| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| MC JC | NC_000913 | 3,678,269 | Δ42,364 bp | IS150‑mediated | [yhjG]–hokA | 36 genes [yhjG], pdeH, kdgK, yhjJ, dctA, pdeK, bcsC, bcsZ, bcsB, bcsA, yhjR, bcsE, bcsF, bcsG, ldrD, rdlD, yhjV, dppF, dppD, dppC, dppB, dppA, proK, eptB, yhjX, yhjY, tag, yiaC, bisC, yiaD, ghrB, yiaF, yiaG, cspA, ysaE, hokA |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3678269 | 3720632 | 42364 | 88 [0] | [1] 89 | [yhjG]–hokA | [yhjG],pdeH,kdgK,yhjJ,dctA,pdeK,bcsC,bcsZ,bcsB,bcsA,yhjR,bcsE,bcsF,bcsG,ldrD,rdlD,yhjV,dppF,dppD,dppC,dppB,dppA,proK,eptB,yhjX,yhjY,tag,yiaC,bisC,yiaD,ghrB,yiaF,yiaG,cspA,ysaE,hokA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3678268 | 0 (0.000) | 88 (0.850) | 62/596 | 0.4 | 100% | coding (83/2061 nt) | yhjG | AsmA family protein YhjG |
| ? | NC_000913 | 3720633 = | NA (NA) | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
AATCGATCGCGTAATAAAATCTATTATTATTTTTGTGAAGAATAAATTTGGGTGCAATGAGAATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGACTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCTAAAAACGCCGCCAGCTCATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAAGCGTGAAACAAATCACTATTAAAGAAAGTAATCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTGTTGATTTCCAACGAGTATGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGAAAGCTGTGATCGAGCAGCACATGTCCCTTAATCA > NC_000913/3720338‑3720930 | ggcttttcgagcttgatccacggcagccagaccgttttggtcagcagcgccagcggggccagcgttgcctctacgcgtggcaaatgcaccatcgtgacttcgggaatatccggtggattgccaagaatgatgtcttccgcgtgtacatggggccacggcacccagctgcgccagcnagtttcttgtttttgccgctcccacaccacgcccagatcgccacggatagcgaacggacgattcaactccgcagagactttctggttgatagncggtttgagtcgattccagtcaaaagTGTAc < 2:622741‑M2/5‑1 (MQ=255) 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caTGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCAAAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCACAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGAAAGCTGTGATCGAGCAGCACATGTCAATTAATCa > 2:393496/2‑300 (MQ=255) | AATCGATCGCGTAATAAAATCTATTATTATTTTTGTGAAGAATAAATTTGGGTGCAATGAGAATGCGCAACGCCGTAAGTAAGGCGGGAATAATTTCCCGCCGAAGACTCTTACTCTTTCAATTTGCAGGCTAAAAACGCCGCCAGCTCATAACTCTCCTGTTTAATATGCAATTCACACAGTGAATCTCTTATCATCCAGGTGAAAAATAAAAGCGTGAAACAAATCACTATTAAAGAAAGTAATCTATATTTCTGCGGCATTCCCAGCCTCCTGTGTTGATTTCCAACGAGTATGTACTGCACCCATTTTGTTGGACGATGAAATGGAATAGCCCCTAATATGTCAAAGCCAAAATACCCTTTTGAAAAGCGCCTTGAAGTCGTGAATCACTACTTCACAACTGATGATGGTTACAGGATCATCTCGGCACGTTTTGGTGTCCCCCGAACCCAGGTCAGGACATGGGTTGCCCTCTATGAAAAACATGGAGAAAAAGGTTTAATTCCCAAACCTAAAGGCGTTAGTGCTGATCCAGAGTTGCGTATTAAGGTCGTGAAAGCTGTGATCGAGCAGCACATGTCCCTTAATCA > NC_000913/3720338‑3720930 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |