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GAGTCATTACCTACCAATGATAAATATATATGGGATTACGTTAATGATTTAGTAGAATTTAATCGTTTTACTAATTCTCCACTGGCGATTTATAAAGACAAATTATTCAACCTTCCTTTTAATATGAATACTTTCCACCAAATGTGGGGAGTTAAAGATCCTCAAGAAGCTCAAAATATCATTAATGCTCAGAAAAAAAAGTATGGTGACAAGGTACCTGAAAATTTGGAGGAGCAGGCGATTTCATTAGTTGGGGAGGACTTATACCAAGCATTGATAAAGGGTTATACGGAGAAGCAG < 1:8676/300‑1 CATTACCTACCAATGATAAATATATATGGGATTACGTTAATGATTTAGTAGAATTTAATCGTTTTACTAATTCTCCACTGGCGATTTATAAAGACAAATTATTCAACCTTCCTTTTAATATGAATACTTTCCACCAAATGTGGGGAGTTAAAGATCCTCAAGAAGCTCAAAATATCATTAATGCTCAGAAAAAAAAGTATGGTGACAAGGTACCTGAAAATTTGGAGGAGCAGGCGATTTCATTAGTTGGGGAGGACTTATACCAAGCATTGATAAAGGGTTATACGGAGAAGCAGTGGG > 1:752586/1‑300 TTACCTACCAATGATAAATATATATGGGATTACGTTAATGATTTAGTAGAATTTAATCGTTTTACTAATTCTCCACTGGCGATTTATAAAGACAAATTATTCAACCTTCCTTTTAATATGAATACTTTCCACCAAATGTGGGGAGTTAAAGATCCTCAAGAAGCTCAAAATATCATTAATGCTCAGAAAAAAAANTATGGTGACAAGGTACCTGAAAATTTGGAGGAGCAGGCGATTTCATTAGTTGGGGAGGACTTATACCAAGCATTGATAAAGGGTTATACGGAGAAGCAGTGGGGA > 2:751629/1‑300 TTACCTACCAATGATAAATATATATGGGATTACGTTAATGATTTAGTAGAATTTAATCGTTTTACTAATTCTCCACTGGCGATTTATAAAGACAAATTATTCAACCTTCCTTTTAATATGAATACTTTCCACCAAATGTGGGGAGTTAAAGATCCTCAAGAAGCTCAAAATATCATTAATGCTCAGAAAAAAAAGTATGGTGACAAGGTACCTGAAAATTTGGAGGAGCAGGCGATTTCATTAGTTGGGGAGGACTTATACCAAGCATTGATAAAGGGTTATACGGAGAAGCAGTGGGGA > 2:664009/1‑300 TTACCTACCAATGATAAATATATATGGGATTACGTTAATGATTTAGTAGAATTTAATCGTTTTACTAATTCTCCACTGGCGATTTATAAAGACAAATTATTCAACCTTCCTTTTAATATGAATACTTTCCACCAAATGTGGGGAGTTAAAGATCCTCAAGAAGCTCAAAATATCATTAATGCTCAGAAAAAAAAGTATGGTGACAAGGTACCTGAAAATTTGGAGGAGCAGGCGATTTCATTAGTTGGGGAGGACTTATACCAAGCATTGATAAAGGGTTATACGGAGAAGCAGTGGGGA > 1:422770/1‑300 ACCTACCAATGATAAATATATATGGGATTACGTTAATGATTTAGTAGAATTTAATCGTTTTACTAATTCTCCACTGGCGATTTATAAAGACAAATTATTCAACCTTCCTTTTAATATGAATACTTTCCACCAAATGTGGGGAGTTAAAGATCCTCAAGAAGCTCAAAATATCATTAATGCTCAGAAAAAAAAGTATGGTGACAAGGTACCTGAAAATTTGGAGGAGCAGGCGATTTCATTAGTTGGGGAGGACTTATACCAAGCATTGATAAAGGGTTATACGGAGAAGCAGTGGGGAAG < 1:15263/300‑1 CACTATGGCGACGCTGGGGCGTCTTATGAGCCTGCTGTCACCCTTTGACGTGGTGATATGGATGACGGATGGCTGGCCGCTGTATGAATCCCGCCTGAAGGGAAAGCTGCACGTAATCAGCAAGCGATATACGCAGCGAATTGAGCGGCATAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1978788‑1978503‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCAATGATAAATATATATGGGATTACGTTAATGATTTAGTAGAATTTAATCGTTTTACTAATTCTCCACTGGCGATTTATAAAGACAAATTATTCAACCTTCCTTTTAATATGAATACTTTCCACCAAATGTGGGGAGTTAAAGATCCTCAAGAAGCTCAAAATATCATTAATGCTCAGAAAAAAAAGTATGGTGACAAGGTACCTGAAAATTTGGAGGAGCAGGCGATTTCATTAGTTGGGGAGGACTTATACCAAGCATTGATAAAGGGTTATACGGAGAAGCAGTGGGGAAGA < NC_000913/2108153‑2107856 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |