Predicted mutation | ||||||
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JC JC | NC_000913 | 1,909,411 | IS2 (+) +5 bp | coding (685‑689/792 nt) | kdgR ← | DNA‑binding transcriptional repressor KdgR |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 1909415 | 12 (0.130) | 69 (0.740) | 48/598 | 0.8 | 85.0% | coding (685/792 nt) | kdgR | DNA‑binding transcriptional repressor KdgR |
? | NC_000913 | = 2070271 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
GAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTGGCGAAGCATCCTCCCGTGTTTTAATTCTCATTGATGGTCAGGAGGTAACTTATCAGCGCGCCGGAGATAATTATGGTGTGGGACTGTTGATAGATGAGTCTGCGCTGGAGCGTGTTGAGGTAGTGAAAGGTCCATATTCCGTACTGTACGGTTCACAGGCAATTGGCGGTATTGTTAACTTCATCACCAAAAAGGGTGAATCTCCGGACTCCCTATATCACTTAAATTGATACAACTTTTTAGAGTAGTCATTAGTGAACAGATAATTGATAACTCAGAACCAGTAAAATGC > NC_000913/2069976‑2070566 | gAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAGTgg < 1:23735/300‑1 (MQ=11) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |