| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 3631216 | 201 (1.910) | 46 (0.440) | 36/598 | 2.0 | 18.6% | coding (1375/1623 nt) | yhiJ | DUF4049 domain‑containing protein YhiJ |
| ? | NC_000913 | 3652036 = | NA (NA) | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
CAACAGTCTCAACCAGATAGTAACATTAATATTCATGTTGTCTATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAAATAACGATTAAAGGATCGACAAGAGATAGCCCGGCTAGTTTTAAACTTTTTGCCATTAATTATAGCATGATGCTTTTTATTGATAATTGCCGCTAATTCGACCGGATCGAGAGCATTGGTCATTTCATCAATAGAGACTGTTATCGGTCCTATAATGTAACGTTTTCGCTGATCATCAAAAGTTATCCCATGATGATTTGCCATTATTTTGTATTTGGGGTCATAGAAACATACAGGAT > NC_000913/3630920‑3631515 | gTCTCAACCAGATAGTAACATTAATATTCATGTTGTCTATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCTATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTACAATTtgtg > 2:330576/1‑300 (MQ=255) 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ataCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTNTCGAAACAGAAAAATAACGATTAAAGGCTCGACAAGAGATAGCCCGGCTAGTTTTAAACTTTTTGCCATTAATTATAGCATGATGCTTTTTATTGATAATTGCCGCTAATTCGACCGGATCGAGAGCATTGGTCATTTCATCAATAGAGACTGTTATCGGTCCTATAATGTAACGTTTTCGCTGATCATCAAAAGTTATCCCATGATGATTTGCCATTATTTTGTATTTGGGGTCATAGAAACAt < 2:644412/300‑1 (MQ=255) aCCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAAATAATGATTAAAGGATCGACAAGAGATAGCCCTGCTAGTTTTAAACTTTTTGCCATTAATTATAGCATGATGCTTTTTATTGATAATTGCCGCTAATTCGACCGGATCGAGAGCATTGGTCATTTCATCAATAGAGACTGTTATCGGTCCTATAATGTAACGTTTTCGCTGATCATCAAAAGTTATCCCATGATGATTTGCCATTATTTTGTATGTGGGGTCATAGAAACATAc < 2:453774/300‑1 (MQ=255) tAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAAATAACGATTAAAGGATCGACAAGAGATAGCCCGGCTAGTTTTAAACTTTTTGCCATTAATTATAGCATGATGCTTTTTATTGATAATTGCCGCTAATTCGACCGGATCGAGAGCATTGGTCATTTCATCAATAGAGACTGTTATCGGTCCTATAATGTAACGTTTTCGCTGATCATCAAAAGTTATCCCATGATGATTTGCCATTATTTTGTATTTGGGGTCATAGAAACATACAgg < 1:225574/300‑1 (MQ=255) | CAACAGTCTCAACCAGATAGTAACATTAATATTCATGTTGTCTATGGTTCAGAGCTGTAACATTGTGCGCCTTCTAATCAAAGGCATAAGTCCATTTCTGTTTTTTTCATGCTGGTAAGACTTCCAGGGAGTGGTTATCTCAGGCCCTGCACCAGGGTTAATTTGGCAATTATGCATGCTGAACATTCTTCCAGCATGTTTACTGTCACGGGCGTTAAGACCTAAAACTGTCCCCGTTTCGCCTATGCGTTCTCTTCCACCATTTCCGTTATGTGCAACAACTTGATTTATACCTAACATTTGTGAACATGCTAATAGTGCTTCAAGTTTAGGTCTGTAATCTGTCGAAACAGAAAAATAACGATTAAAGGATCGACAAGAGATAGCCCGGCTAGTTTTAAACTTTTTGCCATTAATTATAGCATGATGCTTTTTATTGATAATTGCCGCTAATTCGACCGGATCGAGAGCATTGGTCATTTCATCAATAGAGACTGTTATCGGTCCTATAATGTAACGTTTTCGCTGATCATCAAAAGTTATCCCATGATGATTTGCCATTATTTTGTATTTGGGGTCATAGAAACATACAGGAT > NC_000913/3630920‑3631515 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |