTAACaaa > 1:124174‑M1/290‑300 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gTCATCGCTTCGCCAGTTAAATGGTTGATAACATCAACCTGCTGCTTATCCGGTGCAAAGCAGACCTCCTGCGCACCGCTGCCTGAAATAGCTAACAACGTCAACACCGCTTCATGAATTTCAGAACCGTCATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATT‑CATGTAACAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtg > 2:729518‑M2/1‑261 (MQ=255) ccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAAc < 1:174357‑M1/54‑1 (MQ=255) tCGCCAGTTAAATAGTTGATAACATCAACCTGCTGCTTATCCGGTGCAAAGCAGACCGCCTGCGCACCGCTGCGTGAAATAGCTAACAACGTCAACACCGCTTCATGAATTTCAGAACCGTCATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATT‑CATGTAACAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttttttagg > 2:315826‑M2/1‑252 (MQ=255) 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ATTCGTGCCGCTTCAATCAGCACATTGCGCGTTTCCGTCATCGCTTCGCCAGTTAAATGGTTGATAACATCAACCTGCTGCTTATCCGGTGCAAAGCAGACCGCCTGCGCACCGCTGCGTGAAATAGCTAACAACGTCAACACCGCTTCATGAATTTCAGAACCGTCATAGACGCCGCATCCGCTCAGAATTACGCCAATTTTCTTCATTGTGATCATCCTTTCGCAATTGACTGAAACACATTAATTTTTTTAATAAAAATGGTACGCATCACACATTTAACTGATT‑CATGTAACAAATCATTTAAGTTTTGCTATCTTAACTGCGTGCGGCCTGAAAAACAGTGCTGTGCCCTTGTAACTCATCATAATAATTTACGGCGCAGCCAAGATTTCCCTGGTGTTGGCGCAGTATTCGCGCACCCCGGTCTAGCCGGGGTCATTTTTTAGTGGCTTTTGCCACCCACGCTTTCAGCACTTCTACGTCGTGACGCCACTCTTCTTTCATCTCTTCAATCCATTCACCGACGTTATCTTCCCAGGCCGGAAGGTCAGGAGACTGAATTTGCTGACCCAGCTGTTGCAGATGGCG > NC_000913/3350251‑3350841 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |