| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 544,112 | G→T | A394D (GCC→GAC) | allC ← | allantoate amidohydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 544,112 | 0 | G | T | 99.1% | 394.2 / NA | 108 | A394D (GCC→GAC) | allC | allantoate amidohydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (49/58); total (49/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
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gTGCCAACGTTTTGACCCCTTCGTCAAGGTCGGTAATATTGGTGCGTTCCGCCGGGTTATGGCTGATCCCGTTGATGCTGGGGATAAAAATCATGCAGGTTGGTACGCGAGGCGCGAAAATTTGCGCGTCGTGCCCGGCACCACTGTGCATCACCCGGTAATTCAGTTTTTCTCTTTCACACAATTCTGTNAGGGTGGCGACCAGCTCCTTATTCATCGGCACGGGTTCTTCGTCCATCCATAAATCGATATCAATACCAATGTCCATTTCATCGCAAATCGCCCGCATGTCGTTTTCTa > 1:303451/1‑300 (MQ=255) cAACGTTTTGACCCCTTCGTCAAGGTCGGTAATATTGGTGCGTTCCGCCGGGTTATGGCTGATCCCGTTGATGCTGGGGATAAAAATCATGCAGGTTGGTACGCGAGGCGCGAAAATTTGCGCGTCGTGCCCGGCACCACTGTGCATCACCCGGTAATTCAGTTTTTCTCTTTCACACAATTCTGTCAGGGTGGCGACCAGCTCCTTATTCATCGGCACGGGTTCTTCGTCCATCCATAAATCGATATCAATACCAATGTCCATTTCATCGCAAATCGCCCGCATGTCGTTTTCTAACTg < 1:660250/300‑1 (MQ=255) ccccTTCTTCAAGGTCGGTAATATTGGTGCGTTCCGCCGGGTTATGGCTGATCCCGTTGATGCTGGGGATAAAAATCATGCAGGTTGGTACGCGAGGCGCGAAAATTTGCGCGTCGTGCCCGGCACCACTGTGCATCACCCGGTAATTCAGTTTTTCTCTTTCACACAATTCTGTCAGGGTGGCGACCAGCTCCTTATTCATCGGCACGGGTTCTTCGTCCATCCATAAATCGATATCAATACCAATGTCCATTTCATCGCAAATCGCCCGCATGTCGTTTTCTAACTGTTGGGTGAAAt < 1:474906/300‑1 (MQ=255) | GAAGCCCTGTTGGTTGCCACCGTTTTGATGCAGTGTGACCAGATAATCAACAAAAGAGGCACCCAGCTTTGGCGTGGAGAGGATTGTCGCGTCACAATTTTCAAAGCCCGGAATAATATTTTTTACCAGACCATCCGGGGTTAACAGTGCGAAATTACCGTGTTTAACAATCGCACGGTTAGCCAGTAAATCTTCGCGGTAACCGGTGACGTTATTTAAATATCCCATTTATGACTCCTTATTTCTGCCAGGCAAGTTGATAAAGCATGAGTGCCAACGTTTTGACCCCTTCGGCAAGGTCGGTAATATTGGTGCGTTCCGCCGGGTTATGGCTGATCCCGTTGATGCTGGGGATAAAAATCATGCAGGTTGGTACGCGAGGCGCGAAAATTTGCGCGTCGTGCCCGGCACCACTGTGCATCACCCGGTAATTCAGTTTTTCTCTTTCACACAATTCTGTCAGGGTGGCGACCAGCTCCTTATTCATCGGCACGGGTTCTTCGTCCATCCATAAATCGATATCAATACCAATGTCCATTTCATCGCAAATCGCCCGCATGTCGTTTTCTAACTGTTGGGTGAAATCG > NC_000913/543819‑544405 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |